New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3375829 | 86 (1.000) | 4 (0.050) | 3/276 | 8.3 | 4.9% | coding (961/1368 nt) | dcuD | putative transporter DcuD |
? | NC_000913 | = 3375883 | 69 (0.800) | coding (1015/1368 nt) | dcuD | putative transporter DcuD | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGA > NC_000913/3375749‑3376018 | aCTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATc > 1:1416443/1‑140 (MQ=255) cgcgAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAgggg > 1:1083017/1‑140 (MQ=255) cgcgAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAgggg > 2:975407/1‑140 (MQ=255) cgcgAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAgggg > 2:853857/1‑140 (MQ=255) gcgAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAggggg < 2:479223/140‑1 (MQ=255) gcgAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAggggg > 2:40696/1‑140 (MQ=255) gcgAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCAGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAggggg > 2:771632/1‑140 (MQ=255) aaaCAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCGTGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCg < 2:602641/140‑1 (MQ=255) aaaCAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCg < 2:1421314/140‑1 (MQ=255) ggACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGAAGCAtt < 2:1017456/140‑1 (MQ=255) aTGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATtctggt < 2:591488/140‑1 (MQ=255) aTGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATtctggt < 2:583736/140‑1 (MQ=255) tgtgCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGGGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATtctggtc > 2:826769/1‑140 (MQ=255) gtgCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATtctggtct > 2:437796/1‑140 (MQ=255) gtgCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATtctggtct > 1:48482/1‑140 (MQ=255) gCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATtctggtctgg > 2:629781/1‑140 (MQ=255) cAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTggg < 2:301446/140‑1 (MQ=255) ggCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCg > 1:671527/1‑140 (MQ=255) gTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTa < 2:1306365/140‑1 (MQ=255) gTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTa < 2:556186/140‑1 (MQ=255) ttGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATAATTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGc < 1:930192/140‑1 (MQ=255) gACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGCCGATTGGCACTGTCGATGCGG‑TATCATGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGtg < 1:1324793/140‑1 (MQ=255) gACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGt < 1:40696/140‑1 (MQ=255) gACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCAGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGt < 1:771632/140‑1 (MQ=255) tACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGAttatta > 2:857792/1‑140 (MQ=255) cAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTACTATGgc > 1:140588/1‑140 (MQ=255) ttGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTg > 1:425678/1‑140 (MQ=255) tGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTgg > 1:371983/1‑140 (MQ=255) tGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGAGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTgg > 2:504170/1‑140 (MQ=255) tGCCAACGTGGAAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATAATAATGTCGCTgg > 2:755737/1‑140 (MQ=255) aCGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTACTATGGCGCTGGTCAtt < 2:140588/140‑1 (MQ=255) cGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTg > 1:1056839/1‑140 (MQ=255) tGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGTTTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGcc > 2:464754/1‑140 (MQ=255) tGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGcc > 1:823006/1‑140 (MQ=255) gTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGATAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCAt > 1:143242/1‑140 (MQ=255) gTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCAt > 1:978519/1‑140 (MQ=255) gTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCAt > 1:1361578/1‑140 (MQ=255) cTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGc < 2:671527/140‑1 (MQ=255) tggtggTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGcc > 2:1046251/1‑140 (MQ=255) ggtggtCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGTTTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCa < 1:464754/140‑1 (MQ=255) ggtggtCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCa > 1:1025033/1‑140 (MQ=255) ggtggtCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCa < 2:570773/140‑1 (MQ=255) gtggtCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCAt > 1:92665/1‑140 (MQ=255) tggcggcgAGTTAAATATTTGCGAATGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGAGGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTTTGGTCTGGGCGGTTTCGGCGTGATGATTATTATGGCACTGGTCATTGCCATTTGTTCCAtt < 2:847847/135‑1 (MQ=255) cgcgGGTGAAATATTTGCGATAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGa < 2:143242/140‑1 (MQ=255) cgcgGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGa < 1:826769/140‑1 (MQ=255) cgcgGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGa < 2:1083017/140‑1 (MQ=255) cgcgGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATATGTGCCATTGTGa < 2:425678/140‑1 (MQ=255) gcgGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGAt < 2:1361578/140‑1 (MQ=255) gcgGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGAt < 1:568864/140‑1 (MQ=255) gcgGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGAt > 2:568864/1‑140 (MQ=255) gggTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATgg > 2:1369430/1‑140 (MQ=255) aaTATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTg > 1:684753/1‑140 (MQ=255) atTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCa < 2:684753/140‑1 (MQ=255) atTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCa < 2:978519/140‑1 (MQ=255) tGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCGATTGTGATGGGCTCTGGCAATg > 1:849753/1‑140 (MQ=255) tGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATg > 2:930479/1‑140 (MQ=255) tGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATg > 2:1255396/1‑140 (MQ=255) tGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATg > 2:1255056/1‑140 (MQ=255) cGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATgcg < 2:685086/140‑1 (MQ=255) cGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATgcg < 1:1046251/140‑1 (MQ=255) gaTTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTg > 2:1236138/1‑140 (MQ=255) aTTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGc < 2:1056839/140‑1 (MQ=255) aTTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGc < 1:1255056/140‑1 (MQ=255) ggCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAg < 2:48482/140‑1 (MQ=255) cACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTc < 1:498019/140‑1 (MQ=255) cTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCtt < 1:975407/140‑1 (MQ=255) cGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTc > 2:895560/1‑140 (MQ=255) tGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGa < 1:895560/140‑1 (MQ=255) | ACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGA > NC_000913/3375749‑3376018 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |