Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,118,953 | IS5 (+) +4 bp | coding (91‑94/567 nt) | yceJ ← | putative cytochrome b561 |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 273955 = | NA (NA) | 139 (1.390) | 61/276 | 0.3 | 98.5% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | 1118953 = | 2 (0.020) | coding (94/567 nt) | yceJ | putative cytochrome b561 | |||||
* | ? | NC_000913 | = 275149 | NA (NA) | 103 (1.020) | 50/278 | 0.7 | 98.0% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1118956 | 2 (0.020) | coding (91/567 nt) | yceJ | putative cytochrome b561 |
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/275011‑275149 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGCGTGTCATATCTCCACCGCCG < NC_000913/1118956‑1118819 AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 1:265317/140‑1 AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT > 2:1442286/1‑140 AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 2:132296/140‑1 AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT > 2:1296297/1‑140 AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 2:403965/140‑1 AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT > 2:51168/1‑140 AAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 1:754306/140‑1 AAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT > 2:478404/1‑140 AAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 1:1144702/140‑1 AATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 1:870345/140‑1 AATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 1:1156947/140‑1 TCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGG > 1:953547/1‑140 TCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGG > 1:1182085/1‑140 TCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGG > 1:1167877/1‑140 TCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGG < 1:1549470/140‑1 TCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGG < 2:1553608/140‑1 TCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA > 2:578884/1‑138 TCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 1:578884/138‑1 TCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGACGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGG > 2:190088/1‑140 CTCTTTTCTGGTCTGACGGTGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGT < 1:1316659/140‑1 CTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGA < 1:850196/140‑1 TCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGT < 2:901437/140‑1 TGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCA < 2:1614528/140‑1 ACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACG > 1:698742/1‑140 ACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACG > 2:230481/1‑140 GGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCT < 2:1013808/140‑1 GGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGACGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCT < 1:190088/140‑1 GCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAG > 2:1335165/1‑140 CTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGT > 1:37526/1‑140 TTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTT < 2:37526/140‑1 CTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACG < 1:1617564/140‑1 CTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACG < 2:570556/140‑1 CTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACG < 2:165027/140‑1 CTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACG < 2:1696622/140‑1 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTA > 1:1056204/1‑140 CGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCA > 2:1312366/1‑140 CGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAA < 2:1347284/140‑1 TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACC > 2:788084/1‑140 TTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAA < 1:1455844/140‑1 TTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAA < 2:613131/140‑1 ATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTG > 2:1390764/1‑140 GACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCA > 2:1563229/1‑140 GACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCA > 2:1595884/1‑140 TCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAA > 2:1117465/1‑140 CATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAA < 1:1679642/140‑1 CATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAA < 1:593915/140‑1 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAA > 1:1507854/1‑140 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAA > 2:1335/1‑140 ATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCA < 1:788084/140‑1 TGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCAT < 1:293816/140‑1 TGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCAT < 2:819355/140‑1 CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGT > 2:1441248/1‑140 CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCAT > 2:1347922/1‑136 CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCAT < 1:1347922/136‑1 CCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTA < 2:656283/140‑1 TGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATT < 2:1507854/140‑1 TGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATT < 2:644956/140‑1 GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACACTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTT > 2:1018962/1‑140 TTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTT > 1:1078612/1‑140 TCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTG > 2:312665/1‑140 TATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTT < 1:1563229/140‑1 TATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTT < 1:312665/140‑1 TATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTT < 1:230481/140‑1 TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAA > 2:282319/1‑140 TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTT < 1:652274/138‑1 TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTT > 2:652274/1‑138 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATG > 1:90573/1‑140 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATG > 1:640312/1‑140 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGGTATTACGATGGCTGTTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATG > 2:1496298/1‑140 GATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGG < 1:1390764/140‑1 ATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGC < 2:698742/140‑1 ATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGC < 1:1335165/140‑1 GACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTG < 2:365307/140‑1 GATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGC > 2:685823/1‑140 ATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCG > 1:153065/1‑140 ATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGCATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCG > 1:1308336/1‑140 TATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGT > 1:83988/1‑140 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTG > 2:1586330/1‑140 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTG > 1:36623/1‑140 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTG > 1:1365909/1‑140 CAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGC < 1:1586330/140‑1 CAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGC < 1:1496298/140‑1 CAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGC < 1:1335/140‑1 AGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGCG > 2:632038/1‑140 AGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGCG < 2:1494336/140‑1 GGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGCGT > 1:1378397/1‑140 GGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGCGT > 1:616289/1‑140 GGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACACTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGCGT < 1:1018962/140‑1 GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGCGTG > 2:421356/1‑140 GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGCGTG > 2:330880/1‑140 GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGCGTG > 1:378531/1‑140 GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGCGTG > 2:141354/1‑140 GACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGCGTGT < 2:1299234/140‑1 GACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGCGTGT > 2:1448390/1‑140 CTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGCGTGTCA > 2:530988/1‑140 CACCTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGCGTGTCATATCTCCA < 2:616289/140‑1 CTTCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGCGTGTCATATCTCCACCG > 1:1296797/1‑140 TCCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGCGTGTCATATCTCCACCGCC < 2:1056204/140‑1 CCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGCGTGTCATATCTCCACCGCCG > 1:730314/1‑140 CCTTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGCGTGTCATATCTCCACCGCCG > 2:909418/1‑140 AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/275011‑275149 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGGTCTGTGGATGGTCACGCTCAGTTATTACGATGGCTGGTATCACAAAGCACCCGAACTGCATAAAAGCATCGGTATTTTGTTAATGATGGGGCTGGTTATTCGCGTTCTGTGGCGTGTCATATCTCCACCGCCG < NC_000913/1118956‑1118819 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |