Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_000913	1196255	1211431	15177	25 [20]	[21] 26	[icd]–[icdC]	[icd],ymfD,ymfE,lit,intE,xisE,ymfH,ymfI,ymfJ,ymfK,ymfT,ymfL,ymfM,oweE,ymfN,aaaE,ymfR,beeE,jayE,ymfQ,ycfK,tfaP,tfaE,stfE,pinE,mcrA,[icdC]

CTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAAC  >  NC_000913/1211406‑1211571                           |                                                                                                                                             tgagatgaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCag                            >  2:256946/8‑140 (MQ=255)        aTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTgg                     >  1:219342/1‑140 (MQ=255)         tgctgcGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGt                    <  2:430779/140‑1 (MQ=255)          gctgcGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTg                   >  1:610378/1‑140 (MQ=255)             gcgcCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑TTCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAg                >  2:161215/1‑140 (MQ=255)             gcgcCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAg                >  2:1201226/1‑140 (MQ=255)              cgcCATATGGGTTGGATTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGc               >  2:1301557/1‑140 (MQ=255)              cgcCATATGGGTTGGACTGAAGCGGGTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGGAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GCCGCTAAGCTGCTGAAATATACAGAGCTTGGTGAAGc               >  2:491872/1‑140 (MQ=18)              cgcCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGc               >  2:568516/1‑140 (MQ=255)              cgcCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGc               >  1:1444516/1‑140 (MQ=255)              cgcCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGc               >  1:147324/1‑140 (MQ=255)               gcCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCg              >  2:1147112/1‑140 (MQ=255)               gcCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCg              >  2:151023/1‑140 (MQ=255)                 cATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGa             <  2:178051/140‑1 (MQ=255)                   tatGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGatca          >  2:49005/1‑140 (MQ=255)                      gggTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCg       <  1:1355588/140‑1 (MQ=255)                       ggTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGa      <  1:49005/140‑1 (MQ=255)                        gTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTTATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGaa     <  1:340782/140‑1 (MQ=255)                        gTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGaa     <  2:1066543/140‑1 (MQ=255)                        gTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGaa     >  1:740223/1‑140 (MQ=255)                        gTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGaa     <  2:540149/140‑1 (MQ=255)                           ggACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAAc  >  1:772370/1‑140 (MQ=255)                           ggACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAAc  >  1:1349897/1‑140 (MQ=255)                           ggACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAAc  >  2:57529/1‑140 (MQ=255)                           ggACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAAc  >  2:795614/1‑140 (MQ=255)                           ggACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAAc  >  2:888390/1‑140 (MQ=255)                           |                                                                                                                                             CTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAA‑GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAAC  >  NC_000913/1211406‑1211571

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑