| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | NC_000913 | 3,741,988 | Δ4 bp | coding (542‑545/849 nt) | yiaJ ← | DNA‑binding transcriptional repressor YiaJ |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 3741992 = | 1 (0.010) | coding (541/849 nt) | yiaJ | DNA‑binding transcriptional repressor YiaJ | |||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
GAACAGCAATACAGGAGACGCCGAGTTCGTTTTCTTCTCTGTCCATCGCCGCTCCGCTTTCACGAATGTGCGCCAGTTCGTCGAACATCGCGGGCAGCTCGGTAATGGTATTGCGGGTTAACGGCTGGATCTCATGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGCCAATATAGGCACGGGTTCGCAGCATCCCGGTTGTGGGTTCCA > NC_000913/3741857‑3742129 | accggaacagcaatacaggagacgccgagttcgttttcttctctgtccatcgccgctccgctttcacgaatgtgcgccagttcgtcgaacatcgcgggcagctcggtaatggtattgcgggttaacggctggatcGCTGa > 1:243848‑M2/136‑140 (MQ=255)accggaacagcaatacaggagacgccgagttcgttttcttctctgtccatcgccgctccgctttcacgaatgtgcgccagttcgtcgaacatcgcgggcagctcggtaatggtattgcgggttaacggctggatcGCTGa > 1:183142‑M2/136‑140 (MQ=255)accggaacagcaatacaggagacgccgagttcgttttcttctctgtccatcgccgctccgctttcacgaatgtgcgccagttcgtcgaacatcgcgggcagctcggtaatggtattgcgggttaacggctggatcGCTGa > 2:1244914‑M2/136‑140 (MQ=255) gaacagcaatacaggagacgccgagttcgttttcttctctgtccatcgccgctccgctttcacgaatgtgcgccagttcgtcgaacatcgcgggcagctcggtaatggtattgcgggttaacggctggatcGCTGATGGc > 1:273633‑M2/132‑140 (MQ=255) 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1:228408‑M2/127‑140 (MQ=255) gcaatacaggagacgccgagttcgttttcttctctgtccatcgccgctccgctttcacgaatgtgcgccagttcgtcgaacatcgcgggcagctcggtaatggtattgcgggttaacggctggatcGCTGATGGCTTTcc > 1:920593‑M2/127‑140 (MQ=255) acaggagacgccgagttcgttttcttctctgtccatcgccgctccgctttcacgaatgtgcgccagttcgtcgaacatcgcgggcagctcggtaatggtattgcgggttaacggctggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTa < 1:98687‑M2/19‑1 (MQ=255) acaggagacgccgagttcgttttcttctctgtccatcgccgctccgctttcacgaatgtgcgccagttcgtcgaacatcgcgggcagctcggtaatggtattgcgggttaacggctggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTa < 2:845784‑M2/19‑1 (MQ=255) gagacgccgagttcgttttcttctctgtccatcgccgctccgctttcacgaatgtgcgccagttcgtcgaacatcgcgggcagctcggtaatggtattgcgggttaacggctggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGAc < 1:1183788‑M2/23‑1 (MQ=255) gagacgccgagttcgttttcttctctgtccatcgccgctccgctttcacgaatgtgcgccagttcgtcgaacatcgcgggcagctcggtaatggtattgcgggttaacggctggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGAc < 2:243848‑M2/23‑1 (MQ=255) 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1:364080‑M2/54‑140 (MQ=255) gaacatcgcgggcagctcggtaatggtattgcgggttaacggctggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATg < 1:850354‑M2/91‑1 (MQ=255) gaacatcgcgggcagctcggtaatggtattgcgggttaacggctggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATg < 2:801535‑M2/91‑1 (MQ=255) tcgcgggcagctcggtaatggtattgcgggttaacggctggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGc < 1:854709‑M2/96‑1 (MQ=255) tcgcgggcagctcggtaatggtattgcgggttaacggctggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGc < 2:329155‑M2/96‑1 (MQ=255) cgcgggcagctcggtaatggtattgcgggttaacggctggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGcc < 2:126090‑M2/97‑1 (MQ=255) 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1:983242‑M2/29‑140 (MQ=255) attgcgggttaacggctggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGCCAATATAGGCACGGGTTCgcag < 2:729404‑M2/118‑1 (MQ=255) attgcgggttaacggctggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGCCAATATAGGCACGGGTTCgcag < 1:1072403‑M2/118‑1 (MQ=255) attgcgggttaacggctggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGCCAATATAGGCACGGGTTCgcag < 1:23075‑M2/118‑1 (MQ=255) ttgcgggttaacggctggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGCCAATATAGGCACGGGTTCgcagc > 1:812350‑M2/22‑140 (MQ=255) gcgggttaacggctggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGCCAATATAGGCACGGGTTCGCAGCAt > 2:617487‑M2/20‑140 (MQ=255) gcgggttaacggctggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGCCAATATAGGCACGGGTTCGCAGCAt > 2:538414‑M2/20‑140 (MQ=255) gcgggttaacggctggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGCCAATATAGGCACGGGTTCGCAGCAt > 1:866528‑M2/20‑140 (MQ=255) gcgggttaacggctggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGCCAATATAGGCACGGGTTCGCAGCAt > 1:350432‑M2/20‑140 (MQ=255) cgggttaacggctggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGCCAATATAGGCACGGGTTCGCAGCATc < 2:928168‑M2/122‑1 (MQ=255) gttaacggctggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGCCAATATAGGCACGGGTTCGCAGCATCCCg > 2:203685‑M2/16‑140 (MQ=255) taacggctggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGCCAATATAGGCACGGGTTCGCAGCATCCCGGt > 1:728137‑M2/14‑140 (MQ=255) taacggctggatcGCCGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGCCAATATAGGCACGGGTTCGCAGCATCCCGGt > 1:700598‑M2/14‑140 (MQ=255) ggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGCCAATATAGGCACGGGTTCGCAGCATCCCGGTTGTGGGtt > 2:627627‑M2/6‑140 (MQ=255) ggatcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGCCAATATAGGCACGGGTTCGCAGCATCCCGGTTGTGGGtt > 1:763130‑M2/6‑140 (MQ=255) atcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGCCAATATAGGCACGGGTTCGCAGCATCCCGGTTGTGGGTTcc < 1:17451‑M2/137‑1 (MQ=255) tcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGCCAATATAGGCACGGGTTCGCAGCATCCCGGTTGTGGGTTCCa < 2:198869‑M2/138‑1 (MQ=255) tcGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGCCAATATAGGCACGGGTTCGCAGCATCCCGGTTGTGGGTTCCa < 1:838688‑M2/138‑1 (MQ=255) | GAACAGCAATACAGGAGACGCCGAGTTCGTTTTCTTCTCTGTCCATCGCCGCTCCGCTTTCACGAATGTGCGCCAGTTCGTCGAACATCGCGGGCAGCTCGGTAATGGTATTGCGGGTTAACGGCTGGATCTCATGCTGATGGCTTTCCCAGTATGACTTCACGTAGTCCGGGTGACCAAACGCCATGTAGATCTTGCCCATTGCGGAACAGTAGAGCGGCATATGCTGGCCAATATAGGCACGGGTTCGCAGCATCCCGGTTGTGGGTTCCA > NC_000913/3741857‑3742129 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |