| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,796,765 | G→T | G263W (GGG→TGG) | waaC → | ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,796,765 | 0 | G | T | 99.1% | 381.1 / ‑3.5 | 111 | G263W (GGG→TGG) | waaC | ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base T (52/58); total (53/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.68e-01 | |||||||||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
GGGCGCGCCGCATGAGGAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATTTAATTAACCTCAA > NC_000913/3796629‑3796901 | gggCGCGCCGCATGAGGAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGt > 1:1051752/1‑140 (MQ=255) gcgcgcCGCATGAGGAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTa > 1:702109/1‑140 (MQ=255) cgcgcCGCATGAGGAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTaa > 1:753602/1‑140 (MQ=255) cgcgcCGCATGAGGAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTaa > 2:607448/1‑140 (MQ=255) cgccgcATGAGGAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTa < 1:418142/137‑1 (MQ=255) cgccgcATGAGGAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGc > 2:282715/1‑140 (MQ=255) cgccgcATGAGGAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGc > 2:1296087/1‑140 (MQ=255) ccgcATGAGGAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCa < 2:30771/140‑1 (MQ=255) aTGAGGAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTa > 2:451754/1‑140 (MQ=255) tGAGGAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTaa < 2:1051752/140‑1 (MQ=255) ggAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAAcgg < 1:1040813/140‑1 (MQ=255) ggAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAAcgg < 2:1621594/140‑1 (MQ=255) ggAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAAcgg < 2:374964/140‑1 (MQ=255) ggAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAAcgg < 1:451754/140‑1 (MQ=255) ggAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAAcgg < 2:658800/140‑1 (MQ=255) ggAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAAcgg < 1:1619192/140‑1 (MQ=255) ggAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAAcgg < 1:1209890/140‑1 (MQ=255) gaagaaCGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAAcggc > 1:1473464/1‑140 (MQ=255) agaaCGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAAcggcgg > 1:1614537/1‑140 (MQ=255) aaCGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAg < 1:1672929/124‑1 (MQ=255) aaCGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCa > 1:1644627/1‑140 (MQ=255) aaCGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCa < 2:1473464/140‑1 (MQ=255) aaCGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCa < 2:1602432/140‑1 (MQ=255) aCGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCAc > 1:1193860/1‑140 (MQ=255) gggCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTg < 2:297953/140‑1 (MQ=255) ggCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCACTTAACGGCGGCACTgg < 1:1663639/140‑1 (MQ=255) gCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCAc > 1:1481474/1‑136 (MQ=255) gCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGa < 1:441604/140‑1 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2:1044830/140‑1 (MQ=255) aaCGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGa < 2:404137/140‑1 (MQ=255) aCGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGa < 2:1502195/139‑1 (MQ=255) aCGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGa > 1:1502195/1‑139 (MQ=255) aCGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGAc > 2:251129/1‑140 (MQ=255) gCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAatat > 1:597453/1‑140 (MQ=255) ggAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCa < 1:251129/140‑1 (MQ=255) ggAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCa < 1:1296087/140‑1 (MQ=255) ggAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGAGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCa > 1:560050/1‑140 (MQ=255) gAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCAc < 1:457971/140‑1 (MQ=255) ttGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCAc > 1:713706/1‑133 (MQ=255) ttGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCAc < 2:713706/133‑1 (MQ=255) ttGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTAt < 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> 2:1147194/1‑140 (MQ=255) ttGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCggg > 1:769180/1‑140 (MQ=255) ttGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCggg < 2:1644627/140‑1 (MQ=255) ttGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCggg > 2:435646/1‑140 (MQ=255) ttGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCggg > 1:1290652/1‑140 (MQ=255) tGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCAAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGa > 1:1465864/1‑140 (MQ=255) gCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGAt > 2:620974/1‑140 (MQ=255) gCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGAt < 1:229147/140‑1 (MQ=255) gCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGATTTTTGACCAAACGGTCCGGGAt > 2:1387480/1‑140 (MQ=255) ccGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATc > 2:535594/1‑133 (MQ=255) aTGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATtgg < 2:688958/140‑1 (MQ=255) tGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATtggt < 1:1086661/140‑1 (MQ=255) 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2:1282517/140‑1 (MQ=255) tGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATc < 2:1209882/140‑1 (MQ=255) tGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGAACCAATATCACGGTTTTTGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGgacgaaac > 1:318032/1‑138 (MQ=255) cccGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGTGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAg < 2:1456847/140‑1 (MQ=255) cccGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAg < 2:753602/140‑1 (MQ=255) cccGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAg > 1:1634165/1‑140 (MQ=255) cccGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAg < 1:1680027/140‑1 (MQ=255) ccGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGa < 2:1587395/140‑1 (MQ=255) ccGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGa < 1:607448/140‑1 (MQ=255) gTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGt > 1:1417174/1‑140 (MQ=255) ggCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGGTAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGGATGGGAAGAATCAGATGGTATGTa > 1:1473827/1‑140 (MQ=255) gCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAg < 1:1442767/140‑1 (MQ=255) ggCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTc > 1:438149/1‑140 (MQ=255) aaTTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAaga < 1:465901/140‑1 (MQ=255) aaTTTGTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATAACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAaga > 2:770155/1‑140 (MQ=255) gTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGaaaa > 1:1024364/1‑140 (MQ=255) gTAGTGTCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGaaaa > 2:642407/1‑140 (MQ=255) gtCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATttaa > 2:841224/1‑140 (MQ=255) gtCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATttaa < 2:702109/140‑1 (MQ=255) tCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATttaat > 1:1486445/1‑140 (MQ=255) tCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATttaat > 2:1542702/1‑140 (MQ=255) tCGGTGGATACGTGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATttaat < 2:1342330/140‑1 (MQ=255) tCGGTGGATACGGGGTTAAGCCATTTCACGGCGGCCCTGGATAGACCCAATATCACGGATTATGGGCCAACCCATCCAGGGTTTATTGGGGGGAATGGGAAGAATGAGATGGGATGTTGGGCTCCAAGAGACAATttaat > 2:775163/1‑140 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |