| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 696863 = | 0 (0.000) | 46 (0.580) +GAAGAAACAATC |
21/252 | 2.2 | 49.7% | intergenic (‑33/+2) | glnW/glnU | tRNA‑Gln/tRNA‑Gln |
| ? | NC_000913 | = 697134 | 102 (1.170) | intergenic (‑1/+379) | metT/asnB | tRNA‑Met/asparagine synthetase B | |||||
TCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGC > NC_000913/696774‑697002 | ggtggctacgacgggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCg < 1:917553‑M1/51‑1 (MQ=255) gtggctacgacgggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCgg > 1:1352739‑M1/89‑140 (MQ=255) ttcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCt < 2:140650‑M1/64‑1 (MQ=255) ttcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCt > 1:140650‑M1/74‑137 (MQ=255) tcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGc > 2:1228352‑M1/73‑140 (MQ=255) cgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagcgagattgattcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCg > 2:240798‑M1/72‑140 (MQ=255) cgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactggctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTGCCGCTTGGCGa > 2:1300694‑M1/71‑140 (MQ=255) cctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAc > 1:876950‑M1/68‑140 (MQ=255) tgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAccc > 2:430110‑M1/66‑140 (MQ=255) tgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCa > 1:139056‑M1/64‑140 (MQ=255) tgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCa < 2:451236‑M1/77‑1 (MQ=255) gaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAt > 1:1244710‑M1/63‑140 (MQ=255) cccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATGAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCg < 2:274772‑M1/81‑1 (MQ=255) ccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGt > 1:1120820‑M1/59‑140 (MQ=255) catcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCAATCCGTa > 1:649402‑M1/58‑140 (MQ=255) 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1:970687‑M1/95‑1 (MQ=255) tgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCTGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTg < 1:67716‑M1/95‑1 (MQ=255) tgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTg < 2:40606‑M1/95‑1 (MQ=255) atgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGt < 1:762274‑M1/97‑1 (MQ=255) atgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGt < 1:1224708‑M1/97‑1 (MQ=255) atgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGt < 2:1401071‑M1/97‑1 (MQ=255) 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2:970687‑M1/35‑140 (MQ=255) aactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGa < 1:911627‑M1/110‑1 (MQ=255) ctgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAgg < 2:1031051‑M1/112‑1 (MQ=255) ctgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAgg < 2:412273‑M1/112‑1 (MQ=255) ctgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAgg < 2:970120‑M1/112‑1 (MQ=255) agctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCga < 1:444927‑M1/115‑1 (MQ=255) agctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCga < 1:960254‑M1/115‑1 (MQ=255) ctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCgaga < 1:1145958‑M1/117‑1 (MQ=255) ctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCgaga < 2:967805‑M1/117‑1 (MQ=255) ctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCgaga < 1:1429236‑M1/117‑1 (MQ=255) tagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGa < 2:169378‑M1/122‑1 (MQ=255) agccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGaa < 2:393174‑M1/123‑1 (MQ=255) agccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGaa > 1:967805‑M1/18‑140 (MQ=255) ccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACt < 2:33688‑M1/125‑1 (MQ=255) ccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACt < 1:385369‑M1/125‑1 (MQ=255) ttgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAGTGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGcac < 2:608912‑M1/130‑1 (MQ=255) ttgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGcac < 1:639069‑M1/130‑1 (MQ=255) ttgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGcac < 1:554884‑M1/130‑1 (MQ=255) tcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCtt < 1:992930‑M1/135‑1 (MQ=255) cGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCgg < 1:1234848‑M1/139‑1 (MQ=255) gaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTgcggc > 2:810398/1‑140 (MQ=255) | TCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGC > NC_000913/696774‑697002 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |