| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,290,662 | C→A | L617M (CTG→ATG) | yraJ → | putative fimbrial usher protein YraJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,290,662 | 0 | C | A | 98.4% | 444.9 / ‑5.0 | 128 | L617M (CTG→ATG) | yraJ | putative fimbrial usher protein YraJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base A (58/68); minor base G (1/1); total (59/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
GTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACAGCAGCCAATACAATTACGGCGTTACCGGCGGCGTGGTTATCCA > NC_000913/3290526‑3290798 | gTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTCCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATgg > 1:319395/1‑140 (MQ=255) ttAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGa > 2:566567/1‑140 (MQ=255) tAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGAt > 1:1033687/1‑140 (MQ=255) gAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATgg > 1:57172/1‑139 (MQ=255) gAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGa > 2:233467/1‑140 (MQ=255) gAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGa > 1:1610757/1‑140 (MQ=255) gAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGa > 2:151135/1‑140 (MQ=255) gAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGa > 1:1366233/1‑140 (MQ=255) agccTGGTTACCGCGTAGCCGGGGTTCCTATCGTATGACGAGCCAGAAAGATCCCGCAACCTAACTTGAGATGCGGCTTGATGGGTAACTTCTGGGTGATGGACGTCTGAGGTATAGGCGGAAACAAAGTATGGATGagg > 2:1172180/4‑138 (MQ=255) aCGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGCTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACg > 1:703817/1‑140 (MQ=255) cTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATa > 2:929796/1‑140 (MQ=255) cTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATa < 1:181283/140‑1 (MQ=255) cTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATa < 1:1579650/140‑1 (MQ=255) cTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATa < 2:1064880/140‑1 (MQ=255) cTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATa < 2:1128204/140‑1 (MQ=255) cTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATa < 1:1180612/140‑1 (MQ=255) ggTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATaac < 2:975938/140‑1 (MQ=255) ggTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATaac < 2:135801/140‑1 (MQ=255) ggTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATaac < 2:399241/140‑1 (MQ=255) ggTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATaac < 1:233467/140‑1 (MQ=255) ggTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATaac < 2:712364/140‑1 (MQ=255) gTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATaaca < 1:1182383/140‑1 (MQ=255) gTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATaaca < 1:867698/140‑1 (MQ=255) tACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATaacaac < 1:784236/140‑1 (MQ=255) ccGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCa < 2:1033687/140‑1 (MQ=255) ccGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCa < 1:896051/140‑1 (MQ=255) ccGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCa < 2:1100655/140‑1 (MQ=255) cgTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATaa > 2:320867/1‑140 (MQ=255) gTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATa > 1:718573/1‑129 (MQ=255) gTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATa < 2:718573/129‑1 (MQ=255) gTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAAc > 1:514712/1‑140 (MQ=255) gCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGt > 1:954778/1‑140 (MQ=255) gggTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGATCAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGc < 2:1366233/140‑1 (MQ=255) tttCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTg > 1:1081592/1‑140 (MQ=255) ttCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGa < 1:492893/140‑1 (MQ=255) ttCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGa < 1:151135/140‑1 (MQ=255) ttCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGa < 2:505390/140‑1 (MQ=255) tATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGc > 2:1185632/1‑140 (MQ=255) tATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGc > 1:552729/1‑140 (MQ=255) gATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGtt > 1:1350496/1‑140 (MQ=255) aTGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTa > 2:231671/1‑140 (MQ=255) aTGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTa > 2:202624/1‑140 (MQ=255) aTGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTa > 2:1115882/1‑140 (MQ=255) aTGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCGCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTa > 2:988301/1‑140 (MQ=255) aCCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCg > 1:1280382/1‑140 (MQ=255) ccagccagAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGt < 1:1671085/140‑1 (MQ=255) cagccagAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGtt < 1:617087/140‑1 (MQ=255) cagccagAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGtt > 1:1473222/1‑140 (MQ=255) ccagAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCAc < 2:142104/140‑1 (MQ=255) cGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCAc > 2:1117453/1‑140 (MQ=255) aacccaacATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCa < 2:157966/140‑1 (MQ=255) ccaacATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGCTGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTg > 2:110102/1‑140 (MQ=255) acATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCg < 1:552873/140‑1 (MQ=255) aTGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGa < 1:343282/140‑1 (MQ=255) aTGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGa < 2:81092/140‑1 (MQ=255) aTGAAACGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGa < 1:1238900/140‑1 (MQ=255) tGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCTCCTCCAGTGCCGGAt < 2:622592/140‑1 (MQ=255) aaaTGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATAc < 1:1185632/140‑1 (MQ=255) aaTGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACa > 2:17910/1‑140 (MQ=255) aaTGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACa > 1:695960/1‑140 (MQ=255) aTGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAg > 2:807785/1‑140 (MQ=255) gCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCGCCTTCAGTGCCGGATACAGCt < 1:1052195/140‑1 (MQ=255) cGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTa > 2:554982/1‑140 (MQ=255) gTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGc < 2:579224/127‑1 (MQ=255) gTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGc > 1:579224/1‑127 (MQ=255) gTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTAc > 2:369180/1‑140 (MQ=255) gTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTAc > 2:798791/1‑140 (MQ=255) ttGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGt > 1:731899/1‑140 (MQ=255) cTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGAca < 1:998964/140‑1 (MQ=255) cTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGCTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGAca < 2:204766/140‑1 (MQ=255) tCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGAcag < 2:1081592/140‑1 (MQ=255) cACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGAcagc > 1:309825/1‑140 (MQ=255) cACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGAcagc < 1:369180/140‑1 (MQ=255) aCTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGgcagca < 1:988301/140‑1 (MQ=255) aCTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGAcagca < 1:807785/140‑1 (MQ=255) aCTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGAcagca > 2:754298/1‑140 (MQ=255) aCTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGAcagca > 1:440882/1‑140 (MQ=255) aCTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGAcagca < 1:1513458/140‑1 (MQ=255) tgctgGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACagcagc > 1:757061/1‑140 (MQ=255) tgGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACAGCAGCCaa < 1:1133384/140‑1 (MQ=255) gatgatGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACAGCAGCCAATa > 2:769940/1‑140 (MQ=255) tgGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACAGCAGCCAATACAAtt > 2:1209696/1‑140 (MQ=255) tgGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACAGCAGCCAATACAAtt > 2:465180/1‑140 (MQ=255) gTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACAGCAGCCAATACAATTAc > 2:1596971/1‑140 (MQ=255) gAGCTATAGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACAGCAGCCAATACAATTACGGCGTTa < 1:17910/140‑1 (MQ=255) taGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACAGCAGCCAATACAATTACGGCGTTACcggcg < 1:1117453/140‑1 (MQ=255) taGCCTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACAGCAGCCAATACAATTACGGCGTTACcggcg > 2:674739/1‑140 (MQ=255) ccTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACAGCAGCCAATACAATTACGGCGTTACCGgcggcg < 2:57172/140‑1 (MQ=255) cTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACAGCAGCCAATACAATTACGGCGTTACCGGCGGCGt < 1:110102/140‑1 (MQ=255) cTGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACAGCAGCCAATACAATTACGGCGTTACCGGCGGCGt < 2:319395/140‑1 (MQ=255) tGGAACAAAGTGTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACAGCAGCCAATACAATTACGGCGTTACCGGCGGCGTg > 2:631617/1‑140 (MQ=255) tGGAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACAGCAGCCAATACAATTACGGCGTTACCGGCGGCGTg < 2:1632165/140‑1 (MQ=255) ggAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACAGCAGCCAATACAATTACGGCGTTACCGGCGGCGTgg > 1:181732/1‑140 (MQ=255) ggAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACAGCAGCCAATACAATTACGGCGTTACCGGCGGCGTgg > 2:1158144/1‑140 (MQ=255) gAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACGGCTACGGTAATGACAGCAGCCAATACAATTACGGCGTTACCGGCGGCGTGGt > 1:837726/1‑140 (MQ=255) gAACAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACAGCAGCCAATACAATTACGGCGTTACCGGCGGCGTGGt > 1:1112458/1‑140 (MQ=255) aaCAAAGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACAGCAGCCAATACAATTACGGCGTTACCGGCGGCGTGGtt < 2:181732/140‑1 (MQ=255) aaaGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGTTACGGTAATGACAGCAGCCAATACAATTACGGCGTTACCGGCGGCGTGGTTatc < 1:20355/140‑1 (MQ=255) aaGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACAGCAGCCAATACAATTACGGCGTTACCGGCGGCGTGGTTatcc > 2:298033/1‑140 (MQ=255) aGTATGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACAGCAGCCAATACAATTACGGCGTTACCGGCGGCGTGGTTatcca < 1:149142/140‑1 (MQ=255) | GTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCGCCCAACCCAACATGAAATGCGTCTTGATGGCTCACTGCTGGATGATGGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAACGCCAGTTACCGTTCACCTTATGGCACCTTCAGTGCCGGATACAGCTACGGTAATGACAGCAGCCAATACAATTACGGCGTTACCGGCGGCGTGGTTATCCA > NC_000913/3290526‑3290798 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |