Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 753,125 | 0 | T | A | 23.7% | 129.3 / 16.2 | 59 | intergenic (‑330/+60) | ybgD/gltA | putative fimbrial protein YbgD/citrate synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/5); new base A (0/14); total (40/19) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.74e-10 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
GGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCTTCATACC > NC_000913/752986‑753262 | gggTTATAAATGGGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCatat < 2:374640/140‑1 (MQ=255) gggTTATAAATGCGACTACCATGAATTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCatat < 2:715434/140‑1 (MQ=255) gggTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCatat < 1:597024/140‑1 (MQ=255) ggTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTCAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCAtata > 2:1047096/1‑140 (MQ=255) gTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATaa > 1:937993/1‑140 (MQ=255) ataAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTATAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATaaaaa > 1:880997/1‑140 (MQ=255) ataAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATaaaaa > 1:901933/1‑140 (MQ=255) aTGCGACTACCATGATTTTTTTAATTAAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTTTTTTATTTTTTTAAAATTTCTATATGTGTTTGTTAATGATTTTTTTTTTTAAATTTTTTTG‑TTTTTAGGCATAAAAAAATCaa < 2:932832/140‑1 (MQ=255) gCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAAcc > 2:1164782/1‑140 (MQ=255) gCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAAcc > 1:237651/1‑140 (MQ=255) gCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAAcc > 1:119904/1‑140 (MQ=255) gCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAAcc > 1:934896/1‑140 (MQ=255) gCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAAcc > 1:370264/1‑140 (MQ=255) gCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAAcc > 1:1081153/1‑140 (MQ=255) gCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAAcc > 2:521223/1‑140 (MQ=255) cGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAAccc > 2:398851/1‑140 (MQ=255) cGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAAccc > 2:1001579/1‑140 (MQ=255) cGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAAccc > 2:213915/1‑140 (MQ=255) gACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCg > 1:250817/1‑140 (MQ=255) tttttttAATTGAAAGTTTTGGGTTGCTGATATTTTGAGTTGTTCTTTTCTTTTAAAATATCTATATGGTTTTTTTAATGTATTTTTTTTTTAAAATTTTTTG‑TTTTTTGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAAcg < 2:234225/138‑1 (MQ=255) tttttAATTGAAATTATTGGTTTGCTAATATTTTGAGTTTTTTTTTTTTTTTTAAATATCTATATAGGTTTTTTAATGGTTTTTTTTTTTAAATTTTTTTG‑TTTTTAGCAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAAcggc < 2:250817/140‑1 (MQ=255) tttAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAAcggcgg > 2:328677/1‑140 (MQ=255) tttAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTA‑TTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCggg > 1:876469/1‑140 (MQ=255) ggAAATTATGGGGTTTCTAAAAATTGGAGCTTTTTTTTTTTTTTAAAATATTTATATGGTTCTGTTAATGTTTTTTTTTTTTAAATTTTTTTG‑TGTTTAGTCATATAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTaaa < 2:901933/139‑1 (MQ=255) aaaGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAat > 2:439922/1‑140 (MQ=255) cTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGc > 1:901673/1‑140 (MQ=255) cTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGc > 1:903280/1‑140 (MQ=255) aaTTTGAGCTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTTATATTGGTTTTTTAATGTTTTTTATTTTTATAATTTTTTG‑TGTTTGGGAAAATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCa < 2:186689/140‑1 (MQ=255) aTTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGGTAAAATATTTACAACTTAGCAATCaa > 1:186689/1‑140 (MQ=255) gAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATAGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGGTAAAATATTTACCAATTAGCAATCAACCAt > 2:729151/1‑140 (MQ=255) agtttttcttttcttTTTAAATATCTATATAGGTCTTTTAATGGATTTTATTTTTAAATTTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCATCCAtt < 1:93500/135‑1 (MQ=255) aGCTTTTCTATTTTTTTTAAATATCTATATAGTTCTTTTAATGAATTTTATTTTTAAATTTTTTTG‑TTTTTAGGCATAAAAAAATAACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCAtt < 2:636571/140‑1 (MQ=255) gtttttttATTTTTTTTAAATATCTATATAGGTTTGTTAATGGTTTTTATTTTTACATTTTTTTG‑TGTTTAGGCATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTa < 2:451135/133‑1 (MQ=255) cTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTaa > 2:236468/1‑140 (MQ=255) ttCTTTTTTTTTAAAATATCTATATAGGTCTTTTAATGGATTTTATTTTTAAATTTTTTTG‑TGTTTAGGAATAAAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGc < 1:1037939/140‑1 (MQ=255) ttttttAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TTTTTAGGAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGatat < 1:672028/139‑1 (MQ=255) tttttaAAATATTTATATAGGTTTTTTAATGGTTTTTTTTTTTACATTTTTTTG‑TTTTTAGGAATATAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGatat < 2:855157/139‑1 (MQ=255) tttAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGGACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGc > 1:354384/1‑140 (MQ=255) 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(MQ=255) gTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGtttt > 1:199404/1‑140 (MQ=255) gTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGtttt > 2:59868/1‑140 (MQ=255) ttGTTAATGGTTTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TTTTTAGCCATAAAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTc < 2:3293/139‑1 (MQ=255) tGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCa > 2:842784/1‑140 (MQ=255) tGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCa > 1:507426/1‑140 (MQ=255) tGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCa > 1:595658/1‑140 (MQ=255) tGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAAACAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCa > 2:504651/1‑140 (MQ=255) tGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTAAAACTTAGCAAACAAACATTAAACCTTGATATCGCTTTTAAAGGCGCGgttttta > 1:3293/1‑138 (MQ=255) tttATTGGTTTTTATTTTTACAATTTTTTT‑TTTTTAGGAATAAAAAAACCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 1:1047096/139‑1 (MQ=255) tttAATGGTTTTTTTTTTTAAAATTTTTTG‑TGTTTAGGAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAATGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 2:108800/139‑1 (MQ=255) tttAATGGTTTTTATTTTTACATTTTTTTT‑TTTTTAGGAATAAAAAAACCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 2:1081153/139‑1 (MQ=255) tttAATGGTTTTTATTTTTACATTTTTTTG‑TTTTTAGGCATAAAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 2:129137/139‑1 (MQ=255) gTTAAGGGTTTTTATTTTTAGATTTTTTTT‑TGTTGAGGAAAATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 1:1020092/140‑1 (MQ=255) ttAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCata > 1:752525/1‑140 (MQ=255) attGGATTTTATTTTTATAATTTTTTG‑TTTTTAGGCTTATAAAAAACATCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATc < 1:1001579/138‑1 (MQ=255) aaTGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATc < 1:842784/140‑1 (MQ=255) aaTGGATTTTATTTTTAAATTTTTTTG‑TGTTTAGGAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATc < 1:521223/140‑1 (MQ=255) ggATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTGGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTg > 2:176829/1‑140 (MQ=255) ggATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTg > 2:514625/1‑140 (MQ=255) ttattttTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATAc > 1:758458/1‑140 (MQ=255) ttattttTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATAAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATAc > 1:691618/1‑140 (MQ=255) ttttttACATTTTTTTG‑TTTTTAGGCATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAg < 1:328677/139‑1 (MQ=255) ttACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGa > 2:146390/1‑140 (MQ=255) atttttttG‑TTTTTAGGAAAAAAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGAcgcg < 2:934896/138‑1 (MQ=255) aTTTTTTGCTTTTTAAACATATAAAAGCCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGAcgcg < 2:119904/140‑1 (MQ=255) ttG‑TTTTTAGGCATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACggg < 1:89561/140‑1 (MQ=255) tg‑ttTTTAGGCATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGc < 1:213915/140‑1 (MQ=255) tg‑ttTTTAGGAACAAAAAATCCAAGCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGc < 2:880997/140‑1 (MQ=255) tg‑ttTTTAGAAATAAAAAAACCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGc < 2:901673/140‑1 (MQ=255) tg‑tgTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGc < 1:273381/140‑1 (MQ=255) g‑tgtTTAGAAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCa < 2:199404/140‑1 (MQ=255) ttttttAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCa < 1:603485/137‑1 (MQ=255) ttttttAGGAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCa < 1:1164782/137‑1 (MQ=255) tttttAGGAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCaa < 2:727197/138‑1 (MQ=255) tgtTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCaa < 1:439922/140‑1 (MQ=255) tAGGCATAAAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCtt < 1:414563/140‑1 (MQ=255) tAGACATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCtt < 2:329206/140‑1 (MQ=255) tataAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTTATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCTTCATAcc > 2:55223/1‑140 (MQ=255) | GGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCTTCATACC > NC_000913/752986‑753262 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |