| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,023,070 | T→C | V112A (GTT→GCT) | tatC → | twin arginine protein translocation system ‑ TatC protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,023,070 | 0 | T | C | 97.8% | 318.8 / ‑2.7 | 89 | V112A (GTT→GCT) | tatC | twin arginine protein translocation system ‑ TatC protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (50/37); total (51/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
GCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTT > NC_000913/4022933‑4023205 | gCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGctt > 2:811278/1‑140 (MQ=255)gCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGctt > 2:1323920/1‑140 (MQ=255) aCGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGctctct < 1:406854/140‑1 (MQ=255) cGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTctg < 2:141901/140‑1 (MQ=255) cGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTctg < 2:1413244/140‑1 (MQ=255) gCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGCTCTctgc > 2:1264772/1‑140 (MQ=255) aTCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGtt > 2:1364062/1‑140 (MQ=255) aTCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGtt > 1:173429/1‑140 (MQ=255) aTCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGtt > 2:1009524/1‑140 (MQ=255) tCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTctg < 2:73582/134‑1 (MQ=255) tCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTctg > 1:73582/1‑134 (MQ=255) aGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTtat < 2:1271968/140‑1 (MQ=255) gACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCg > 1:596551/1‑140 (MQ=255) aCCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCgg < 2:617095/140‑1 (MQ=255) aCCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCgg > 1:394906/1‑140 (MQ=255) cTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCggca < 1:1102048/140‑1 (MQ=255) tttATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCggcat < 1:811278/140‑1 (MQ=255) aTGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCggcatggc > 1:253058/1‑140 (MQ=255) tCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGc > 2:6230/1‑140 (MQ=255) tCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGc > 1:862501/1‑140 (MQ=255) tCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGc > 2:1349619/1‑140 (MQ=255) gCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCt < 2:873521/140‑1 (MQ=255) cTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGc < 2:198278/137‑1 (MQ=255) cTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGc > 1:198278/1‑137 (MQ=255) tGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTtgtg < 1:1264772/140‑1 (MQ=255) tCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGt > 2:155514/1‑140 (MQ=255) tCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGt > 2:1368252/1‑140 (MQ=255) cAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTc < 2:202222/140‑1 (MQ=255) cgcCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCttt > 2:836047/1‑140 (MQ=255) gcCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTc > 1:1155255/1‑140 (MQ=255) ggTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGc < 2:596551/140‑1 (MQ=255) aTTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGc < 2:394906/140‑1 (MQ=255) ctATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTg < 1:1364062/140‑1 (MQ=255) tCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCt > 1:1082469/1‑140 (MQ=255) aGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTc < 2:1155255/140‑1 (MQ=255) aGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTc < 2:1260464/140‑1 (MQ=255) aGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTc > 1:139628/1‑140 (MQ=255) aGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTc < 1:1368252/140‑1 (MQ=255) aGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTc < 1:1349619/140‑1 (MQ=255) aGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTc < 1:1009524/140‑1 (MQ=255) ggTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTc < 2:1303735/139‑1 (MQ=255) ggTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTc > 1:1303735/1‑139 (MQ=255) tgGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTc < 1:618307/135‑1 (MQ=255) tgGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTc > 2:618307/1‑135 (MQ=255) ggCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTc < 1:579909/133‑1 (MQ=255) ggCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTc > 2:579909/1‑133 (MQ=255) aTTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATa < 1:155514/140‑1 (MQ=255) tttATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATAc > 1:1048473/1‑140 (MQ=255) ttATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATAcc > 1:1057180/1‑140 (MQ=255) ttATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATAcc > 2:69248/1‑140 (MQ=255) ttATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATAcc > 1:1331931/1‑140 (MQ=255) tATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACcg > 1:1087111/1‑140 (MQ=255) tATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACcg < 2:1082469/140‑1 (MQ=255) cGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCgcgc < 2:228554/140‑1 (MQ=255) ccAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGa < 2:354691/140‑1 (MQ=255) gcTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAgggg > 2:661455/1‑140 (MQ=255) tataAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCa > 1:220436/1‑140 (MQ=255) tataAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCa > 1:727616/1‑140 (MQ=255) gCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGTTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTAt > 1:1275283/1‑140 (MQ=255) gCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTAt > 2:1135266/1‑140 (MQ=255) tGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCa > 1:1088114/1‑140 (MQ=255) tGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCa < 2:1088114/140‑1 (MQ=255) tGAACGTCGCC‑‑‑TGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCg > 2:67916/1‑140 (MQ=255) aaCGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAgg > 1:1194197/1‑124 (MQ=255) aaCGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAgg < 2:1194197/124‑1 (MQ=255) aaCGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTa > 1:340854/1‑134 (MQ=255) aaCGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTa < 2:340854/134‑1 (MQ=255) aaCGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCAcc > 2:716749/1‑140 (MQ=255) aaCGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCAcc > 2:1046685/1‑140 (MQ=255) aaCGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCAcc > 1:911673/1‑140 (MQ=255) aaCGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCAcc > 2:740400/1‑140 (MQ=255) aaCGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCAcc > 1:346478/1‑140 (MQ=255) aaCGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCAcc > 2:1450877/1‑140 (MQ=255) aaCGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCAcc > 2:820943/1‑140 (MQ=255) cGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGa > 1:197056/1‑140 (MQ=255) acagcgtggtggTGCCGCTGCTGGCTTCCAGGTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGAc > 2:1095906/7‑140 (MQ=255) gCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATc > 2:110552/1‑140 (MQ=255) gCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATc > 1:1429064/1‑140 (MQ=255) ccTGGTGGTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCg < 2:615467/140‑1 (MQ=255) tggtggTGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGcc < 1:69248/140‑1 (MQ=255) ggtggtGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCa < 1:772483/140‑1 (MQ=255) ggtggtGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCa < 1:716749/140‑1 (MQ=255) ggtggtGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCa < 1:1128505/140‑1 (MQ=255) ggtggtGCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCa > 2:756062/1‑140 (MQ=255) gtggtgCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAg < 2:627465/140‑1 (MQ=255) ggtgCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCt > 1:37223/1‑140 (MQ=255) gCCGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGC‑GGTATCCACCGACATCGCCAGCTAttt > 2:269240/1‑140 (MQ=255) ccGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTAttt > 1:525608/1‑140 (MQ=255) ccGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTAttt < 1:661455/140‑1 (MQ=255) ccGCTGCTGGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGCGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTAttt > 2:723918/1‑140 (MQ=255) ctgGCTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCtt < 2:1429064/140‑1 (MQ=255) | GCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATATCGGCATGGCATTCGCCTACTTTGTGGTCTTTCCGCTGGCATTTGGCTTCCTTGCCAATACCGCGCCGGAAGGGGTGCAGGTATCCACCGACATCGCCAGCTATTTAAGCTT > NC_000913/4022933‑4023205 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |