New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3365362 | 159 (2.230) | 4 (0.060) | 4/266 | 6.8 | 2.5% | pseudogene (178/371 nt) | yhcE | putative uncharacterized protein YhcE |
? | NC_000913 | 3365368 = | 156 (2.270) | pseudogene (184/371 nt) | yhcE | putative uncharacterized protein YhcE | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
CCGCTCAGGCAGAGTGTAATATCTCCAGTAGCATACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAGGTAGTAACAATCTCGACCTGGCGTTAG > NC_000913/3365231‑3365506 | cTCAGGCAGAGTGTAATATCTCCAGTAGCATACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAg < 1:785936/140‑1 (MQ=255) tCAGGCAGAGTGTAATATCTCCAGTAGCATACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAgg < 1:265825/140‑1 (MQ=255) tCAGGCAGAGTGTAATATCTCCAGTAGCATACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAgg < 1:680280/140‑1 (MQ=255) cAGGCAGAGTGTAATATCTCCAGTAGCATACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGa < 1:20001/140‑1 (MQ=255) cAGGCAGAGTGTAATATCTCCAGTAGCATACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGa < 2:1103157/140‑1 (MQ=255) tgtAATATCTCCAGTAGCATACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGAc > 1:825260/1‑132 (MQ=255) tgtAATATCTCCAGTAGCATACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCatat > 2:171157/1‑140 (MQ=255) tgtAATATCTCCAGTAGCATACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCatat > 1:267582/1‑140 (MQ=255) tAATATCTCCAGTAGCATACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTc > 2:106622/1‑140 (MQ=255) atatCTCCAGTAGCATACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCgt > 1:565354/1‑140 (MQ=255) atatCTCCAGTAGCATACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCgt > 1:958465/1‑140 (MQ=255) atatCTCCAGTAGCATACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCgt > 1:870332/1‑140 (MQ=255) tatCTCCAGTAGCATACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCgtg < 2:531774/140‑1 (MQ=255) tctcCAGTAGCATACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGtt < 1:252161/140‑1 (MQ=255) tctcCAGTAGCATACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGtt < 2:509868/140‑1 (MQ=255) ctcCAGTAGCATACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTc > 2:1095477/1‑140 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tACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATAcc > 2:1117793/1‑140 (MQ=255) tACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATAcc < 1:706948/140‑1 (MQ=255) tACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATAc > 1:1130685/1‑139 (MQ=255) tACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATAc < 2:1130685/139‑1 (MQ=255) aCAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCg < 2:1007144/140‑1 (MQ=255) cAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGc > 2:209755/1‑140 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(MQ=255) cagaACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAg < 1:1116443/140‑1 (MQ=255) agaACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAgg < 2:829746/140‑1 (MQ=255) agaACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTCAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAgg < 2:811422/140‑1 (MQ=255) gaACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAGgt > 1:1001106/1‑140 (MQ=255) gaACAATCACGCTCGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAGgt > 1:156524/1‑140 (MQ=255) aaTCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAGgtagta < 2:563350/140‑1 (MQ=255) cGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAGGTAGTAACAAt > 1:817626/1‑140 (MQ=255) gCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAGGTAGTAACAAtc < 2:1190728/140‑1 (MQ=255) cTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAGGTAGTAACAAtct > 2:598994/1‑140 (MQ=255) cTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAGGTAGTAACAAtct > 2:245687/1‑140 (MQ=255) cTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAGGTAGTAACAAtct > 1:430964/1‑140 (MQ=255) aatgcaatgcGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAGGTAGTAACAATCTCGAcc < 1:1142022/140‑1 (MQ=255) aatgcaatgcGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAGGTAGTAACAATCTCGAcc < 1:798650/140‑1 (MQ=255) aatgcaatgcGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAGGTAGTAACAATCTCGAcc < 1:1094153/140‑1 (MQ=255) aatgcaatgcGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAGGTAGTAACAATCTCGAcc < 2:1086381/140‑1 (MQ=255) aatgcaatgcGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAGGTAGTAACAATCTCGAcc < 1:665721/140‑1 (MQ=255) atgcGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAGGTAGTAACAATCTCGACCTGGCGt > 2:35170/1‑140 (MQ=255) gcGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAGGTAGTAACAATCTCGACCTGGCGTTa > 2:637489/1‑140 (MQ=255) gcGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAGGTAGTAACAATCTCGACCTGGCGTTa > 1:1127632/1‑140 (MQ=255) gcGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAGGTAGTAACAATCTCGACCTGGCGTTa > 1:108357/1‑140 (MQ=255) gcGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAGGTAGTAACAATCTCGACCTGGCGTTa > 2:894957/1‑140 (MQ=255) | CCGCTCAGGCAGAGTGTAATATCTCCAGTAGCATACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAACAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAGGTAGTAACAATCTCGACCTGGCGTTAG > NC_000913/3365231‑3365506 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |