Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,453,692 | A→G | intergenic (‑50/‑235) | paaZ ← / → paaA | oxepin‑CoA hydrolase/3‑oxo‑5,6‑dehydrosuberyl‑CoA semialdehyde dehydrogenase/phenylacetyl‑CoA 1,2‑epoxidase, monooxygenase subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,453,692 | 0 | A | G | 100.0% | 508.3 / NA | 131 | intergenic (‑50/‑235) | paaZ/paaA | oxepin‑CoA hydrolase/3‑oxo‑5,6‑dehydrosuberyl‑CoA semialdehyde dehydrogenase/phenylacetyl‑CoA 1,2‑epoxidase, monooxygenase subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (55/76); total (55/76) |
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
CTCGCCGCTAATAGCGTGGTGAATCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGAATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATA > NC_000913/1453556‑1453825 | cTCGCCGCTAATAGCGTGGTGAATCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATc > 2:409649/1‑140 (MQ=255) cTCGCCGCTAATAGCGTGGTGAATCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATc > 2:1671214/1‑140 (MQ=255) cTCGCCGCTAATAGCGTGGTGAATCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATc > 1:1450030/1‑140 (MQ=255) cTCGCCGCTAATAGCGTGGTGAATCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATc > 1:714437/1‑140 (MQ=255) cgcTAATAGCGTGGTGAATCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATaaa < 2:556895/140‑1 (MQ=255) gcTAATAGCGTGGTGAATCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATaaaa < 2:1547491/140‑1 (MQ=255) aTAGCGTGGTGAATCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCa < 1:409649/140‑1 (MQ=255) aTAGCGTGGTGAATCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCa < 2:1246098/140‑1 (MQ=255) aTAGCGTGGTGAATCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCa < 2:1199302/140‑1 (MQ=255) aTAGCGTGGTGAATCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCa < 1:601882/140‑1 (MQ=255) gtggtgAATCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGa > 1:1644308/1‑140 (MQ=255) gtggtgAATCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGa > 2:1158939/1‑140 (MQ=255) gtgAATCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCt > 2:874592/1‑140 (MQ=255) tgAATCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCtt < 1:548250/140‑1 (MQ=255) tgAATCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCtt > 2:144871/1‑140 (MQ=255) aaTCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCtttt > 1:937977/1‑140 (MQ=255) aaTCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCtttt > 2:46561/1‑140 (MQ=255) cAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAAc < 1:651387/140‑1 (MQ=255) cAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAAc < 1:1343755/140‑1 (MQ=255) cAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAAc < 2:980146/140‑1 (MQ=255) aaaCGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGTTCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACg < 1:1224535/140‑1 (MQ=255) aaaCGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACg < 1:1671214/140‑1 (MQ=255) ggCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAAt > 1:486377/1‑140 (MQ=255) ggCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAAt > 2:1579859/1‑140 (MQ=255) cTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAAc < 1:688579/133‑1 (MQ=255) cTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAAc > 2:688579/1‑133 (MQ=255) cTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACg < 2:900950/134‑1 (MQ=255) cTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACg > 1:900950/1‑134 (MQ=255) aCGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTa < 1:144871/140‑1 (MQ=255) aCGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTa > 1:1220558/1‑140 (MQ=255) aCGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTa > 1:544274/1‑140 (MQ=255) cccGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTAt < 1:1579859/140‑1 (MQ=255) cccGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTAt < 2:714437/140‑1 (MQ=255) ggCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCg < 1:1622325/140‑1 (MQ=255) ggCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCg < 1:90154/140‑1 (MQ=255) ggCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCg < 2:1233346/140‑1 (MQ=255) ggCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCg < 1:1158939/140‑1 (MQ=255) ggCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCg < 1:169440/140‑1 (MQ=255) ggCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCg < 2:1644308/140‑1 (MQ=255) ccAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGAt < 1:1224604/140‑1 (MQ=255) ccAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGAt < 2:486597/140‑1 (MQ=255) ccAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGAt < 2:272896/140‑1 (MQ=255) ccAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGAt < 1:168452/140‑1 (MQ=255) ccAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGAt < 1:1544911/140‑1 (MQ=255) ccAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTCTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGAt < 1:880182/140‑1 (MQ=255) cAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATc < 2:1220558/140‑1 (MQ=255) cAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATc < 2:1190909/140‑1 (MQ=255) cAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATc < 1:1102962/140‑1 (MQ=255) gACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTg < 1:204705/140‑1 (MQ=255) aCTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATc > 2:1812813/1‑137 (MQ=255) aCTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATc < 1:804839/137‑1 (MQ=255) aCTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGt > 2:1122319/1‑140 (MQ=255) aGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCa > 2:92313/1‑140 (MQ=255) ggTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGa > 2:924159/1‑128 (MQ=255) ggTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGa < 1:924159/128‑1 (MQ=255) cGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCg > 2:1629169/1‑140 (MQ=255) gATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGa > 2:1527504/1‑140 (MQ=255) gATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGa > 2:209209/1‑140 (MQ=255) gATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGa < 1:987455/140‑1 (MQ=255) aTAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGaa < 2:486377/140‑1 (MQ=255) aaGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGaaaa < 1:1215279/140‑1 (MQ=255) aaGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGaaaa < 1:92313/140‑1 (MQ=255) aGAAACTGGCTAACTGCTTCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAAc > 2:1466221/1‑140 (MQ=255) aGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAAc > 1:134345/1‑140 (MQ=255) gAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGaaaa > 1:1547105/1‑138 (MQ=255) gAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGaaaa < 2:1547105/138‑1 (MQ=255) gAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACa > 2:944634/1‑140 (MQ=255) ggCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATg < 1:944634/140‑1 (MQ=255) ggCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATg > 1:1117074/1‑140 (MQ=255) cTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAGCATTAATGCa < 1:1000513/140‑1 (MQ=255) cTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCa < 2:1404050/140‑1 (MQ=255) cTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCa < 1:1462114/140‑1 (MQ=255) gCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGa < 2:538727/140‑1 (MQ=255) gCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGa < 2:937977/140‑1 (MQ=255) cTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGat > 2:702052/1‑130 (MQ=255) cTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGAt < 2:1333916/140‑1 (MQ=255) aCTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGAttt > 2:581089/1‑140 (MQ=255) ctctCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTta < 1:1122319/140‑1 (MQ=255) ctcCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGAtt < 2:1815497/136‑1 (MQ=255) ctcCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGAtt > 1:1815497/1‑136 (MQ=255) cAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGAtt > 2:1307495/1‑133 (MQ=255) cAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGAtt < 1:1307495/133‑1 (MQ=255) gATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAAt < 1:1606990/140‑1 (MQ=255) aTGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATa > 2:1749394/1‑140 (MQ=255) gTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAgg > 2:900810/1‑140 (MQ=255) ttCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGt > 1:1016058/1‑140 (MQ=255) tCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTg > 2:152496/1‑140 (MQ=255) tCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTg > 1:1319923/1‑140 (MQ=255) acaTTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCg < 1:46561/140‑1 (MQ=255) acaTTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCg < 2:97339/140‑1 (MQ=255) aTTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGaa > 1:657707/1‑140 (MQ=255) ttCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGATGCGAAAt > 2:555595/1‑140 (MQ=255) ttGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTc < 1:209209/140‑1 (MQ=255) tGCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTca < 2:1117074/140‑1 (MQ=255) gCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTcac < 1:1403161/140‑1 (MQ=255) gCTAATAGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTcac > 2:1403161/1‑140 (MQ=255) aGTTAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCa > 1:1290514/1‑140 (MQ=255) ttAAATCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCaaa < 2:134345/140‑1 (MQ=255) aaTCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACAt > 1:789543/1‑140 (MQ=255) aTCGCGGATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATa > 1:1603993/1‑140 (MQ=255) | CTCGCCGCTAATAGCGTGGTGAATCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGAATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATA > NC_000913/1453556‑1453825 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |