New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 781577 = | 50 (0.800) | 46 (0.750) +GAAG |
21/268 | 1.5 | 65.5% | noncoding (1/76 nt) | lysQ | tRNA‑Lys |
? | NC_000913 | = 2521006 | 0 (0.000) | noncoding (76/76 nt) | valU | tRNA‑Val |
TTCTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCC > NC_000913/2520870‑2521112 | ttCTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActt < 2:134516‑M2/140‑4 (MQ=255) tttAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTTGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgg > 2:232484‑M2/1‑134 (MQ=255) aGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtc < 1:735938‑M2/140‑10 (MQ=255) aaTGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGGCTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCCCCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgtta > 2:312806‑M2/1‑127 (MQ=255) aaTGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgtta > 1:241587‑M2/1‑127 (MQ=255) aaTGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgtta > 2:587225‑M2/1‑127 (MQ=255) tGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCGcttcgggtcgttagc > 2:1043664‑M2/1‑125 (MQ=255) tGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagc < 2:405633‑M2/140‑16 (MQ=255) tGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagc > 1:226068‑M2/1‑125 (MQ=255) tGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagc > 2:735938‑M2/1‑125 (MQ=255) cGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctc > 2:528201‑M2/1‑123 (MQ=255) gTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctca > 1:520317‑M2/1‑122 (MQ=255) tGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagt < 2:340232‑M2/140‑21 (MQ=255) cTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttgg < 2:631148‑M2/140‑24 (MQ=255) aTTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctc > 1:598439‑M2/1‑114 (MQ=255) aTTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctc < 2:598439‑M2/131‑18 (MQ=255) tcCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgact < 2:928541‑M2/140‑38 (MQ=255) taATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaat > 1:761209‑M2/1‑97 (MQ=255) tGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaa > 2:791945‑M2/1‑94 (MQ=255) gCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaat < 2:444242‑M2/140‑48 (MQ=255) gCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaat < 1:470044‑M2/140‑48 (MQ=255) gCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaat > 1:631148‑M2/1‑93 (MQ=255) cGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaatt < 2:907952‑M2/140‑49 (MQ=255) ccACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcg > 2:275073‑M2/1‑87 (MQ=255) cacaGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcag < 2:597498‑M2/140‑57 (MQ=255) gCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttc > 2:741406‑M2/1‑80 (MQ=255) cGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcg < 2:1004491‑M2/140‑62 (MQ=255) cGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcg < 1:203162‑M2/140‑62 (MQ=255) cGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcg < 1:427871‑M2/140‑62 (MQ=255) cGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcggggcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcg < 1:918401‑M2/140‑62 (MQ=255) ggggTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaa > 1:597498‑M2/1‑77 (MQ=255) ttAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgca > 1:209140‑M2/1‑70 (MQ=255) ttAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgca > 1:907952‑M2/1‑70 (MQ=255) ttAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgca > 2:795907‑M2/1‑70 (MQ=255) ttAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgca > 1:928541‑M2/1‑70 (MQ=255) ttAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgca > 1:340232‑M2/1‑70 (MQ=255) ttAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgca > 1:444242‑M2/1‑70 (MQ=255) gCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgcacga > 1:975445‑M2/1‑67 (MQ=255) tCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgcacgacc > 1:1004491‑M2/1‑65 (MQ=255) gCTGGGAGAGCCCCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagcgcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgcacgacccac > 2:1039380‑M2/1‑62 (MQ=255) gCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgcacgacccac > 2:918401‑M2/1‑62 (MQ=255) agagCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgcacgacccaccaatgt < 1:759802‑M2/140‑85 (MQ=255) cccTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgcacgacc < 1:799286‑M2/122‑76 (MQ=255) cccTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgcacgacc > 2:799286‑M2/1‑47 (MQ=255) ggaggGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgcacgacccaccaatgtaaaaaagcgccctaaagg > 2:29837‑M2/1‑38 (MQ=255) aggGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgcacgacccaccaatgtaaaaaagcgccctaaaggcg > 2:203162‑M2/1‑36 (MQ=255) ggggTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgactcttaatcaactggtcgcaggttcgaatcctgcacgacccaccaatgtaaaaaagcgccctaaaggcgct > 2:281692‑M2/1‑34 (MQ=255) | TTCTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCC > NC_000913/2520870‑2521112 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |