| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 802,118 | 0 | A | C | 25.0% | 128.9 / 11.9 | 60 | T78P (ACC→CCC) | ybhI | putative tricarboxylate transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/6); new base C (0/15); total (39/21) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.02e-09 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCA > NC_000913/801985‑802256 | ggTGTTTTTTGGTTTTTCCCTGGGGGCCTTTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGACCCTGTCGTACTGTTATTTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAACCCA‑ccg < 2:921790/140‑1 (MQ=255)ggTGTTTTTTGGTATTTCCCTGGCGGCCATTGGGGGGCTGTTTATCAAGCTTTCCCCGGACCCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAACCCA‑ccg < 2:46974/140‑1 (MQ=255)ggTGTTTTTGGGTTTTCCCCTGGGGCCCTTTGTGGGGCTGGTTATCAAGCTTTTCCCGGATCCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTCCTGCCTCAATGGGGGTGGTCGGTATCTTTCCCGGCGGGCCTTTTAAACCCA‑ccg < 2:947505/140‑1 (MQ=255) gtgtTTTTTGGTTTTTCCCTGGCGGCCATTGTGGGGTTGGTTATCAAGCCTTCCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTAAAGGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCTTTTAAACCCA‑ccgc < 2:301175/140‑1 (MQ=255) tgttttttGTTATTTCCCTGGCGGCCTTTGTGGGGCTGGTTATCAACCCTTCCCCGGACCCTGTCGTACTTTTAATTGCCGTTGCTCCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAACCCA‑ccgcc < 2:1309509/137‑1 (MQ=255) gCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑ccgccg > 2:176866/1‑140 (MQ=255) tttttGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTa > 1:84321/1‑140 (MQ=255) tttttGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTa > 1:958479/1‑140 (MQ=255) ttttGTTATTTCCCGGGCGCCATTTGGGGGGTTGTTTATCAGGCTTTCCCCGGACCCTTTCTTCTTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTAAAGGGTGGTGGTGGGTAATTTACCCGACGGTGCTTTAAAACCCA‑CCGCCGTAt < 2:1214540/140‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTACCTGGCGGCCTTTGGGGGGCTGTTTATCAACCTTTCCCCGGACCCTGTCGTGCTGTTAATTGCCGTTGCTCCCCAAATGGTGGGGGTCGGTATCTTACCCGACGGTGTTTTTAAACCCA‑CCGCCGTATTa < 2:540111/140‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCCATTGGGGGGCTGTTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTTTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAACCCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTAc < 1:941150/139‑1 (MQ=255) aCCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTAc > 1:82756/1‑140 (MQ=255) aCCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTAc > 1:878034/1‑140 (MQ=255) gcggcCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTc > 1:1575426/1‑140 (MQ=255) gcggcCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTc > 1:247413/1‑140 (MQ=255) cATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTa > 1:647953/1‑140 (MQ=255) tttGGGGGGCTGTTTATCAAGCCTTCCCCGGACCTTTTTGTACTGTTATTTGCCGTTGCTCCCTAAATGGTGGGGGTCGTTATTTTTTCCGAGGGTGCTTTAAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTac < 2:1316757/139‑1 (MQ=255) aTTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTac < 2:1166670/140‑1 (MQ=255) tggggggCTGTTTATCAAGCCTTTCCGGGACCCTGTCGTACTTTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAAGGGGGGTGGTCGGTAATTTATCCGCCGGTGCTTTAAAACCCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTacca < 2:1530548/137‑1 (MQ=255) ggTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACctggctgg > 1:491209/1‑140 (MQ=255) tttATCAACCCTTCCGCGGACCCTGTCTTCCTGTAATTTGCCTTCGCCCCCTAATGGGGGGTGGGCCAT‑ATTTTTCCAACGGGCGGTTTAAAACCACCCGCCGTATTAAGCGGTTACTATTCAGGTACCACCTGGCTGgt < 2:1173735/139‑1 (MQ=255) gTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACctggctggg > 2:277342/1‑139 (MQ=255) gTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGgt > 2:1581922/1‑140 (MQ=255) gTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGgt > 1:488621/1‑140 (MQ=255) gTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGgt > 2:126692/1‑140 (MQ=255) cTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCg > 1:1189321/1‑140 (MQ=255) ttccccGGACCCTGTCGTACTTTTAATTGCCGTTGCTCCCTCAATGGTGGTGGTGGGTAACTTATCCGCCGGTGCGTTAAAACCCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGt < 2:488621/137‑1 (MQ=255) ttCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGtt > 2:1432995/1‑140 (MQ=255) ttCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGCGTTCTCGGCGtt > 1:1603905/1‑140 (MQ=255) tCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGttt > 1:1026547/1‑140 (MQ=255) ccccGGACCCTGTTGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTAAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGAGGGTGCTTTAAAACCCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGttt < 2:1385478/139‑1 (MQ=255) tgtattACTTTTATTTGCGGTTGCGACTTCAATGGTGGTGGTTGGTAATTAATCCGGCGGTGCGTTTAACCCCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAgcg < 2:906726/135‑1 (MQ=255) tGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAACCCA‑CCGCCGTGTTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAgcg < 1:187226/140‑1 (MQ=255) tGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCAttt > 2:447371/1‑140 (MQ=255) gTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTGCTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTtg > 1:1372552/1‑140 (MQ=255) gTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTtg > 2:1626360/1‑140 (MQ=255) gTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTtg > 1:1700970/1‑140 (MQ=255) tttGCCTTTGCTCCCTCATTGGTGGTGGTCGGTACTTTATCCGAGGGGGCGTTTAAACCCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGac < 2:491209/139‑1 (MQ=255) ttGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTTCTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGacc > 1:1333627/1‑140 (MQ=255) tGCCGTTGCTGCCTAAATGGTGGTGGTCGGTAATTTATCCGACGGTGCTTTAAAACCCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGacca < 2:209823/140‑1 (MQ=255) gCCTTTGCTGCCTCAATGGGGGGGGTCGGTATCTTATCCGGCGGTGGTTTTAAACCCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGaccac < 1:654030/140‑1 (MQ=255) gCCTTTGCTGCCTAAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCTTTTAAACCCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGaccac < 1:537323/140‑1 (MQ=255) cGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCg > 2:381608/1‑140 (MQ=255) cGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCg > 1:1410954/1‑140 (MQ=255) ttGCTGCCTCAATGGGGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTCTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGt > 1:732167/1‑140 (MQ=255) tgctccCTCAAGGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGGCGGTGCTTTTAAACCCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGtt < 2:878034/140‑1 (MQ=255) ctaaaTGGTGGTGGTCGGTACTTTACCCGGGGGTGCTTTTAAACCCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTa < 1:413042/137‑1 (MQ=255) ctaaaTGGTGGTGGTCGGTAATTTATCCGAGGGTGCGTTAAAACCCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTa < 2:1629809/137‑1 (MQ=255) cTCAATGGTGGTGGTCGTTAACTTACCCGACGGGGCGTTAAAACCCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTa < 2:612040/140‑1 (MQ=255) cAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTaaa > 1:837818/1‑140 (MQ=255) gtggtggtCGTTAATTTATCCGAGGGTGTTTTTAAACCCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTAt < 2:1700970/140‑1 (MQ=255) gtggtggtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTAt < 1:1432995/140‑1 (MQ=255) gggttgttCGGAAACTTACCGGAGGGTGCTTTAAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTAt < 2:1637985/133‑1 (MQ=255) ggtggtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTg > 1:1055399/1‑140 (MQ=255) gtggtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTTTTGc > 2:1609422/1‑140 (MQ=255) gtggtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGc > 2:1396524/1‑140 (MQ=255) tggtCGGTAACTTATCCGCCGGTGCTTTTAAACCCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGcc < 1:1605811/140‑1 (MQ=255) tggtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGcc > 2:1372050/1‑140 (MQ=255) gtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTa > 2:223704/1‑140 (MQ=255) gtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTa > 2:600879/1‑140 (MQ=255) ccTTATCCGCCGGTGCTTTTAAACCCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATctgctg < 2:1436685/139‑1 (MQ=255) atttACCCGACGGTGCTTTAAAACCCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATctgctg < 2:23468/138‑1 (MQ=255) aCTTACCCGAGGGTGCTTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATctgctg < 1:626628/140‑1 (MQ=255) cTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGa < 1:1372050/140‑1 (MQ=255) cGACGGTGCTTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTa < 1:176866/140‑1 (MQ=255) cGACGGTGCTTTAAAACCCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTa < 1:1086033/140‑1 (MQ=255) gACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTaa > 2:873728/1‑140 (MQ=255) gACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTaa > 1:1436685/1‑140 (MQ=255) ggggTGCTTTAAAACCCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTaaa < 2:1659653/138‑1 (MQ=255) aCGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTaaa < 1:873728/140‑1 (MQ=255) ggTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAAt > 2:521393/1‑140 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATc > 1:982858/1‑140 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATc > 2:213299/1‑140 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATc > 2:970604/1‑140 (MQ=255) ccctttAAACCCC‑CCGCCGTATTAAGCGGTTGCTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCgg < 2:1378128/137‑1 (MQ=255) cGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGt > 1:231599/1‑140 (MQ=255) gTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTa < 1:970604/140‑1 (MQ=255) aaCCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAAcacca > 1:1309154/1‑140 (MQ=255) | GGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCA‑CCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCA > NC_000913/801985‑802256 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |