| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,788,257 | G→T | A53S (GCT→TCT) | yibQ → | divergent polysaccharide deacetylase domain‑containing protein YibQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,788,257 | 0 | G | T | 98.8% | 295.7 / ‑4.2 | 84 | A53S (GCT→TCT) | yibQ | divergent polysaccharide deacetylase domain‑containing protein YibQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base T (42/41); total (43/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
TTCTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAG‑AAAAATACGCTACGCCCGGA > NC_000913/3788123‑3788390 | ttCTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTa > 2:1744165/1‑140 (MQ=255) tGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTAc < 1:350527/140‑1 (MQ=255) gCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTAcc > 1:1272195/1‑140 (MQ=255) ttGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGAt > 1:984757/1‑140 (MQ=255) tGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGAtt < 2:1509616/140‑1 (MQ=255) gCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTAtt < 1:299815/131‑1 (MQ=255) gCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTAtt > 2:299815/1‑131 (MQ=255) ctctGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCg < 2:1391354/140‑1 (MQ=255) ctGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCa < 1:1343978/140‑1 (MQ=255) ctGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCa < 1:1191140/140‑1 (MQ=255) tGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCAc < 2:1272195/140‑1 (MQ=255) gTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACg > 1:1019441/1‑140 (MQ=255) ggCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCa < 1:965329/140‑1 (MQ=255) gcTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCagag < 1:221772/140‑1 (MQ=255) gcTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCagag < 1:68625/140‑1 (MQ=255) ctctCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCagaga > 1:1533486/1‑140 (MQ=255) ctcctcCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAgagaga > 2:510963/1‑140 (MQ=255) tccCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGc < 1:76345/140‑1 (MQ=255) tccCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGc < 2:984757/140‑1 (MQ=255) gTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCa > 1:1318631/1‑139 (MQ=255) gTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCa < 2:1318631/139‑1 (MQ=255) tACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCaaa > 2:1710727/1‑140 (MQ=255) tACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCaaa > 2:818165/1‑140 (MQ=255) tACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCaaa > 2:1181117/1‑140 (MQ=255) tACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGACAGAGAGATGGCGACCaaa > 1:512737/1‑140 (MQ=255) ttGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAgcg < 1:1594427/140‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTGTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCa > 1:262701/1‑140 (MQ=255) gCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCa > 1:1035418/1‑140 (MQ=255) gCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCATCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCa > 2:236434/1‑140 (MQ=255) tGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATa > 1:1389975/1‑140 (MQ=255) cAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACa > 2:1132961/1‑140 (MQ=255) cAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACa > 1:853572/1‑140 (MQ=255) tGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGc > 1:1331064/1‑140 (MQ=255) tGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGc < 2:853572/140‑1 (MQ=255) cATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACg < 1:1350408/140‑1 (MQ=255) aTCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGa < 1:1822996/140‑1 (MQ=255) aTCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGa < 1:818165/140‑1 (MQ=255) tgatgaTTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTGTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGa < 2:262701/140‑1 (MQ=255) tttGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCAtct > 2:480572/1‑140 (MQ=255) tttGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCAtct < 1:1710727/140‑1 (MQ=255) tCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATgg > 2:1623176/1‑140 (MQ=255) cGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCAtct > 1:225587/1‑131 (MQ=255) cGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCAtct < 2:225587/131‑1 (MQ=255) cGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGc > 1:1589237/1‑140 (MQ=255) cGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGc > 2:1655780/1‑140 (MQ=255) cGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGc > 1:1315999/1‑140 (MQ=255) gCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCa < 2:1331064/140‑1 (MQ=255) ccGGACACCGAAAACCAGGTGTTGGCGATGCCTACCGCTATCTCCGTCTCTTTATTACCCGACTCACCGCACGCCAGAGAGATGGTGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCAcc < 2:1155261/140‑1 (MQ=255) ccGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCAcc < 1:583190/140‑1 (MQ=255) ccGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCAcc < 1:193294/140‑1 (MQ=255) ccGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCAcc < 1:1306190/140‑1 (MQ=255) cGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCg < 2:1389975/140‑1 (MQ=255) cGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCg < 2:940008/140‑1 (MQ=255) cGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCg < 1:1132961/140‑1 (MQ=255) cacaACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGtt > 2:432448/1‑140 (MQ=255) cacaACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGtt > 1:1049828/1‑140 (MQ=255) aaaaCCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTaaa > 2:1431654/1‑140 (MQ=255) ccAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAg > 1:700411/1‑132 (MQ=255) ccAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAg < 2:700411/132‑1 (MQ=255) aGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCg < 1:1431654/140‑1 (MQ=255) aGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCg > 2:1564664/1‑140 (MQ=255) gTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCt > 2:1219619/1‑140 (MQ=255) gTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCt > 2:444849/1‑140 (MQ=255) cTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGga < 1:432448/140‑1 (MQ=255) cTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGga > 2:1602625/1‑140 (MQ=255) ggCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGgag‑a > 2:259317/1‑140 (MQ=255) gCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAG‑aa > 2:408059/1‑140 (MQ=255) tGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAG‑AAAAAt > 1:882296/1‑140 (MQ=255) tGCCTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAG‑AAAAAt > 2:1057493/1‑140 (MQ=255) cTTCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAG‑AAAAAtacg < 2:103884/140‑1 (MQ=255) tCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAG‑AAAAAtacgct < 1:1066406/140‑1 (MQ=255) tCCGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAG‑AAAAAtacgct < 1:408059/140‑1 (MQ=255) ccGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAGAAAAAAtacgct > 1:1765703/1‑140 (MQ=255) cGCTATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAG‑AAAAAtacgctac < 1:1057493/140‑1 (MQ=255) tATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAG‑AAAAATACGCTACGcc < 1:259317/140‑1 (MQ=255) tATCTCCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAG‑AAAAATACGCTACGcc < 1:444849/140‑1 (MQ=255) tctcCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCGCCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAG‑AAAAATACGCTACGCCCg < 2:81541/140‑1 (MQ=255) tctcCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAG‑AAAAATACGCTACGCCCg > 1:253146/1‑140 (MQ=255) tctcCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAG‑AAAAATACGCTACGCCCg > 1:133821/1‑140 (MQ=255) tctcCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAG‑AAAAATACGCTACGCCCg < 2:1035418/140‑1 (MQ=255) tctcCGTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAG‑AAAAATACGCTACGCCCg > 2:992171/1‑140 (MQ=255) tcCGTCGCTGTATTACCCGATGCACCTCACGCCAGTGAGATCTCGAACCACGCGCATTACAGCGGGCCCGACCTGTTGCTTCATCTCCCGCTGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGCG‑AAAATTACCCTACGCCCGga > 2:58446/1‑140 (MQ=255) gTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAG‑AAAAAtacgc > 1:356002/1‑127 (MQ=255) gTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAG‑AAAAAtacgc < 2:1416225/127‑1 (MQ=255) gTCTCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAG‑AAAAAtacgc < 2:356002/127‑1 (MQ=255) | TTCTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAG‑AAAAATACGCTACGCCCGGA > NC_000913/3788123‑3788390 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |