BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_000913	391,095	C→A	pseudogene (845/1458 nt)	yaiT →	putative autotransporter YaiT

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_000913	391,095	0	C	A	100.0%	371.2 / NA	103	pseudogene (845/1458 nt)	yaiT	putative autotransporter YaiT
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (52/51); total (52/51)

Only 100 of 105 total aligned reads displayed.

ATAACAATATCTCTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATT  >  NC_000913/390960‑391226

aTAACAATATCTCTGTAAAAGATTCCAGAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATg                                                                                                                                 <  2:26374/140‑1 (MQ=255)

aTAACAATATCTCTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATg                                                                                                                                 <  1:496173/140‑1 (MQ=255)

  aaCAATATCTCTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTc                                                                                                                               <  1:1173091/140‑1 (MQ=255)

   aCAATATCTCTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTcc                                                                                                                              >  1:1279482/1‑140 (MQ=255)

         tctcTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACt                                                                                                                        >  1:969682/1‑140 (MQ=255)

             tGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCtt                                                                                                                    >  1:631431/1‑140 (MQ=255)

             tGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCtt                                                                                                                    <  1:1177731/140‑1 (MQ=255)

             tGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCtt                                                                                                                    >  1:121397/1‑140 (MQ=255)

             tGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCtt                                                                                                                    <  2:981396/140‑1 (MQ=255)

             tGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCtt                                                                                                                    >  2:263667/1‑140 (MQ=255)

             tGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCtt                                                                                                                    <  1:170523/140‑1 (MQ=255)

              gTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTc                                                                                                                   >  2:1316409/1‑140 (MQ=255)

              gTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTc                                                                                                                   <  1:316258/140‑1 (MQ=255)

               tAAAGGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTc                                                                                                                   >  1:707132/1‑139 (MQ=255)

               tAAAGGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTc                                                                                                                   <  2:707132/139‑1 (MQ=255)

                  aaGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGt                                                                                                               <  1:263667/140‑1 (MQ=255)

                    gATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTc                                                                                                             <  2:30434/140‑1 (MQ=255)

                       tCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAgg                                                                                                                >  2:848424/1‑134 (MQ=255)

                       tCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAgg                                                                                                                <  1:370276/134‑1 (MQ=255)

                       tCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAgg                                                                                                                >  2:370276/1‑134 (MQ=255)

                       tCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAgg                                                                                                                <  1:848424/134‑1 (MQ=255)

                       tCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGa                                                                                                          >  1:658801/1‑140 (MQ=255)

                       tCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGa                                                                                                          <  1:392200/140‑1 (MQ=255)

                       tCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGa                                                                                                          >  1:671750/1‑140 (MQ=255)

                       tCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGa                                                                                                          >  1:1113202/1‑140 (MQ=255)

                         cacaGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACt                                                                                                        >  2:433623/1‑140 (MQ=255)

                         cacaGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACt                                                                                                        <  1:817425/140‑1 (MQ=255)

                            aGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATg                                                                                                     <  2:442863/140‑1 (MQ=255)

                            aGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATg                                                                                                     <  1:1073297/140‑1 (MQ=255)

                            aGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATg                                                                                                     <  1:358328/140‑1 (MQ=255)

                              tGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCg                                                                                                   >  1:987443/1‑140 (MQ=255)

                               gACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGa                                                                                                  >  1:1292092/1‑140 (MQ=255)

                                aCTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGAt                                                                                                 <  1:397469/140‑1 (MQ=255)

                                 cTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATg                                                                                                <  2:1022254/140‑1 (MQ=255)

                                   tCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATgaa                                                                                              >  1:402511/1‑140 (MQ=255)

                                   tCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATgaa                                                                                              >  1:860532/1‑140 (MQ=255)

                                      ggTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATgaagaa                                                                                           <  2:251828/140‑1 (MQ=255)

                                      ggTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATgaagaa                                                                                           <  1:1158264/140‑1 (MQ=255)

                                        ttCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACa                                                                                         >  2:258706/1‑140 (MQ=255)

                                        ttCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGATTCCGACTATGCGATGAAGAACa                                                                                         >  2:626137/1‑140 (MQ=255)

                                          cAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAAt                                                                                       >  1:1219032/1‑140 (MQ=255)

                                             aTTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTa                                                                                    <  2:860532/140‑1 (MQ=255)

                                                atatCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTc                                                                                 <  2:346108/140‑1 (MQ=255)

                                                atatCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTc                                                                                 <  2:1219032/140‑1 (MQ=255)

                                                atatCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTc                                                                                 <  2:284347/140‑1 (MQ=255)

                                                atatCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTc                                                                                 <  1:18896/140‑1 (MQ=255)

                                                atatCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTc                                                                                 <  2:671750/140‑1 (MQ=255)

                                                atatCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTc                                                                                 <  1:35659/140‑1 (MQ=255)

                                                     cTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAg                                                                            <  2:1113202/140‑1 (MQ=255)

                                                        gATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCaa                                                                         >  2:1173992/1‑140 (MQ=255)

                                                         aTAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGTTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAAt                                                                        >  1:793115/1‑140 (MQ=255)

                                                           aGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTc                                                                      >  1:1292824/1‑140 (MQ=255)

                                                            gCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCa                                                                     >  1:1150583/1‑140 (MQ=255)

                                                            gCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCa                                                                     <  2:658801/140‑1 (MQ=255)

                                                             cAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCaa                                                                    >  1:573387/1‑140 (MQ=255)

                                                             cAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCaa                                                                    >  2:316849/1‑140 (MQ=255)

                                                             cAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTAAGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCCCAGCAATTCaa                                                                    >  2:242954/1‑140 (MQ=255)

                                                                  cTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTGTGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTg                                                               >  1:563249/1‑140 (MQ=255)

                                                                  cTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTg                                                               <  2:514609/140‑1 (MQ=255)

                                                                  cTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTg                                                               >  2:1035010/1‑140 (MQ=255)

                                                                   ttATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGa                                                              >  2:1131919/1‑140 (MQ=255)

                                                                       ggCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATggg                                                          >  1:377695/1‑140 (MQ=255)

                                                                       ggCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATggg                                                          >  2:343138/1‑140 (MQ=255)

                                                                       ggCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATggg                                                          >  1:616469/1‑140 (MQ=255)

                                                                          aaaaCTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGa                                                       >  1:897555/1‑140 (MQ=255)

                                                                            aaCTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATg                                                     >  2:1228332/1‑140 (MQ=255)

                                                                            aaCTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATg                                                     <  1:1131919/140‑1 (MQ=255)

                                                                             aCTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGt                                                    >  2:571039/1‑140 (MQ=255)

                                                                             aCTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGGGATGt                                                    >  2:985601/1‑140 (MQ=255)

                                                                                 gTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGcc                                                <  1:571039/140‑1 (MQ=255)

                                                                                       ttGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTAcc                                          <  2:619474/140‑1 (MQ=255)

                                                                                         ggCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAg                                        >  2:918404/1‑140 (MQ=255)

                                                                                            aaTTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCAc                                     <  2:1184802/140‑1 (MQ=255)

                                                                                            aaTTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCAc                                     <  2:309169/140‑1 (MQ=255)

                                                                                             aTTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTGTGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCAcc                                    <  2:563249/140‑1 (MQ=255)

                                                                                             aTTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCAcc                                    <  2:853116/140‑1 (MQ=255)

                                                                                             aTTCTGATGAACCGAGTGATTAAGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCCCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCAcc                                    <  1:242954/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                cTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTgg                                 <  1:239437/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                cTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTgg                                 >  2:442636/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                     gaACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAg                            <  1:1035010/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                     gaACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAg                            <  1:1316409/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                        ccGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTaa                         >  1:751160/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                         cGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAAt                        >  2:322064/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                           aGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAAttt                      >  1:652578/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                           aGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAACGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAAttt                      >  2:277874/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                               aTTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGAt                  <  2:352051/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                               aTTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGAt                  <  2:616469/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                   tGCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGa              >  1:1251461/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                    gCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGaa             <  1:985601/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                    gCTGGCCCGGGTGATGTTGAAATCTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGaa             <  2:611736/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                       ggCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATgg          >  2:1071377/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                        gCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGt         <  2:936369/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                        gCCCGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGt         >  1:630421/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                         cccGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTc        >  1:501900/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                          ccGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCa       >  2:1069361/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                           cGGGTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCAt      <  2:270179/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                             ggTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGa    >  1:353043/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                             ggTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGa    >  2:342922/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                             ggTGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGa    >  1:975811/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                               tGATGTTGAAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGAtt  <  1:505010/140‑1 (MQ=255)

ATAACAATATCTCTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATT  >  NC_000913/390960‑391226

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 27 ≤` `ATCG/ATCG` `< 33 ≤` `ATCG/ATCG` `< 37 ≤` `ATCG/ATCG` `< 40 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`