| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,787,422 | IS1 (+) +9 bp | pseudogene (1026‑1034/2253 nt) | ygaQ → | putative uncharacterized protein YgaQ |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 57 (1.080) | 40/278 | 0.2 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2787430 | 0 (0.000) | pseudogene (1034/2253 nt) | ygaQ | putative uncharacterized protein YgaQ | |||||
| * | ? | NC_000913 | 2787422 = | 0 (0.000) | 54 (1.020) | 43/278 | 0.2 | 100% | pseudogene (1026/2253 nt) | ygaQ | putative uncharacterized protein YgaQ |
| ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
CCTTAGAGATGTTATCTTTACTTGCTTCGAAGTCTTTTGCAGTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2787558‑2787422‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATG < NC_000913/3584195‑3584058 CCTTAGAGATGTTATCTTTACTTGCTTCGAAGTCTTTTGCAGTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGT > 2:235867/1‑140 TGTTATCTTTACTTGCTTCGAAGTCTTTTGCAGTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTTCTGGTTCTTTGATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCC < 2:267627/140‑1 TGTTATCTTTACTTGCTTCGAAGTCTTTTGCAGTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCC < 2:788116/140‑1 GTTATCTTTACTTGCTTCGAAGTCTTTTGCAGTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCA > 2:46009/1‑140 TTATCTTTACTTGCTTCGAAGTCTTTTGCAGTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAA < 2:217394/140‑1 TTATCTTTACTTGCTTCGAAGTCTTTTGCAGTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAA > 1:447625/1‑140 ATCTTTACTTGCTTCGAAGTCTTTTGCAGTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACT > 1:405438/1‑140 TTTACTTGCTTCGAAGTCTTTTGCAGTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTAT > 2:585540/1‑140 TACTTGCTTCGAAGTCTTTTGCAGTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTG > 1:271210/1‑140 ACTTGCTTCGAAGTCTTTTGCAGTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGA < 2:447625/140‑1 TTGCTTCGAAGTCTTTTGCAGTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATA > 2:291172/1‑140 TGCTTCGAAGTCTTTTGCAGTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG > 2:50597/1‑140 CTTCGAAGTCTTTTGCAGTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG > 1:372592/1‑140 TCGAAGTCTTTTGCAGTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTT > 2:97470/1‑140 GAAGTCTTTTGCAGTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT < 2:234777/140‑1 TCTTTTGCAGTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:46009/140‑1 CTTTTGCAGTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 2:271210/140‑1 CTTTTGCAGTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 1:642188/140‑1 CTTTTGCAGTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 1:266060/140‑1 GTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT < 1:291172/140‑1 TGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA < 2:16919/140‑1 GTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAT < 1:168402/140‑1 TATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC > 2:512399/1‑135 TATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC < 1:512399/135‑1 CTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTT > 1:70727/1‑140 TTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTG < 1:80270/140‑1 TCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGT > 2:657300/1‑140 GGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAT > 1:664685/1‑140 GGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAT > 1:270763/1‑140 GATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATG > 1:726107/1‑140 ATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGC > 1:50714/1‑140 ATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC > 1:66310/1‑123 ATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC < 2:66310/123‑1 GATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGC > 1:320639/1‑140 GTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTT > 2:379593/1‑140 GTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTT > 2:500087/1‑140 CTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAG > 1:887597/1‑140 TTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCC > 1:636621/1‑140 GGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCC < 2:405438/140‑1 CAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGtc > 1:255560/1‑138 ACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGT > 2:283117/1‑140 CTGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGC > 1:639671/1‑140 TGACCTTGCTAATAGTCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGATTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGCGCCAGGTGCT > 1:264820/1‑140 TGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCT < 2:136412/140‑1 TGACCTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCT > 2:410900/1‑140 CTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCT < 1:886296/140‑1 CTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCT > 1:869490/1‑140 CTTGCTAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCT < 1:177739/140‑1 TAATAGCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGAT < 2:726107/140‑1 GCCAGGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGG < 2:270763/140‑1 GGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATG > 2:367082/1‑140 GGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATG > 1:765865/1‑140 GGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATG < 1:500087/140‑1 GGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATG > 1:413710/1‑140 CCTTAGAGATGTTATCTTTACTTGCTTCGAAGTCTTTTGCAGTGAGATGTATATCTTCTGGATGGATTTGTTTACGTTCTTTTGTTACTGGATCTTTAATGAATGGAATCAAAACCTGACCTTGCTAATAGCCAGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2787558‑2787422‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATG < NC_000913/3584195‑3584058 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |