Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,727,199 | C→T | L181F (CTC→TTC) | nemA → | N‑ethylmaleimide reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,727,199 | 0 | C | T | 93.8% | 140.3 / 0.4 | 48 | L181F (CTC→TTC) | nemA | N‑ethylmaleimide reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/2); new base T (23/22); total (24/24) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.80e-01 |
TGAAAATGGTCAGGCGATCCGTGTTGAAACATCCATGCCGCGTGCGCTTGAACTGGAAGAGATTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGCTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCAGCGTGGAAAATCGCGCACGTTTGGTACTGGAAGTGGTCGATGCCGGGATTGAAG > NC_000913/1727066‑1727331 | tGAAAATGGTCAGGCGATCCGTGTTGAAACATCCATGCCGCGTGCGCTTGAACTGGAAGAGATTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCAct < 2:1029452/140‑1 (MQ=255) aTGGTCAGGCGATCCGTGTTGAAACATCCATGCCGCGTGCGCTTGAACTGGAAGAGATTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCt > 1:625310/1‑140 (MQ=255) ggCGATCCGTGTTGAAACATCCATGCCGCGTGCGCTTGAACTGGAAGAGATTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTCTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGtt > 2:935233/1‑140 (MQ=255) gCGATCCGTGTTGAAACATCCATGCCGCGTGCGCTTGAACTGGAAGAGATTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTa > 2:954178/1‑140 (MQ=255) cGTGTTGAAACATCCATGCCGCGTGCGCTTGAACTGGAAGAGATTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTtgct < 1:844143/140‑1 (MQ=255) tGAAACATCCATGCCGCGTGCGCTTGAACTGGAAGAGATTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATc < 2:16467/140‑1 (MQ=255) gAAACATCCATGCCGCGTGCGCTTGAACTGGAAGAGATTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCa < 2:195632/140‑1 (MQ=255) aaaCATCCATGCCGCGTGCGCTTGAACTGGAAGAGATTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGCTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAg < 1:1105015/140‑1 (MQ=255) aCATCCATGCCGCGTGCGCTTGAACTGGAAGAGATTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGtt < 2:192626/140‑1 (MQ=255) aTCCATGCCGCGTGCGCTTGAACTGGAAGAGATTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTcc > 2:882232/1‑140 (MQ=255) tCCATGCCGCGTGCGCTTGAACTGGAAGAGATTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAg > 2:858821/1‑135 (MQ=255) tCCATGCCGCGTGCGCTTGAACTGGAAGAGATTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAg < 1:858821/135‑1 (MQ=255) ccATGCCGCGTGCGCTTGAACTGGAAGAGATTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCtt < 2:699072/140‑1 (MQ=255) ccATGCCGCGTGCGCTTGAACTGGAAGAGATTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCtt < 1:954178/140‑1 (MQ=255) cATGCCGCGTGCGCTTGAACTGGAAGAGATTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCttt > 2:874864/1‑140 (MQ=255) cATGCCGCGTGCGCTTGAACTGGAAGAGATTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCttt < 1:254475/140‑1 (MQ=255) tGCGCTTGAACTGGAAGAGATTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCcttctt > 1:902397/1‑140 (MQ=255) cgcTTGAACTGGAAGAGATTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTCTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCa < 1:935233/140‑1 (MQ=255) cTTGAACTGGAAGAGATTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCaaa > 1:871870/1‑140 (MQ=255) gaTTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCa < 2:1108152/124‑1 (MQ=255) gaTTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCa > 1:1108152/1‑124 (MQ=255) ttCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGAt > 2:969967/1‑137 (MQ=255) ttCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGAt < 1:969967/137‑1 (MQ=255) ttCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAg < 2:505921/140‑1 (MQ=255) aGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTAcg > 1:543147/1‑140 (MQ=255) cGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCa > 1:491435/1‑140 (MQ=255) gTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGAt > 2:408790/1‑126 (MQ=255) gTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGAt < 1:408790/126‑1 (MQ=255) tCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCAGc < 2:378939/140‑1 (MQ=255) ttCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCAGCGTGGaaaa > 1:588886/1‑140 (MQ=255) cAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCAGCGTGGAAAATCgcgc < 2:210652/140‑1 (MQ=255) gCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCAGCGTGGAAAATCGCGCACg > 1:716605/1‑140 (MQ=255) gCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCAGCGTGGAAAATCGCGCACg > 1:334481/1‑140 (MQ=255) cATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGTGGCAGCGTGGAAAATCGCGCACGtt < 2:902397/140‑1 (MQ=255) aTTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCAGCGTGGAAAATCGCGCACGttt < 2:907112/140‑1 (MQ=255) aCGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCAGCGTGGAAAATCGCGCACGTTTGGTACTg > 2:44001/1‑140 (MQ=255) cgcgcgTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCAGCGTGGAAAATCGCGCACGTTTGGTACTgg > 1:263092/1‑140 (MQ=255) cgTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCAGCGTGGAAAATCGCGCACGTTTGGTACTGGAAGt > 1:1051955/1‑140 (MQ=255) cgTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCAGCGTGGAAAATCGCGCACGTTTGGTACTGGAAGt > 2:662559/1‑140 (MQ=255) cgTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGCTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCAGCGTGGAAAATCGCGCACGTTTGGTACTGGAAGt > 1:231502/1‑140 (MQ=255) tGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCAGCGTGGAAAATCGCGCACGTTTGGTACTGGAAGTgg > 1:210205/1‑140 (MQ=255) aaGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGCTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCAGCGTGGAAAATCGCGCACGTTTGGTACTGGAAGTGGTc < 2:231502/140‑1 (MQ=255) ggTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCAGCGTGGAAAATCGCGCACGTTTGGTACTGGAAGTGGTCGATGc < 2:716605/140‑1 (MQ=255) ggTTTTGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCAGCGTGGAAAATCGCGCACGTTTGGTACTGGAAGTGGTCGATGc < 1:662559/140‑1 (MQ=255) ttttGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCAGCGTGGAAAATCGCGCACGTTTGGTACTGGAAGTGGTCGATGCCg < 2:968679/140‑1 (MQ=255) ttttGATCTGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCAGCGTGGAAAATCGCGCACGTTTGGTACTGGAAGTGGTCGATGCCg > 1:791341/1‑140 (MQ=255) tGGTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCAGCGTGGAAAATCGCGCACGTTTGGTACTGGAAGTGGTCGATGCCGGGATTgaa < 2:1051955/140‑1 (MQ=255) ggTAGAGTTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCAGCGTGGAAAATCGCGCACGTTTGGTACTGGAAGTGGTCGATGCCGGGATTgaag > 2:44057/1‑140 (MQ=255) | TGAAAATGGTCAGGCGATCCGTGTTGAAACATCCATGCCGCGTGCGCTTGAACTGGAAGAGATTCCAGGTATCGTCAATGATTTCCGTCAGGCCATTGCTAACGCGCGTGAAGCCGGTTTTGATCTGGTAGAGCTCCACTCTGCTCACGGTTATTTGCTGCATCAGTTCCTTTCTCCTTCTTCAAACCATCGTACCGATCAGTACGGCGGCAGCGTGGAAAATCGCGCACGTTTGGTACTGGAAGTGGTCGATGCCGGGATTGAAG > NC_000913/1727066‑1727331 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |