| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,578,434 | C→A | intergenic (‑57/‑232) | maeB ← / → talA | malate dehydrogenase/transaldolase A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,578,434 | 0 | C | A | 98.8% | 304.3 / ‑3.1 | 86 | intergenic (‑57/‑232) | maeB/talA | malate dehydrogenase/transaldolase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base A (34/51); total (34/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.48e-01 | |||||||||||
GGTTGGAGAAACCTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGCCCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATCCAGCAATACCATGC > NC_000913/2578300‑2578569 | ggttggAGAAACCTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACcaca > 1:840738/1‑140 (MQ=255) gagaAACCTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTg > 1:603245/1‑140 (MQ=255) gagaAACCTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTg > 2:255403/1‑140 (MQ=255) gagaAACCTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTg < 1:1132209/140‑1 (MQ=255) aaaCCTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGgcg < 2:537416/140‑1 (MQ=255) aaaCCTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGgcg < 2:258448/140‑1 (MQ=255) aaaCCTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGgcg < 1:130100/140‑1 (MQ=255) aaaCCTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGgcg < 2:332598/140‑1 (MQ=255) aaaCCTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGgcg < 1:393619/140‑1 (MQ=255) aCCTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGca < 1:1108851/140‑1 (MQ=255) aCCTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGca < 1:605447/140‑1 (MQ=255) ccTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGcac > 2:915317/1‑140 (MQ=255) tCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTAcc > 2:950359/1‑140 (MQ=255) tCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTAcc > 1:1065268/1‑140 (MQ=255) tCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTAcc < 1:915317/140‑1 (MQ=255) ggaactggaaATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGcc > 2:914670/1‑140 (MQ=255) ggaactggaaATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGcc < 1:472121/140‑1 (MQ=255) gaactggaaATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCg < 1:1107747/140‑1 (MQ=255) aactggaaATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCgg < 1:886928/140‑1 (MQ=255) aactggaaATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCgg < 1:463032/140‑1 (MQ=255) aTTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACa < 1:961597/140‑1 (MQ=255) ttCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAg > 2:554477/1‑140 (MQ=255) tCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCa < 2:965257/140‑1 (MQ=255) tCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCa > 1:393908/1‑140 (MQ=255) tCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCa < 1:10921/140‑1 (MQ=255) aGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGt > 1:87282/1‑140 (MQ=255) gTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTc < 2:309661/140‑1 (MQ=255) cACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTcc > 2:6990/1‑138 (MQ=255) cACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTcc < 1:6990/138‑1 (MQ=255) aCTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCaaa < 1:554477/140‑1 (MQ=255) cTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCaaa > 1:1074851/1‑139 (MQ=255) cTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCaaa < 2:1074851/139‑1 (MQ=255) ttGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAActc < 2:602086/140‑1 (MQ=255) tGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAActct < 2:603245/140‑1 (MQ=255) tGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAActct < 1:914670/140‑1 (MQ=255) tGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAActct > 2:1063317/1‑140 (MQ=255) gTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACtctc < 1:950359/140‑1 (MQ=255) gTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACtctc < 2:626637/140‑1 (MQ=255) tttAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCAc > 1:181984/1‑140 (MQ=255) aaCTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCAt > 1:524185/1‑140 (MQ=255) ggTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAat > 1:262460/1‑140 (MQ=255) gTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCaaa < 1:269381/125‑1 (MQ=255) gTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCaaa > 2:269381/1‑125 (MQ=255) gTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAata > 2:46908/1‑140 (MQ=255) cATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAAtata < 2:962119/140‑1 (MQ=255) aTCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATaa < 2:262460/140‑1 (MQ=255) aTCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATaa > 2:1112675/1‑140 (MQ=255) aTTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGtt < 2:586347/140‑1 (MQ=255) tttGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGttt > 1:245316/1‑140 (MQ=255) tGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTg > 1:963207/1‑140 (MQ=255) tGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTg > 1:1026737/1‑140 (MQ=255) ggTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTgg > 2:1022218/1‑140 (MQ=255) gttgttCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGt < 2:1026737/140‑1 (MQ=255) tgttCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGtaa < 1:1112675/140‑1 (MQ=255) gttCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGtaat < 1:255403/140‑1 (MQ=255) gttCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGtaat < 2:840738/140‑1 (MQ=255) gttCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGtaat > 1:659446/1‑140 (MQ=255) gttCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGtaat > 2:112748/1‑140 (MQ=255) tCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGtaataa < 2:1065268/140‑1 (MQ=255) tCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGtaataa < 2:963207/140‑1 (MQ=255) tCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCta < 2:45644/140‑1 (MQ=255) tAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAaca < 2:1108382/140‑1 (MQ=255) tAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAaca < 1:112748/140‑1 (MQ=255) tAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAaca < 1:1063317/140‑1 (MQ=255) cacaAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGt > 2:131204/1‑140 (MQ=255) acaAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGtt < 2:524185/140‑1 (MQ=255) aaaTAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTAc < 1:752508/140‑1 (MQ=255) aaaTAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTAc < 2:87282/140‑1 (MQ=255) aaaTAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTAc < 2:783997/140‑1 (MQ=255) aaaTAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTAc < 2:659446/140‑1 (MQ=255) aGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCtt > 2:975082/1‑140 (MQ=255) tgtgtgGGCAACAGCCCCTGCCCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTaa < 2:432168/140‑1 (MQ=255) tgtgtgGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTaa > 1:129502/1‑140 (MQ=255) tgtgtgGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTaa < 2:181984/140‑1 (MQ=255) tgtgGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATc > 2:624255/1‑140 (MQ=255) tgtgGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATc < 1:624255/140‑1 (MQ=255) tgtgGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATc > 2:1001540/1‑140 (MQ=255) tgGGCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATCCa > 1:135637/1‑140 (MQ=255) ggCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATCCAGc > 2:749465/1‑140 (MQ=255) ggCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATCCAGc > 2:806808/1‑140 (MQ=255) ggCAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATCCAGc < 2:135637/140‑1 (MQ=255) cAACAGCCCCTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATCCAGaaa < 1:975082/140‑1 (MQ=255) ccccTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATCCAGc < 1:50366/132‑1 (MQ=255) ccccTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATCCAGc > 2:50366/1‑132 (MQ=255) cccTGACCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATCCAGCAATACCATg < 1:1022218/140‑1 (MQ=255) ccTGACCACAACGTGGCGCACGTTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATCCAGCAATACCATGc < 1:651252/140‑1 (MQ=255) | GGTTGGAGAAACCTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGCCCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATCCAGCAATACCATGC > NC_000913/2578300‑2578569 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |