Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,576,361 | C→A | pseudogene (2227/2721 nt) | yjiV → | putative uncharacterized protein YjiV |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,576,361 | 0 | C | A | 98.6% | 257.1 / ‑2.9 | 73 | pseudogene (2227/2721 nt) | yjiV | putative uncharacterized protein YjiV |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base A (44/28); total (44/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.97e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.82e-01 |
AGCGGGTCAAAGACATTCAGATCCACAAACAGTTGAATGGACCACTGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTCACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGACGCTGGATACGCTATTTAAAGATAAAGATCGCCCCG > NC_000913/4576224‑4576496 | aGCGGGTCAAAGACATTCAGATCCACAAACAGTTGAATGGACCACTGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAAc > 1:845610/1‑140 (MQ=255) gCGGGTCAAAGACATTCAGATCCACAAACAGTTGAATGGACCACTGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCGCTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACt < 2:331032/140‑1 (MQ=255) gTCAAAGACATTCAGATCCACAAACAGTTGAATGGACCACTGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATAc < 1:390784/140‑1 (MQ=255) gTCAAAGACATTCAGATCCACAAACAGTTGAATGGACCACTGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATAc > 1:26291/1‑140 (MQ=255) aaGACATTCAGATCCACAAACAGTTGAATGGACCACTGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGAt > 2:1232988/1‑140 (MQ=255) ttCAGATCCACAAACAGTTGAATGGACCACTGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTAt > 1:463866/1‑140 (MQ=255) ttCAGATCCACAAACAGTTGAATGGACCACTGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTAt > 2:642439/1‑140 (MQ=255) aGATCCACAAACAGTTGAATGGACCACTGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTg < 1:162911/140‑1 (MQ=255) ccACAAACAGTTGAATGGACCACTGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCaaa > 1:173192/1‑140 (MQ=255) cAGTTGAATGGACCACTGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGt < 1:105972/140‑1 (MQ=255) ttGAATGGACCACTGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTgc > 2:182083/1‑140 (MQ=255) gAATGGACCACTGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTgcgc > 2:611539/1‑140 (MQ=255) gAATGGACCACTGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTgcgc < 1:560738/140‑1 (MQ=255) aaTGGACCACTGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCt > 1:838738/1‑140 (MQ=255) aaTGGACCACTGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCt > 1:935798/1‑140 (MQ=255) aCCACTGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCgt > 1:1077064/1‑140 (MQ=255) cACTGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCgttg > 2:1447182/1‑140 (MQ=255) cTGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCgttgtt < 1:881533/140‑1 (MQ=255) cTGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCgttgtt < 1:1230775/140‑1 (MQ=255) tGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGttgttg > 2:731969/1‑140 (MQ=255) tGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGttgttg > 2:1483985/1‑140 (MQ=255) tGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGttgttg > 2:303093/1‑140 (MQ=255) tCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTggg < 2:587839/140‑1 (MQ=255) gCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCgttgtt < 2:610510/135‑1 (MQ=255) gCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCgttgtt > 1:610510/1‑135 (MQ=255) gTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCaa < 1:642439/140‑1 (MQ=255) ggCAACACTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTg > 1:457066/1‑140 (MQ=255) aaCGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTgaga < 2:1381857/140‑1 (MQ=255) aaCGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTgaga < 1:611539/140‑1 (MQ=255) gCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCg > 1:209848/1‑140 (MQ=255) ttCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTCACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCt < 2:1247067/140‑1 (MQ=255) cTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTaa > 1:727420/1‑140 (MQ=255) tGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCTCTAAAAACAAAg > 2:100330/1‑140 (MQ=255) tGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAg < 2:209848/140‑1 (MQ=255) tGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAg > 2:355540/1‑140 (MQ=255) tGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAg > 1:330220/1‑140 (MQ=255) tGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAg > 1:179714/1‑140 (MQ=255) tGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAg < 1:303093/140‑1 (MQ=255) tGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAg > 1:820060/1‑140 (MQ=255) tGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAg > 2:284938/1‑140 (MQ=255) tGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAg > 1:159326/1‑140 (MQ=255) tGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAg < 1:1483985/140‑1 (MQ=255) tGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAg > 2:639405/1‑140 (MQ=255) cTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCt > 2:972809/1‑140 (MQ=255) tGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTg < 1:284938/140‑1 (MQ=255) aaCGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGa < 1:1044998/140‑1 (MQ=255) aaCGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGa < 2:220642/140‑1 (MQ=255) cGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATg > 2:572023/1‑140 (MQ=255) cGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATg > 2:824665/1‑140 (MQ=255) cGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATg > 1:17539/1‑140 (MQ=255) cGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATg > 2:275369/1‑140 (MQ=255) aCCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGgc > 2:906027/1‑140 (MQ=255) aTGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCt > 2:1418597/1‑140 (MQ=255) agCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACTGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGa < 1:461115/140‑1 (MQ=255) gcgcAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGAc > 1:639086/1‑140 (MQ=255) gcgcAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGAc < 1:731969/140‑1 (MQ=255) cgcAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGACg > 1:442642/1‑140 (MQ=255) cgcAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGACg < 1:355540/140‑1 (MQ=255) cgcAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGACg < 1:860258/140‑1 (MQ=255) cgcAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGACg < 1:639405/140‑1 (MQ=255) cTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGACGCTGGATAc < 1:786374/140‑1 (MQ=255) aTAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGACGCTGGATACGCTAttt > 1:210322/1‑140 (MQ=255) tAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGACGCTGGATACGCTATTta < 2:820060/140‑1 (MQ=255) tAACACGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGACGCTGGATACGCTATTta < 2:727420/140‑1 (MQ=255) cacGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGACGCTGGATACGCTATTtaaag > 1:144463/1‑140 (MQ=255) cacGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGACGCTGGATACGCTATTta > 2:839312/1‑137 (MQ=255) cacGCGAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGACGCTGGATACGCTATTta < 1:839312/137‑1 (MQ=255) cgcgAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGACGCTGGATACGCTATTtaaagat > 1:1317544/1‑140 (MQ=255) gAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGACGCTGGATACGCTATTtaaagataaa > 1:1053352/1‑140 (MQ=255) gAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGACGCTGGATACGCTATTtaaagataaa > 2:768825/1‑140 (MQ=255) gAATTACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGACGCTGGATACGCTATTtaaagataaa > 1:1382076/1‑140 (MQ=255) tACCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGACGCTGGATACGCTATTTAAAGATAAAGATc < 2:159326/140‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGACGCTGGATACGCTATTTAAAGATAAAGATCg > 1:738466/1‑140 (MQ=255) cGTTAACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGACGCTGGATACGCTATTTAAAGATAAAGATCGCCCCg > 2:751893/1‑140 (MQ=255) | AGCGGGTCAAAGACATTCAGATCCACAAACAGTTGAATGGACCACTGTCGCAGTTTGGGCAACGCTTCTGGGACGTGCTGTTTAACGACCATGAAGAAGCGCAGTCACTGATGAATAACACGCGAATTACCGGCGTTCACTATACCGATCGCTATCTGCAAAACCCGGTTGCGCTGGCGTTGTTGGGATCAATTCTGAGACCGCTAAAAACAAAGCTGACCGATGGCGCTGAAGTGACGCTGGATACGCTATTTAAAGATAAAGATCGCCCCG > NC_000913/4576224‑4576496 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |