| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,505,597 | G→T | H142N (CAT→AAT) | yhfS ← | putative aminotransferase YhfS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,505,597 | 0 | G | T | 98.0% | 343.9 / 0.3 | 99 | H142N (CAT→AAT) | yhfS | putative aminotransferase YhfS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base T (35/62); total (36/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.18e-01 | |||||||||||
ACAGCCGATTCGAGCCACCTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATGCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTGTCGTCGGGTAAACAGGCGCGTCA > NC_000913/3505472‑3505733 | acaGCCGATTCGAGCCACCTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGcgccg > 2:213408/1‑140 (MQ=255) aGCCGATTCGAGCCACCTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCa < 2:1096649/140‑1 (MQ=255) ccGATTCGAGCCACCTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATc < 1:1063112/140‑1 (MQ=255) ccGATTCGAGCCACCTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATc < 1:923271/140‑1 (MQ=255) gATTCGAGCCACCTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCg > 2:1207056/1‑140 (MQ=255) aTTCGAGCCACCTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCgg > 2:479133/1‑140 (MQ=255) aTTCGAGCCACCTTCATCACCGAATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCgg > 2:1303246/1‑140 (MQ=255) cttccTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACGCCTGCCGCGCGCAGCGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGc < 2:494039/137‑1 (MQ=255) cACCTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCt < 2:597654/140‑1 (MQ=255) cACCTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCt < 2:925591/140‑1 (MQ=255) cACCTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCt < 1:990158/140‑1 (MQ=255) cACCTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCt < 1:697254/140‑1 (MQ=255) ccTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCtcg > 2:951884/1‑140 (MQ=255) cTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCtcgt > 1:105162/1‑140 (MQ=255) cTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATGCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCtcgt > 1:161560/1‑140 (MQ=255) tcatcaCCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCtcgtcg < 1:479133/140‑1 (MQ=255) catcaCCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCCCCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTcga < 2:874782/140‑1 (MQ=255) catcaCCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTcga < 2:1002841/140‑1 (MQ=255) tcaCCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTcgacg < 1:836070/140‑1 (MQ=255) tcaCCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTcgacg < 1:796601/140‑1 (MQ=255) aCCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCgacgac > 1:910128/1‑140 (MQ=255) cGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCt > 2:168260/1‑140 (MQ=255) cGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCt > 2:1391295/1‑140 (MQ=255) gCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTg > 1:1314069/1‑140 (MQ=255) gCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTg > 1:667917/1‑140 (MQ=255) cATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGc > 2:436961/1‑140 (MQ=255) aTAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCt < 2:929546/140‑1 (MQ=255) aTAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCt < 1:593425/140‑1 (MQ=255) aGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTc > 2:493842/1‑140 (MQ=255) ttGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAg > 2:421635/1‑140 (MQ=255) ttGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAg > 1:1298966/1‑140 (MQ=255) tGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGt < 2:621105/140‑1 (MQ=255) tCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGc > 1:1206114/1‑140 (MQ=255) aTCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCg < 1:918244/140‑1 (MQ=255) tCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGa < 1:1078587/140‑1 (MQ=255) tCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGa < 1:1207056/140‑1 (MQ=255) tCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGa < 1:48438/140‑1 (MQ=255) cGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGTCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGAc < 1:971031/140‑1 (MQ=255) ttAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAgg < 1:444298/140‑1 (MQ=255) ttAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATGCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAgg < 2:161560/140‑1 (MQ=255) aCGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCa < 2:1298966/140‑1 (MQ=255) cGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCAt > 1:1088009/1‑140 (MQ=255) tGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGa > 1:1165689/1‑140 (MQ=255) ggAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGaa < 2:105162/140‑1 (MQ=255) ggAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGaa < 1:1451860/140‑1 (MQ=255) aaCACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAAt < 1:679614/140‑1 (MQ=255) acacCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATc < 2:1088009/140‑1 (MQ=255) cacCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCa < 1:951884/140‑1 (MQ=255) cacCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCa < 1:744615/140‑1 (MQ=255) cacCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCa < 2:103750/140‑1 (MQ=255) cacCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCa < 1:1303246/140‑1 (MQ=255) acCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCaa < 2:1420918/140‑1 (MQ=255) ccTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAAc < 2:807698/140‑1 (MQ=255) ccTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAAc < 2:1366338/140‑1 (MQ=255) ccTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAAc > 2:603048/1‑140 (MQ=255) ccTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTACCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAAc < 2:687716/140‑1 (MQ=255) cgcgcgCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACTACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGtaa > 1:177571/1‑140 (MQ=255) gcgcgcAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGtaat > 2:356543/1‑140 (MQ=255) gcgcgcAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGtaat > 2:627177/1‑140 (MQ=255) cgcgcAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGtaata < 2:220214/140‑1 (MQ=255) gcgcAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGtaataa > 1:618009/1‑140 (MQ=255) cAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCg < 1:493842/140‑1 (MQ=255) cAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCg < 1:792366/140‑1 (MQ=255) aaCGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCg < 2:1177328/139‑1 (MQ=255) aaCGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCg > 1:1177328/1‑139 (MQ=255) tGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGcc > 1:688501/1‑140 (MQ=255) ccAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGcccc > 2:1329712/1‑140 (MQ=255) aGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCAt < 1:245925/140‑1 (MQ=255) acaTCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTg < 1:213408/140‑1 (MQ=255) acaTCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTg < 2:688501/140‑1 (MQ=255) acaTCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTg < 2:1060560/140‑1 (MQ=255) aTCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCAgctgct < 1:733400/140‑1 (MQ=255) aTCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCt < 1:1343295/140‑1 (MQ=255) aTCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCt < 1:279378/140‑1 (MQ=255) aTCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCt < 1:39023/140‑1 (MQ=255) aTCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCt < 1:421635/140‑1 (MQ=255) aTCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCt < 2:772209/140‑1 (MQ=255) aTCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGCAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCt < 2:211145/140‑1 (MQ=255) aTCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCGCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCt < 2:95447/140‑1 (MQ=255) aTCTGCCAGCACGTAGCGGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCt < 1:1221781/140‑1 (MQ=255) tCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTc < 2:1389301/140‑1 (MQ=255) cTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCa < 1:993551/140‑1 (MQ=255) aCGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGcccc < 1:728525/123‑1 (MQ=255) aCGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGcccc > 2:728525/1‑123 (MQ=255) gTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAAccc > 2:50175/1‑140 (MQ=255) aGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCgt > 2:853615/1‑140 (MQ=255) gTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTgtcg < 1:1209735/140‑1 (MQ=255) gTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTgtcg < 1:853615/140‑1 (MQ=255) ccTGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTgtcgtc < 2:1165689/140‑1 (MQ=255) tGCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACTACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTGTCGTCgg < 2:177571/140‑1 (MQ=255) gCGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTGTCGTCggg < 2:217713/140‑1 (MQ=255) cGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCgtg > 2:1231524/1‑131 (MQ=255) cGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCgtg < 1:1231524/131‑1 (MQ=255) cGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTGTCGTCGGGt > 2:1119775/1‑140 (MQ=255) cGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTGTCGTCGGGt > 1:553348/1‑140 (MQ=255) cGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTGTCGTCGGGt > 2:1097085/1‑140 (MQ=255) cGGCTGCTGGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTGTCGTCGGGt > 2:571659/1‑140 (MQ=255) tgctgGCGCGTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTGTCGTCGGGTAAAc > 2:101081/1‑140 (MQ=255) gcacgTATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTGTCGTCGGGTAAACAGgcg < 1:144102/137‑1 (MQ=255) tATTCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTGTCGTCGGGTAAACAGGCGCGTCa < 1:50175/140‑1 (MQ=255) | ACAGCCGATTCGAGCCACCTTCATCACCGCATAGTTGTCATCGGTTAACGCTGGAACACCTGCCGCGCGCAACGTTGCCAGCACATCTGCCAGCACGTAGCTGTCCTGCGGCTGCTGGCGCGTATGCTGCACCAGCGCCGCATCCGGTTGTTGCTCGTCGACGACCTGCTTCAGTGCCGACAGGTCATTGAAATCAACAGTAATAAGCGTCAGCCCCATCTGCTCAATAATAACCCGTGTCGTCGGGTAAACAGGCGCGTCA > NC_000913/3505472‑3505733 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |