| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 295,424 | G→T | R52R (CGC→CGA) | yagN ← | CP4‑6 prophage; protein YagN |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 295,424 | 0 | G | T | 98.0% | 555.6 / 2.1 | 154 | R52R (CGC→CGA) | yagN | CP4‑6 prophage; protein YagN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base T (72/79); total (73/81) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
TAGCTGATTTAGCCGTACTGTGATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTGCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGAT > NC_000913/295288‑295559 | tAGCTGATTTAGCCATACTGTGATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGa < 1:708129/140‑1 (MQ=255) aGCTGATTTAGCCGTACTGTGATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGaa < 2:168063/140‑1 (MQ=255) aGCTGATTTAGCCGTACTGTGATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGaa < 2:612304/140‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCCGTACTGTGATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAaga < 1:656662/140‑1 (MQ=255) tGATTTAGCCGTACTGTGATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAagag < 1:10088/140‑1 (MQ=255) gATTTAGCCGTACTGTGATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGc < 1:2083420/140‑1 (MQ=255) gATTTAGCCGTACTGTGATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGc < 2:1095690/140‑1 (MQ=255) gATTTAGCCGTACTGTGATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGc < 1:1474878/140‑1 (MQ=255) aTTTAGCCGTACTGTGATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCt < 1:1545967/140‑1 (MQ=255) tttAGCCGTACTGTGATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTg > 2:1612398/1‑140 (MQ=255) aGCCGTACTGTGATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGt < 2:1229325/140‑1 (MQ=255) gCCATACTGTGATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTa > 1:1623629/1‑140 (MQ=255) ccGTACTGTGATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTAt < 1:596408/140‑1 (MQ=255) cGTACTGTGATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATg < 1:491972/140‑1 (MQ=255) cGTACTGTGATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATg < 1:1944512/140‑1 (MQ=255) aCTGTGATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTc > 1:191974/1‑140 (MQ=255) cTGTGATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGt > 1:1436336/1‑133 (MQ=255) gtgATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCtt > 2:156958/1‑140 (MQ=255) tgATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCttt > 2:1367516/1‑140 (MQ=255) gATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTg > 1:2022677/1‑140 (MQ=255) cGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGAt > 1:497270/1‑140 (MQ=255) gATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATa < 2:1623629/140‑1 (MQ=255) aTCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATAc > 2:89682/1‑140 (MQ=255) tGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCg < 1:1084733/140‑1 (MQ=255) tGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCg > 2:142459/1‑140 (MQ=255) tGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCg > 1:468619/1‑140 (MQ=255) gATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGAc < 2:812687/140‑1 (MQ=255) gATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGAc > 2:940147/1‑140 (MQ=255) gCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAAc < 2:1319103/140‑1 (MQ=255) gCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAAc < 2:1768834/140‑1 (MQ=255) ccTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAAcc > 2:1467701/1‑140 (MQ=255) cTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACct > 1:746201/1‑140 (MQ=255) tGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACctc > 1:1409990/1‑140 (MQ=255) ttttACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTcc < 1:886286/140‑1 (MQ=255) ttACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCAt < 1:367932/140‑1 (MQ=255) ttACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCAt < 2:131025/140‑1 (MQ=255) aCATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATgg < 2:497270/140‑1 (MQ=255) cATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCAt > 1:649120/1‑137 (MQ=255) tGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACg < 1:112969/140‑1 (MQ=255) cATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAg > 2:1254645/1‑140 (MQ=255) cATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAg > 2:1101872/1‑140 (MQ=255) cAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAgg < 1:686548/138‑1 (MQ=255) cAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAgg > 2:686548/1‑138 (MQ=255) cAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGAt > 2:84560/1‑140 (MQ=255) aCGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGt > 2:1038753/1‑140 (MQ=255) cgcgcgAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGtt < 1:811179/140‑1 (MQ=255) gcgcgAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTa < 2:1468250/140‑1 (MQ=255) cgcgAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTaa > 2:1110848/1‑140 (MQ=255) gcgAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAgg < 2:1207011/131‑1 (MQ=255) gcgAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAgg > 1:1207011/1‑131 (MQ=255) gcgAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAgg > 1:1261382/1‑131 (MQ=255) gcgAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTaaa > 1:913621/1‑140 (MQ=255) gcgAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTaaa > 1:1505500/1‑140 (MQ=255) cgAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAg > 2:551031/1‑140 (MQ=255) cgAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAg > 1:1304621/1‑140 (MQ=255) agaAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGa < 1:1696243/140‑1 (MQ=255) aGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGa < 2:2022677/140‑1 (MQ=255) aGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGa < 1:461676/140‑1 (MQ=255) gtagCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAgttgt > 1:1852507/1‑140 (MQ=255) gCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGtttt > 1:566252/1‑140 (MQ=255) ttttGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACt > 2:296405/1‑140 (MQ=255) ttttGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACt < 2:468619/140‑1 (MQ=255) ttttGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACt < 1:142459/140‑1 (MQ=255) ttttGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACt < 2:2131523/140‑1 (MQ=255) tttGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACtt > 2:1171561/1‑140 (MQ=255) tttGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACtt > 2:2017957/1‑140 (MQ=255) tttGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACtt > 2:638234/1‑140 (MQ=255) tttGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACtt > 2:1591179/1‑140 (MQ=255) ttGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTg < 2:746201/140‑1 (MQ=255) tGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGa < 2:191974/140‑1 (MQ=255) tGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGa < 1:551031/140‑1 (MQ=255) tCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTaa > 1:88652/1‑140 (MQ=255) tCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTaa > 2:472098/1‑140 (MQ=255) cTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAAt > 1:156174/1‑140 (MQ=255) tttGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATa < 1:1367516/140‑1 (MQ=255) tttGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATa < 2:1409990/140‑1 (MQ=255) tttGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATa > 2:1641152/1‑140 (MQ=255) tttGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTGCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATa < 1:1038376/140‑1 (MQ=255) ttGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACt > 2:1941902/1‑129 (MQ=255) ttAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCa > 2:1823505/1‑140 (MQ=255) ttAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCa > 2:1759022/1‑140 (MQ=255) ttAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCa > 2:653234/1‑140 (MQ=255) gTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGct > 1:1740914/1‑140 (MQ=255) gTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTGCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAg < 1:986240/134‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATa < 2:1852507/140‑1 (MQ=255) tttGGCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCa > 1:457910/1‑140 (MQ=255) ggCGCATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCagag < 1:296405/140‑1 (MQ=255) gcgcATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGt < 1:266075/140‑1 (MQ=255) gcgcATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGt > 2:1748743/1‑140 (MQ=255) cgcATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGctc < 1:821090/123‑1 (MQ=255) cgcATGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGctc > 2:821090/1‑123 (MQ=255) aTGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGt > 2:126145/1‑140 (MQ=255) aTGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGt < 1:76932/140‑1 (MQ=255) aTGCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGt < 1:1639597/140‑1 (MQ=255) gCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGc < 2:273730/128‑1 (MQ=255) gCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGc > 1:273730/1‑128 (MQ=255) gCGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTc < 2:1549267/140‑1 (MQ=255) cGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCt < 1:1918296/140‑1 (MQ=255) cGACAGACTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCt < 1:1823505/140‑1 (MQ=255) aCTTTCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGAt > 1:1221765/1‑140 (MQ=255) | TAGCTGATTTAGCCGTACTGTGATGCGATCTGGATGCCTGATTTTTACATGACATCAGACGCGCGAGAAAGTTAGTAGCATTTTGCATTCTTTGTTTAAGATGTAAAATTTTCAGTTTGGCGCATGCGACAGACTTGCGAAGAGCTGAGTATGTTCCTTTGAGATACTCGACAACCTCTTCCATGGACGCAGGATCGTTAAAGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGAT > NC_000913/295288‑295559 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |