Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,884,489 | C→A | intergenic (+13/‑4) | rpmH → / → rnpA | 50S ribosomal subunit protein L34/RNase P protein component |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,884,489 | 0 | C | A | 98.8% | 294.1 / ‑3.0 | 83 | intergenic (+13/‑4) | rpmH/rnpA | 50S ribosomal subunit protein L34/RNase P protein component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base A (46/36); total (46/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.46e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.19e-01 |
ACCGTCTGTACTGAAGCGCAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCCTGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGCAT > NC_000913/3884353‑3884624 | aCCGTCTGTACTGAAGCGCAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGa < 2:1247209/140‑1 (MQ=255) gTCTGTACTGAAGCGCAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGACGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTg > 2:1673681/1‑140 (MQ=255) tCTGTACTGAAGCGCAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTgg > 1:1738242/1‑140 (MQ=255) tGTACTGAAGCGCAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGtt > 1:843634/1‑140 (MQ=255) tGTACTGAAGCGCAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGtt > 1:1655731/1‑140 (MQ=255) tGTACTGAAGCGCAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGATCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGtt > 1:1026034/1‑140 (MQ=255) cTGAAGCGCAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGc < 2:1252783/140‑1 (MQ=255) cTGAAGCGCAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGATCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGc < 2:1026034/140‑1 (MQ=255) aaGCGCAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCg > 1:1429812/1‑140 (MQ=255) aaGCGCAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCg > 2:601463/1‑140 (MQ=255) aGCGCAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGc < 1:987470/140‑1 (MQ=255) aGCGCAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGACCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGc > 2:792518/1‑140 (MQ=255) gcgcAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCa > 1:510875/1‑140 (MQ=255) cgcAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCa < 2:704165/139‑1 (MQ=255) cgcAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCa > 1:704165/1‑139 (MQ=255) cgcAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCAt < 2:1496358/140‑1 (MQ=255) cAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCAttt > 1:1503379/1‑140 (MQ=255) cAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCAttt > 2:1647229/1‑140 (MQ=255) cAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCAttt > 1:760425/1‑140 (MQ=255) cAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCAttt > 2:1764871/1‑140 (MQ=255) cAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACT‑AAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGc < 1:1100924/135‑1 (MQ=255) cAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACT‑AAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGc > 2:1100924/1‑135 (MQ=255) cGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCa < 1:1076185/140‑1 (MQ=255) cGGCTTCCTTGATCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTa < 2:1088844/140‑1 (MQ=255) cGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTa < 1:601463/140‑1 (MQ=255) ggCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCa > 2:1281403/1‑131 (MQ=255) ggCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCa < 1:1281403/131‑1 (MQ=255) ggCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCa > 2:62670/1‑131 (MQ=255) ggCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCa < 1:62670/131‑1 (MQ=255) gCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACg > 1:1266863/1‑140 (MQ=255) gCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACg < 2:1655731/140‑1 (MQ=255) cTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACg > 2:1690499/1‑139 (MQ=255) cTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACg < 1:1690499/139‑1 (MQ=255) cTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGc > 2:1054288/1‑140 (MQ=255) gTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGtt < 1:1228272/140‑1 (MQ=255) gTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGtt < 1:284527/140‑1 (MQ=255) tGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTa > 2:185969/1‑140 (MQ=255) tATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTccc < 2:551687/140‑1 (MQ=255) aTGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCa > 1:220332/1‑140 (MQ=255) tGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAg < 2:1266863/140‑1 (MQ=255) gCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTc > 2:558212/1‑140 (MQ=255) actaAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAAt < 2:658772/140‑1 (MQ=255) taAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTc > 2:1341702/1‑140 (MQ=255) taAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTc > 2:819981/1‑140 (MQ=255) taAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTc > 2:1629730/1‑140 (MQ=255) aTGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACAtt < 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< 1:116433/140‑1 (MQ=255) aCGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACaa < 1:819981/140‑1 (MQ=255) gtcgtcgtGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACg > 2:282639/1‑140 (MQ=255) gtcgtcgtGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACg > 2:1169508/1‑140 (MQ=255) gtcgtcgtGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACg > 1:1639124/1‑140 (MQ=255) tcgtcgtGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACgg > 2:1582059/1‑140 (MQ=255) aaaGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCAcgc < 2:220332/140‑1 (MQ=255) aaaGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCA‑GGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCAcgcc < 1:1764871/140‑1 (MQ=255) aaGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCAcgcc < 2:1429812/140‑1 (MQ=255) aGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCAcgccg < 1:1629730/140‑1 (MQ=255) aGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCAcgccg < 2:1738242/140‑1 (MQ=255) cgcgCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCaaa > 2:1372860/1‑140 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1:329085/1‑140 (MQ=255) ttCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGgccgc < 1:1749486/140‑1 (MQ=255) tCTAAGTAATAAAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGgccgcc > 1:799594/1‑140 (MQ=255) taaAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGc > 1:1486041/1‑140 (MQ=255) taaAGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGc < 1:558212/140‑1 (MQ=255) aGCTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTgg > 2:1427255/1‑140 (MQ=255) cTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTgggg < 2:510875/140‑1 (MQ=255) cTAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTgggg < 1:282639/140‑1 (MQ=255) tAACCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGc < 2:1503379/140‑1 (MQ=255) aaCCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGCa > 1:618851/1‑140 (MQ=255) aaCCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGCa > 2:703555/1‑140 (MQ=255) aaCCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGCa > 1:1018989/1‑140 (MQ=255) aCCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGCAt > 2:1641618/1‑140 (MQ=255) aCCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGCAt > 2:1142233/1‑140 (MQ=255) aCCCATGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCAATCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGCAt > 2:210256/1‑140 (MQ=255) | ACCGTCTGTACTGAAGCGCAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCCTGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGCAT > NC_000913/3884353‑3884624 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |