| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 280,366 | C→A | intergenic (‑491/+19) | insA‑2 ← / ← yagB | IS1 protein InsA/orphan antitoxin YagB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 280,366 | 0 | C | A | 99.5% | 663.9 / ‑4.9 | 187 | intergenic (‑491/+19) | insA‑2/yagB | IS1 protein InsA/orphan antitoxin YagB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (79/107); total (80/107) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.28e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
TTCTTTATCCAGGCATAAAGGCTGTGGGTGGTGATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGCACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGCCCGTTACGGTACAGTGTGACA > NC_000913/280229‑280502 | ttcttTATCCAGGCATAAAGGCTGTGGGTGGTGATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAAc < 1:192677/140‑1 (MQ=255) cttTATCCAGGCATAAAGGCTGTGGGTGGTGATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACct < 2:1241613/140‑1 (MQ=255) cttTATCCAGGCATAAAGGCTGTGGGTGGTGATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACct < 2:1116035/140‑1 (MQ=255) cttTATCCAGGCATAAAGGCTGTGGGTGGTGATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACct < 1:424789/140‑1 (MQ=255) cttTATCCAGGCATAAAGGCTGTGGGTGGTGATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACct < 1:1671566/140‑1 (MQ=255) tCCAGGCATAAAGGCTGTGGGTGGTGATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGCACCTCTCtt > 1:1302118/1‑140 (MQ=255) aGGCATAAAGGCTGTGGGTGGTGATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTaa > 2:1393070/1‑140 (MQ=255) gggaTAAAGGCTGTGGGTGGTGATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAg < 1:1178049/137‑1 (MQ=255) ggCATAAAGGCTGTGGGTGGTGATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAg < 1:765900/140‑1 (MQ=255) ggCATAAAGGCTGTGGGTGGTGATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAg < 2:183119/140‑1 (MQ=255) gCATAAAGGCTGTGGGTGGTGATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAg < 1:368805/139‑1 (MQ=255) gCATAAAGGCTGTGGGTGGTGATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAg > 2:368805/1‑139 (MQ=255) gCATAAAGGCTGTGGGTGGTGATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGc > 2:1648694/1‑140 (MQ=255) gCATAAAGGCTGTGGGTGGTGATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGc > 2:1058625/1‑140 (MQ=255) cTGTGGGTGGTGATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTaaa < 1:1197735/140‑1 (MQ=255) tgtgGGTGGTGATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCa > 2:1351332/1‑132 (MQ=255) tgtgGGTGGTGATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCa < 1:1351332/132‑1 (MQ=255) tgtgGGTGGTGATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAAt > 2:1149230/1‑140 (MQ=255) tgggt‑gtGATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGAc > 2:1569222/1‑140 (MQ=255) gtgATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCCGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGa < 1:304610/140‑1 (MQ=255) tatCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGgtg > 1:551970/1‑140 (MQ=255) tCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGgtg > 1:1130562/1‑138 (MQ=255) aCGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTa > 2:724118/1‑140 (MQ=255) gtgtTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCg < 1:804823/125‑1 (MQ=255) ttGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAAccc > 2:637411/1‑140 (MQ=255) ttGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAAccc > 2:1777502/1‑140 (MQ=255) aaCGCTGGCAACAGAATAACCGATATCATCAGCCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAGCTCTTGGGGATAACGCTTATCTGTCTCGGGCTTCTCTGTTTCATGTATTTTAAATTGCTCGGAGGTGTCTGCTAAAACCGTgg < 2:1302118/140‑1 (MQ=255) aaCGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTgg < 1:911318/140‑1 (MQ=255) gCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGa > 1:1713389/1‑140 (MQ=255) cTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGAt > 2:1506495/1‑140 (MQ=255) gCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCa > 1:519487/1‑140 (MQ=255) aCAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCaaaa < 1:1828358/140‑1 (MQ=255) aGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAAtt < 2:505316/140‑1 (MQ=255) aGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAAtt < 1:249281/140‑1 (MQ=255) aGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAAtt < 1:468176/140‑1 (MQ=255) gAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTg < 1:708640/140‑1 (MQ=255) gAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTg < 2:91013/140‑1 (MQ=255) gAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTg < 1:1459660/140‑1 (MQ=255) aTAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCg < 2:1672777/140‑1 (MQ=255) aTAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCg < 2:302507/140‑1 (MQ=255) tAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGa < 1:1506495/140‑1 (MQ=255) aaCCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGc < 2:31006/137‑1 (MQ=255) aaCCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGat < 2:567632/140‑1 (MQ=255) aaCCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGat < 2:443456/140‑1 (MQ=255) aaCCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGat < 1:1594026/140‑1 (MQ=255) aCCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGata < 1:575793/140‑1 (MQ=255) aCCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGata < 2:751224/140‑1 (MQ=255) agaTCAACTACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGAtatata > 2:1161713/1‑140 (MQ=255) gaTCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATatac < 1:1252766/140‑1 (MQ=255) gaTCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATatac < 1:724118/140‑1 (MQ=255) aTCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGat > 1:1246581/1‑133 (MQ=255) aTCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATataca > 1:674530/1‑140 (MQ=255) aTCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATataca > 1:746212/1‑140 (MQ=255) acaacCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATAcc < 2:535606/140‑1 (MQ=255) caacCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATAcc > 2:1208006/1‑139 (MQ=255) caacCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCACTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGa < 2:965053/127‑1 (MQ=255) ccTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATatac < 1:889639/131‑1 (MQ=255) ccTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATatac > 2:889639/1‑131 (MQ=255) ccTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATg > 1:1149912/1‑140 (MQ=255) ccTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATg > 1:1556061/1‑140 (MQ=255) tGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGAc > 2:1047491/1‑140 (MQ=255) tttGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTg > 1:5361/1‑140 (MQ=255) tttGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTg > 1:1783758/1‑140 (MQ=255) tttGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTg > 2:1373783/1‑140 (MQ=255) gACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGccc > 2:1011288/1‑140 (MQ=255) gCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCg > 2:1192040/1‑140 (MQ=255) cTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGccc < 2:978403/135‑1 (MQ=255) tCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTAt > 2:143798/1‑140 (MQ=255) tCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTAt > 2:1737049/1‑140 (MQ=255) tCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTAt > 1:1580914/1‑140 (MQ=255) tCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTAt > 2:1708935/1‑140 (MQ=255) gTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCgg < 2:969957/140‑1 (MQ=255) ctTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGt < 1:1047491/140‑1 (MQ=255) ctTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGt < 1:1808388/140‑1 (MQ=255) ttCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTc > 2:1321165/1‑140 (MQ=255) ttCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTc > 1:1767725/1‑140 (MQ=255) ttCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTc > 1:814242/1‑140 (MQ=255) ggATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGcc < 2:1723298/140‑1 (MQ=255) ggATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGcc < 1:1373783/140‑1 (MQ=255) ggATAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGcc < 1:1708469/140‑1 (MQ=255) aTAACGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGCCCg < 1:172874/140‑1 (MQ=255) aaCGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCTGTCAGCCCGtt > 1:199834/1‑140 (MQ=255) cGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGCCCGTTAc > 2:257185/1‑140 (MQ=255) cGCTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGCCCGTTAc > 2:1711820/1‑140 (MQ=255) cTTACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGCCCGTTACgg < 1:588242/140‑1 (MQ=255) tACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCTGTCAGCCCGTTACGGTa < 2:199834/140‑1 (MQ=255) tACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGCCCGTTACGGTa < 1:949707/140‑1 (MQ=255) tACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGCCCGTTACGGTa < 1:1011288/140‑1 (MQ=255) tACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGCCCGTTACGGTa < 1:1209372/140‑1 (MQ=255) tACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGCCCGTTACGGTa < 2:814242/140‑1 (MQ=255) tACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGCCCGTTACGGTa < 1:143798/140‑1 (MQ=255) tACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGCCCGTTACGGTa < 2:746212/140‑1 (MQ=255) tACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGCCCGTTACGGTa < 2:674530/140‑1 (MQ=255) tACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGCCCGTTACGGTa < 2:341294/140‑1 (MQ=255) tACCGCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGCCCGTTACGGTa < 1:975387/140‑1 (MQ=255) gCTCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGCCCGTTACGGTACAgt < 2:1260884/140‑1 (MQ=255) tCATGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGCCCGTTACGGTACAgtgt > 1:1190454/1‑140 (MQ=255) tGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGCCCGTTACGGTa > 1:1104162/1‑131 (MQ=255) tGGGAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGCCCGTTACGGTACAGTGTGac < 2:920003/140‑1 (MQ=255) gggAACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGCCCGTTACGGTACAGTGTGaca < 2:1125071/140‑1 (MQ=255) | TTCTTTATCCAGGCATAAAGGCTGTGGGTGGTGATATCGAGACGTGTTGCAACGCTGGCAACAGAATAACCGAGATCAACAACCTGTTTGACTGCTTCAGTTTTAAACTCTTCGGGATAACGCTTACCGCTCATGGGCACCTCTCTTTAAGCCATTTTAAATGACTCGGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGGCGATTCAAAATTGCGATATATACATACCCATGACTGCCCAGCGTATCGGCTTCACCAGTCAGCCCGTTACGGTACAGTGTGACA > NC_000913/280229‑280502 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |