Predicted mutation | ||||||
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JC | NC_000913 | 1,584,358 | Δ17 bp | coding (2113‑2129/2280 nt) | ydeP ← | putative oxidoreductase YdeP |
New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 1584375 = | 1 (0.010) | coding (2112/2280 nt) | ydeP | putative oxidoreductase YdeP |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
TTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATAGGTCACCAGTGAGCGGTCAGCCATAGGGTAAATGACCACTTTTAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1584219‑1584357 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAGCGATCATCCATAC > NC_000913/1584375‑1584511 TTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATAGGTCACCAGTGAGCGGTCAGCCATAGGGTAAATGACCACTTTTAATG < 2:74861/140‑1 TCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATAGGTCACCAGTGAGCGGTCAGCCATAGGGTAAATGACCACTTTTAATGC < 1:666091/140‑1 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AATGACCACTTTTAATGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAG > 1:377923/1‑140 AATGACCACTTTTAATGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAG > 2:89911/1‑140 AATGACCACTTTTAATGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAG > 2:948062/1‑140 AATGACCACTTTTAATGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAG > 2:366472/1‑140 AATGACCACTTTTAATGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAG > 2:344435/1‑140 AATGACCACTTTTAATGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAG > 2:332450/1‑140 AATGACCACTTTTAATGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAG > 1:1116348/1‑140 AATGACCACTTTTAATGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTAACCCGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGCCCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAG > 1:728319/1‑140 TGACCACTTTTAATGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATGCCCCTCGATAGCG < 1:77091/140‑1 TGACCACTTTTAATGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAGCG < 1:175498/140‑1 TGACCACTTTTAATGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAGCG < 2:559165/140‑1 TGACCACTTTTAATGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAGCG < 2:1237021/140‑1 TGACCACTTTTAATGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAGCG < 2:131848/140‑1 GACCACTTTTAACGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAGCGA < 1:842094/140‑1 CCACTTTTAATGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAGCGATC > 2:450679/1‑140 CACTTTTAATGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAGCGATCA > 1:1195256/1‑140 ACTTTTAATGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAGCGATCAT < 1:475812/140‑1 ACTTTTAATGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGGTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAGCGATCAT > 1:829968/1‑140 TTTTAATGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAGCGATCATCC < 1:272459/140‑1 AATGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAGCGATCATCCATAC > 2:528504/1‑140 TTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATAGGTCACCAGTGAGCGGTCAGCCATAGGGTAAATGACCACTTTTAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1584219‑1584357 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAGCGATCATCCATAC > NC_000913/1584375‑1584511 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |