Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,058,801 | G→T | R132L (CGC→CTC) | bipA → | ribosome‑dependent GTPase, ribosome assembly factor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,058,801 | 0 | G | T | 98.0% | 344.5 / ‑1.4 | 99 | R132L (CGC→CTC) | bipA | ribosome‑dependent GTPase, ribosome assembly factor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base T (46/51); total (47/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACG > NC_000913/4058665‑4058935 | cGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTccc > 1:109601/1‑140 (MQ=255) tAATGTCCATGGTAGACTCAGTACTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGgc > 1:1212163/1‑140 (MQ=255) aaTGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGgcg < 1:962878/140‑1 (MQ=255) aaTGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGgcg > 2:1096407/1‑140 (MQ=255) aaTGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGgcg < 1:1096407/140‑1 (MQ=255) aaTGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGgcg < 1:404140/140‑1 (MQ=255) aaTGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGgcg < 1:396221/140‑1 (MQ=255) aaTGTCCATGGTAGACTCAGTACTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGgcg < 2:1212163/140‑1 (MQ=255) tGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGgcgcg < 1:271504/140‑1 (MQ=255) ccATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGt > 1:902328/1‑140 (MQ=255) ccATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGt < 2:145/140‑1 (MQ=255) ccATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGt < 2:259045/140‑1 (MQ=255) tGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCt > 2:960354/1‑140 (MQ=255) ggTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTg > 2:132025/1‑140 (MQ=255) aGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGAtt < 1:1248261/140‑1 (MQ=255) aGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGAtt < 2:364718/140‑1 (MQ=255) aGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGAtt < 2:902328/140‑1 (MQ=255) aCTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGAtt < 1:801821/138‑1 (MQ=255) aCTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGAtt > 2:801821/1‑138 (MQ=255) aCTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTgg > 1:988320/1‑140 (MQ=255) aCTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTgg > 1:448788/1‑140 (MQ=255) aCTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTgg > 2:571918/1‑140 (MQ=255) aCTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTgg > 2:640774/1‑140 (MQ=255) tCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGt < 1:692435/140‑1 (MQ=255) tCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGt < 1:294491/140‑1 (MQ=255) cAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGtt < 2:21717/140‑1 (MQ=255) aGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTtg > 2:1236708/1‑140 (MQ=255) aGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTtg > 2:472069/1‑140 (MQ=255) gTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTtgt > 2:610384/1‑140 (MQ=255) gTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTtgt > 1:1042904/1‑140 (MQ=255) gTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTtgt > 1:857484/1‑140 (MQ=255) gTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTtgt > 1:841352/1‑140 (MQ=255) gTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTtgt > 2:571661/1‑140 (MQ=255) tgctgcTGGTGGTTGACGCATTTGACGTCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTtgtg > 1:1044495/1‑140 (MQ=255) tgctgcTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAGCAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGAt > 2:203996/1‑131 (MQ=255) tgctgcTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGAt < 1:203996/131‑1 (MQ=255) tgctgcTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTtgtg > 2:1250768/1‑140 (MQ=255) tgctgcTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTtg > 2:1037432/1‑138 (MQ=255) tgctgcTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTtg < 1:1037432/138‑1 (MQ=255) gctgctGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGAtt > 2:1103482/1‑131 (MQ=255) gctgctGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGAtt < 1:1103482/131‑1 (MQ=255) tgctgGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGAt < 1:132025/140‑1 (MQ=255) tgctgGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGAt < 1:666059/140‑1 (MQ=255) tgctgGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGAt < 1:571918/140‑1 (MQ=255) tgctgGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGAt < 2:857484/140‑1 (MQ=255) ctgGTGGTTGATGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCa > 2:1106635/1‑140 (MQ=255) ctgGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTATGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCa > 2:890563/1‑140 (MQ=255) ctgGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCa < 1:695879/140‑1 (MQ=255) ctgGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCa < 1:1156660/140‑1 (MQ=255) ctgGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCa > 2:695879/1‑140 (MQ=255) ctgGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCa < 2:887278/140‑1 (MQ=255) ctgGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCa < 1:960354/140‑1 (MQ=255) ctgGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCa > 1:60618/1‑140 (MQ=255) ctgGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAACCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCa > 1:980225/1‑140 (MQ=255) ggtggtTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAgg < 1:610384/140‑1 (MQ=255) gtggtTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGAt < 2:785734/135‑1 (MQ=255) gtggtTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGAt > 1:785734/1‑135 (MQ=255) ggtTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTAt < 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< 1:1236708/140‑1 (MQ=255) cATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTg < 2:60618/140‑1 (MQ=255) aTTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGt < 2:710147/140‑1 (MQ=255) ttGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTc > 1:1209899/1‑140 (MQ=255) gCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAAc < 2:823215/140‑1 (MQ=255) gATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCg > 1:1106327/1‑140 (MQ=255) gCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGAcg > 2:283640/1‑140 (MQ=255) cAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGcgac > 1:159711/1‑140 (MQ=255) cAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGcgac > 2:1022389/1‑140 (MQ=255) cAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGcga > 1:605099/1‑139 (MQ=255) cAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGcga < 2:605099/139‑1 (MQ=255) aaCGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGcgaccg < 1:283640/140‑1 (MQ=255) gcgcTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACcgacg < 1:1022389/140‑1 (MQ=255) cTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGagc > 1:581441/1‑140 (MQ=255) tAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTg < 1:752876/140‑1 (MQ=255) aCCAAAAAAGCGTTTGCTTATGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGa < 1:890563/140‑1 (MQ=255) aaGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCg < 2:109601/140‑1 (MQ=255) aGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGa > 2:1092869/1‑140 (MQ=255) ttGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGtt < 2:841352/140‑1 (MQ=255) gCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTa > 1:1253146/1‑140 (MQ=255) tACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCGGATCGTTTACGc > 2:186485/1‑140 (MQ=255) ccTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTg > 1:330193/1‑140 (MQ=255) tGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTgcg > 2:72723/1‑140 (MQ=255) tGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTgcg < 1:1250768/140‑1 (MQ=255) gAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTgcgc > 2:1012237/1‑140 (MQ=255) aTTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACgg > 1:591715/1‑140 (MQ=255) tgttATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGTTTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCGGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATcg < 1:186485/140‑1 (MQ=255) tgttATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATcg < 2:706243/140‑1 (MQ=255) tgttATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATcg < 1:1297631/140‑1 (MQ=255) tgttATCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATcg < 2:591715/140‑1 (MQ=255) aTCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTgcg < 1:343335/123‑1 (MQ=255) aTCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTgcg > 2:343335/1‑123 (MQ=255) aTCAACAAAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCggg > 1:1145712/1‑140 (MQ=255) caacaaAGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTc < 2:330193/140‑1 (MQ=255) aGTTGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGAcc > 2:1293757/1‑140 (MQ=255) tGACCTCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACg < 1:1293757/140‑1 (MQ=255) | CGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACG > NC_000913/4058665‑4058935 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |