| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 1,526,385 | C→A | L47M (CTG→ATG) | yncG → | putative glutathione S‑transferase YncG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,526,385 | 0 | C | A | 99.4% | 593.7 / ‑3.4 | 167 | L47M (CTG→ATG) | yncG | putative glutathione S‑transferase YncG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (95/71); total (96/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.43e-01 | |||||||||||
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
ATTAAGGTGTATGGCGTACCCGGATGGGGCTCTACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTCCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCCTGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCT > NC_000913/1526250‑1526521 | aTTAAGGTGTATGGCGTACCCGGATGGGGCTCTACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTCCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGaa < 1:1619408/140‑1 (MQ=255) ttAAGGTGTATGGCGTACCCGGATGGGGCTCTACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTCCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAAc < 2:1853442/140‑1 (MQ=255) tAAGGTGTATGGCGTACCCGGATGGGGCTCTACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTCCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAAcc > 2:411826/1‑140 (MQ=255) tAAGGTGTATGGCGTACCCGGATGGGGCTCTACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTCCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAAcc > 2:146311/1‑140 (MQ=255) aGGTGTATGGCGTACCCGGATGGGGCTCTACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTCCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCg > 2:783332/1‑140 (MQ=255) tATGGCGTACCCGGATGGGGCTCTACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTCCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTtgtg > 1:1149054/1‑140 (MQ=255) tATGGCGTACCCGGATGGGGCTCTACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTCCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTtgtg > 2:416944/1‑140 (MQ=255) aTGGCGTACCCGGATGGGGCTCTACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTCCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTgtgt > 1:54617/1‑140 (MQ=255) aTGGCGTACCCGGATGGGGCTCTACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTCCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTgtgt > 1:149073/1‑140 (MQ=255) tGGCGTACCCGGATGGGGCTCTACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTCCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTc > 1:1709920/1‑140 (MQ=255) tGGCGTACCCGGATGGGGCTCTACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTCCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTc < 1:146311/140‑1 (MQ=255) gTACCCGGATGGGGCTCTACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTCCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGt < 1:411826/140‑1 (MQ=255) tACCCGGATGGGGCTCTACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTTCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTc > 1:1977429/1‑135 (MQ=255) tACCCGGATGGGGCTCTACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTTCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTc < 2:1977429/135‑1 (MQ=255) tACCCGGATGGGGCTCTACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTCCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTgtgt > 2:18105/1‑134 (MQ=255) tACCCGGATGGGGCTCTACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTCCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGtt > 2:541066/1‑140 (MQ=255) 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1:783332/140‑1 (MQ=255) gATGGGGCTCTACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTCCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGaca < 2:851140/140‑1 (MQ=255) aTGGGGCTCTACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTCCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGacac > 2:957576/1‑140 (MQ=255) tGGGGCTCTACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTCCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACt > 2:1233518/1‑140 (MQ=255) ctctACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTCCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCAt < 2:1149054/140‑1 (MQ=255) gTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTCCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGAc < 2:1519201/140‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGAtcgt < 1:1784285/140‑1 (MQ=255) aGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGAtcgtcg > 2:1570218/1‑140 (MQ=255) tGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGcc < 2:1594234/140‑1 (MQ=255) tGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGcc < 1:48618/140‑1 (MQ=255) gTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCg < 1:1764638/140‑1 (MQ=255) gTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCg < 1:1357212/140‑1 (MQ=255) ttGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGAc > 2:945942/1‑140 (MQ=255) cGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTgcgc < 1:1310897/140‑1 (MQ=255) gAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGTGcc > 1:718627/1‑140 (MQ=255) gAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGCGcc > 2:1361075/1‑140 (MQ=255) gAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGCGcc > 1:1024925/1‑140 (MQ=255) aGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGCGCCACCgg > 2:672524/1‑140 (MQ=255) gCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGCGCCACCGGt > 1:1376647/1‑140 (MQ=255) tCACGCGAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGCGCCACCGGTTgg < 2:9962/140‑1 (MQ=255) cgcgAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGCGCCACCGGTTGGgcg > 1:1666096/1‑140 (MQ=255) gAGTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGCGCCACCGGTTGGgcgcgc < 1:936463/140‑1 (MQ=255) gTTATTGAAAACCCTGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCg > 2:1714345/1‑140 (MQ=255) gTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCg < 1:1399309/140‑1 (MQ=255) gTTATTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCg > 2:1433318/1‑140 (MQ=255) aTTGAAAACCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAAc > 1:1551259/1‑140 (MQ=255) aCCATGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCt < 2:1551259/140‑1 (MQ=255) | ATTAAGGTGTATGGCGTACCCGGATGGGGCTCTACAATCAGTGAGCTGATGCTAACACTGGCTGATATTCCTTATCAGTTCGTTGATGTCAGTGGTTTTGACCACGAGGGAGCTTCACGCGAGTTATTGAAAACCCTGAACCCGTTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCT > NC_000913/1526250‑1526521 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |