Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,204,331 | T→C | intergenic (+42/‑265) | yehK → / → yehL | uncharacterized protein YehK/putative AAA(+) MoxR family ATPase YehL |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,204,331 | 0 | T | C | 97.5% | 293.9 / ‑0.6 | 81 | intergenic (+42/‑265) | yehK/yehL | uncharacterized protein YehK/putative AAA(+) MoxR family ATPase YehL |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (49/30); minor base . (1/1); total (50/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.27e-01 |
TGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGAACCTGCCT > NC_000913/2204196‑2204467 | tgatgaGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCa < 2:37831/140‑1 (MQ=255) aGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGc < 2:922385/140‑1 (MQ=255) aGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGc > 1:419199/1‑140 (MQ=255) aGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGc > 1:991359/1‑140 (MQ=255) aGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGc < 1:1327900/140‑1 (MQ=255) aGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGc > 1:997436/1‑140 (MQ=255) aGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGc > 2:424869/1‑140 (MQ=255) aGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACG‑CCCAATGGcc > 2:341783/1‑140 (MQ=255) cGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATTGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCt > 1:447027/1‑140 (MQ=255) cGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCt > 1:359394/1‑140 (MQ=255) tGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAAtctc < 2:730865/140‑1 (MQ=255) aaTCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCAt > 2:497923/1‑140 (MQ=255) aaCTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAAt > 2:309290/1‑139 (MQ=255) aaCTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAAt < 1:309290/139‑1 (MQ=255) cTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGc > 1:1207027/1‑140 (MQ=255) gTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCaa > 2:1090891/1‑140 (MQ=255) gTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCaa > 2:646995/1‑140 (MQ=255) tAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCaa > 2:695127/1‑139 (MQ=255) tAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCaa < 1:695127/139‑1 (MQ=255) aaTAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACg > 2:248338/1‑140 (MQ=255) aaTAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACg < 1:309847/140‑1 (MQ=255) aaTAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACg < 2:85154/140‑1 (MQ=255) aGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACgggg > 1:1350947/1‑140 (MQ=255) cAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTc < 2:997436/140‑1 (MQ=255) cAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTc > 1:814670/1‑140 (MQ=255) cAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTc > 1:371662/1‑140 (MQ=255) aTTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCa > 1:100366/1‑140 (MQ=255) tAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGt < 1:646995/140‑1 (MQ=255) tGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTtat > 1:928790/1‑140 (MQ=255) aGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAAttcgtt < 2:106309/140‑1 (MQ=255) gAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAAttcgtt < 1:180060/139‑1 (MQ=255) gAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAAttcgtt > 2:180060/1‑139 (MQ=255) aaTATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAAttcgttcg > 1:596776/1‑140 (MQ=255) tatatTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTcgttcgtt > 2:958863/1‑140 (MQ=255) tatatTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTcgttcgtt < 1:305719/140‑1 (MQ=255) atTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGa > 1:1345029/1‑140 (MQ=255) atTCAACCAAGAAATAGAATAATATACCCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGa > 2:846944/1‑140 (MQ=255) tCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAac > 2:213158/1‑140 (MQ=255) tCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAac > 2:89355/1‑140 (MQ=255) tCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAac > 1:772391/1‑140 (MQ=255) tCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACG‑CCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAaca < 1:341783/140‑1 (MQ=255) aCCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACg > 1:1126755/1‑140 (MQ=255) aCCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACg > 2:714304/1‑140 (MQ=255) ccAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGGCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGa > 1:274821/1‑140 (MQ=255) cAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGAt > 2:626417/1‑140 (MQ=255) aGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGt > 2:377828/1‑140 (MQ=255) aGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGt > 2:827990/1‑140 (MQ=255) aaTAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGc < 1:163957/140‑1 (MQ=255) aaTAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGc < 1:744333/140‑1 (MQ=255) aaTAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGc < 1:1090891/140‑1 (MQ=255) aTAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGca < 2:139800/140‑1 (MQ=255) aGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGcaca < 1:930824/140‑1 (MQ=255) aGAATAATATACCCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGcaca < 1:846944/140‑1 (MQ=255) aataatATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAgg < 2:928790/140‑1 (MQ=255) aataTACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCtg < 2:1437783/140‑1 (MQ=255) tataCTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCtgtg > 2:574203/1‑140 (MQ=255) ctctAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGgtgt < 2:79092/140‑1 (MQ=255) tctAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGtt > 1:24515/1‑140 (MQ=255) tctAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGtt > 2:395715/1‑140 (MQ=255) tAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAg > 2:135134/1‑140 (MQ=255) tAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAg > 2:20838/1‑140 (MQ=255) tAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAg > 1:175837/1‑140 (MQ=255) aataatTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGc > 2:1240350/1‑140 (MQ=255) aataatTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGc > 2:1119090/1‑140 (MQ=255) aataatTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGc > 2:1305225/1‑140 (MQ=255) aataatTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGc > 1:406332/1‑140 (MQ=255) ataatTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGcc > 2:395240/1‑140 (MQ=255) ataatTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGcc > 1:334129/1‑140 (MQ=255) ttCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGaa > 1:1393253/1‑140 (MQ=255) ttCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGaa > 1:622097/1‑140 (MQ=255) tCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGaaa > 2:988984/1‑140 (MQ=255) cAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGaaaa < 1:424869/140‑1 (MQ=255) aaTTGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATa < 1:714304/140‑1 (MQ=255) tGGTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGta < 1:395240/140‑1 (MQ=255) ggTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGtaa < 2:359394/140‑1 (MQ=255) ggTCCGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGtaa > 1:465327/1‑140 (MQ=255) cGATCCGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGtaaataa < 1:994641/140‑1 (MQ=255) cGGCGCAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGaa < 1:772854/140‑1 (MQ=255) gcgcAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGACCTGAAAATAGTAAATAAAAGAAcc > 2:85918/1‑140 (MQ=255) cgcAACGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGAACCt < 1:265677/140‑1 (MQ=255) aCGCCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGAACCTGCCt < 1:574203/140‑1 (MQ=255) | TGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGAACCTGCCT > NC_000913/2204196‑2204467 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |