| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,796,766 | G→T | G263V (GGG→GTG) | waaC → | ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,796,766 | 0 | G | T | 97.4% | 247.0 / 0.6 | 77 | G263V (GGG→GTG) | waaC | ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base T (30/44); total (31/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.18e-01 | |||||||||||
GCGCGCCGCATGAGGAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATTTAATTAACCTCAA > NC_000913/3796631‑3796901 | gcgcgcCGCATGAGGAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTa > 1:1697800/1‑140 (MQ=255) gcgcCGCATGAGGAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAg < 2:1650389/140‑1 (MQ=255) cgccgcATGAGGAAGAACGGGCGAAACGATTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGc > 1:262753/1‑140 (MQ=255) ggAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAAcgg < 1:493193/140‑1 (MQ=255) ggAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAAcgg < 1:254716/140‑1 (MQ=255) ggAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATATGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAAcgg < 1:372649/140‑1 (MQ=255) aagaaCGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAAcggcg < 2:1002760/140‑1 (MQ=255) gaaCGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACggcggc < 1:504434/140‑1 (MQ=255) aaCGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCa < 1:743615/140‑1 (MQ=255) aCGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACggcggcgc > 2:1103430/1‑138 (MQ=255) aCGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCAc < 2:1389704/140‑1 (MQ=255) aCGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCAc > 1:33639/1‑140 (MQ=255) aCGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCAc > 1:69297/1‑140 (MQ=255) aCGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTAGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCAc < 2:1408970/140‑1 (MQ=255) gCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGTAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGa > 2:68584/1‑140 (MQ=255) cGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGAt < 2:1631110/140‑1 (MQ=255) cGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATCTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGAt < 1:159033/140‑1 (MQ=255) gAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATa < 2:886354/140‑1 (MQ=255) aaCGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGa < 2:227687/140‑1 (MQ=255) aaCGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGa < 2:878219/140‑1 (MQ=255) cGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGAcc < 2:143158/140‑1 (MQ=255) tGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGAt < 2:376643/131‑1 (MQ=255) tGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGAt > 1:376643/1‑131 (MQ=255) ggCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAata < 2:1140652/140‑1 (MQ=255) cGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGTAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATc < 1:68584/140‑1 (MQ=255) cGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATc < 1:338825/140‑1 (MQ=255) gAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCAc < 1:233773/140‑1 (MQ=255) gAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCAc < 1:984211/140‑1 (MQ=255) aaGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGCGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGAt > 1:1080222/1‑140 (MQ=255) aGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCTGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATc < 1:372241/140‑1 (MQ=255) ttGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCggg > 1:1470026/1‑140 (MQ=255) ttGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCggg > 2:727610/1‑140 (MQ=255) ttGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCggg > 2:591120/1‑140 (MQ=255) ttGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCggg > 2:381440/1‑140 (MQ=255) ttGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCggg > 2:1504287/1‑140 (MQ=255) ttGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCg < 2:135076/138‑1 (MQ=255) ttGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCg > 1:135076/1‑138 (MQ=255) gCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGGCCCAATATCTCGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGAt < 2:1190158/140‑1 (MQ=255) gCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGAt > 1:921330/1‑140 (MQ=255) aaGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAAt > 1:106814/1‑140 (MQ=255) aGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGGTTAAtt > 2:172389/1‑140 (MQ=255) gATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATtg > 2:1693537/1‑140 (MQ=255) aTGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATtgg < 1:1447533/140‑1 (MQ=255) tGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATtggt < 2:33639/140‑1 (MQ=255) gAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATtggtg < 2:1470026/140‑1 (MQ=255) cTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTa < 1:205442/140‑1 (MQ=255) gAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGGTTATTGACCAACCGATCCGGGATTAATTTGTGGGGATgg > 1:202270/1‑140 (MQ=255) aaGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATggg < 1:1323508/140‑1 (MQ=255) gTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGGTAGAGCCCATATCAAGGGTTATGGGCCAACCGGACCGGGATTAATTTGTGGGGATGGgaagaa > 2:903241/1‑140 (MQ=255) gTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGGCCAACCGATCCGGGATTAATTGGGGGGTATGGgaagaa > 2:506497/1‑140 (MQ=255) gTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGgaagaa > 2:340673/1‑140 (MQ=255) ttGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAAt < 1:1295135/140‑1 (MQ=255) tGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATc < 1:340673/140‑1 (MQ=255) tGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATc < 1:323752/140‑1 (MQ=255) tGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATc < 2:1080222/140‑1 (MQ=255) gccGCGTGGTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAg < 1:1163023/139‑1 (MQ=255) cccGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAg < 2:140534/140‑1 (MQ=255) cccGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAg < 1:1693537/140‑1 (MQ=255) cccGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAg > 2:280395/1‑140 (MQ=255) ccGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGa < 1:365046/140‑1 (MQ=255) ccGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGa < 1:1201265/140‑1 (MQ=255) ccGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGa < 1:758590/140‑1 (MQ=255) ccGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGa < 2:1697800/140‑1 (MQ=255) cgTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATgg > 2:1068890/1‑140 (MQ=255) gTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGt < 2:262753/140‑1 (MQ=255) ggCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTa > 1:1204253/1‑140 (MQ=255) gCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAg < 2:133266/140‑1 (MQ=255) ggCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTc > 1:856212/1‑140 (MQ=255) ggCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGGGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTc > 1:272690/1‑140 (MQ=255) gTAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGGTTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGaaaa > 1:1704613/1‑140 (MQ=255) tAGTGTCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAAt > 2:884456/1‑140 (MQ=255) gtCGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATttaa < 2:1113500/140‑1 (MQ=255) gtCGGTGGATACGGCGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATttaa < 2:835432/140‑1 (MQ=255) cGGTGGATACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATttaatt < 1:280395/140‑1 (MQ=255) aTACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATTTAATTAACCTc < 2:1337444/140‑1 (MQ=255) tACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATTTAATTAACCTCa > 2:503044/1‑140 (MQ=255) tACGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATTTAATTAACCTCa > 1:1655662/1‑140 (MQ=255) aCGGTGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATTTAATTAACCTCaa < 2:106814/140‑1 (MQ=255) | GCGCGCCGCATGAGGAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATTTAATTAACCTCAA > NC_000913/3796631‑3796901 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |