Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,206,435 | 0 | C | T | 26.7% | 101.7 / 27.7 | 60 | intergenic (‑179/‑28) | ttdR/ttdA | DNA‑binding transcriptional activator Dan/L(+)‑tartrate dehydratase subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (5/39); new base T (16/0); total (21/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.36e-10 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
GCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGA > NC_000913/3206296‑3206566 | gCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTc < 2:1085529/140‑1 (MQ=255) aaaaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCa < 1:1168129/140‑1 (MQ=255) aaaaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCa < 2:583436/140‑1 (MQ=255) aaaaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCa > 1:138247/1‑140 (MQ=255) aaaaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCa > 2:1168129/1‑140 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGa > 2:728415/1‑140 (MQ=255) cATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACa < 1:297990/140‑1 (MQ=255) cATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACa < 1:1734420/140‑1 (MQ=255) tGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGCGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAAATTTTTCAaaaaaaa > 2:1284786/1‑139 (MQ=255) tGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTg < 2:1087842/140‑1 (MQ=255) gCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTgg < 1:585592/140‑1 (MQ=255) ctctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTTAGACAAATAAAAAAAATGGa > 1:1310762/1‑140 (MQ=255) tctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAg < 1:107248/140‑1 (MQ=255) tctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAg < 1:353916/140‑1 (MQ=255) tctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAg < 1:1437164/140‑1 (MQ=255) tctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAg < 1:1284786/140‑1 (MQ=255) tGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCAGACAAATACAAAAAATGGAGtt > 1:563980/1‑140 (MQ=255) gcgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GGATTTTTTCGGAAAAAAAAAAAAAATAGAGGTgt > 2:1437164/1‑139 (MQ=255) cAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAAATTTTTCAGACAAAAAAAAAAAATGGAGTTGGCat > 2:535999/1‑140 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCatgat < 1:810975/140‑1 (MQ=255) attcattcTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCatgatg < 2:340316/140‑1 (MQ=255) ttcTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGa < 2:176125/140‑1 (MQ=255) ttcTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGa < 2:138247/140‑1 (MQ=255) ttcTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGa < 2:137908/140‑1 (MQ=255) tcTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACGACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGaa < 1:223028/140‑1 (MQ=255) ttATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTTGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GACTTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGTCATGATGAGCGAAAg < 2:1928455/140‑1 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAAATGGAGTTGGCATGATGAGGGaaaaa > 2:1300905/1‑138 (MQ=255) aTTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGta < 1:1835925/140‑1 (MQ=255) aTTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGta < 2:284785/140‑1 (MQ=255) aTTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGta < 1:728492/140‑1 (MQ=255) ttttCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACGACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAAAAAGGGATGCCATGATGAGGGGAAGaaa > 2:223028/1‑140 (MQ=255) gTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCAGACAAAAACAAAAAATGGAGTTGCCATGATGAGCGGAAGGAAAAAGCaa > 1:755808/1‑140 (MQ=255) ttGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCTCATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAAc < 1:1852401/140‑1 (MQ=255) ttGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAAc < 2:1371631/140‑1 (MQ=255) gATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAAATTTTTCAGACAAAAACAAAAAAATGAGGTGCCATGATGAGGGAAAGGAATAAACaaaaa > 1:1779046/1‑137 (MQ=255) gATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAAATTTTTCAGACAAAAACAAAAAAAGGAGTTGCCCTGATGAGGGAAAAGAATAAAAAACaa > 1:1332794/1‑139 (MQ=255) aTTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCAAACAAAAAAAAAAAATGGAGGTGTCATGATGAGCGAAAGTAATAAacaacaag > 1:216921/1‑138 (MQ=255) ttCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGc < 1:728415/140‑1 (MQ=255) gTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAg < 1:1741280/140‑1 (MQ=255) ttAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GGATTTTTTCCGACAAAAACAAAAAATGGGGTTGGCATGATGAGGGGAAGTAATAAAAAAAAAGCAGTGAATaaaa > 2:1804161/1‑138 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCAAACAAAAAAAAAAAATGGGGGTGGCATGATGAGGGAAAGTAATAAAAAAAAAGCAGTGAATAAAATGACagag > 2:1137492/1‑140 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCAAAAAAAAAAAAAAAATGGAGGTGCCCTGATGGGGGAAAATAAAAAACAAAAAGCAGTGAAAAAATTTACagag > 2:162344/1‑140 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGGG‑GAATTTTTCC‑GACAAAAACAAAAAAAGGGGTTGTCATGATTAGCGAAAGGAATAAACAAAAAGCAGGGAATAAATTGACAGAGAt > 2:1190184/1‑140 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCCCACAAAAAAAAAAAATAGAGTTGGCCTGATGAGCGAAAGAAAAAAACAACAAACAGTGAATAAATTGACAgagaa > 2:1736657/1‑139 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGAt < 1:1253634/140‑1 (MQ=255) cGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCg < 1:1804161/140‑1 (MQ=255) gTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCt < 1:98537/140‑1 (MQ=255) tGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GGATTTTTTTTGACCAATACAAAAAATAGAGATGCCCTGATGAGCGAAAGGAATAAATAAAAAGAAGAGAATAAGGTGAAAGAGAATGTCGCTa > 2:788837/1‑140 (MQ=255) tGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCAGACAAAAACAAAAAATGGAGTTGGCATGATGAGCGAAAGTAATAAACAACAGGCAGTGGAAAAAATGACAAAGAATGTCGcca > 2:83286/1‑138 (MQ=255) gCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAAATGGAGGTGGCCTGATGAGCGAAAGAAAAAAAAAAAAGGCAGGGAATAAATTGACAGAGATTGTTGCTAAc > 2:1565929/1‑140 (MQ=255) gCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCACACAAAAAAAAAAAATGGAGTTGCCATGATGAGGGAAAATAATAAAAAACAAGCAGGGAATAAAATGACAGAGAATGTCGCTAAc > 2:1708285/1‑140 (MQ=255) taAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAAATTTTTCCGACAAAAAAAAAAAATGGAGGTGGCATGATGAGGGAAAGGAAAAAACAAAAAGCAGGGAAAAAAATGAAAAAGATTGTCGCTAAATTTAACGccc > 2:1682839/1‑139 (MQ=255) aaaaaCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCa < 2:1332794/139‑1 (MQ=255) aaaaaCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCa < 1:1682276/139‑1 (MQ=255) aCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑AAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGAt < 1:1736657/140‑1 (MQ=255) cacaTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGAATTTTTCC‑GACAAAAACAAAAAATGGAGTTGGCCTGATGAGCGAAAAGAATAAACAAAAGGCAGGGAATAAATTGACAGAGAATGTCGCCAAATTTACCGCCATGAttt > 2:192705/1‑140 (MQ=255) acaTTTTTAGTGGTAGTTTGGGGG‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTc < 2:216921/140‑1 (MQ=255) caTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GGAATTTTTCAGACAAAAAAAAAAAAAGGAGGTGCCCTGATGAGGGGAAAGAAAAAAAAAAAAGCAGGGAAAAAATTTACAGAGAATGTCGCTAACTTTTTCGCCCTGAttttt > 2:1014039/1‑138 (MQ=255) caTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAAATGGAGGTGGCCTGATGAGGGAAAAGAATAAACAACAGGCAATGAATAAGATTACAGAGATTGTCGCTAAATTTACCCCCATggatttt > 2:1682276/1‑134 (MQ=255) tttttAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTAc < 1:1190184/140‑1 (MQ=255) tAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGa < 1:1300905/140‑1 (MQ=255) tAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑AAATTTTTCAAAAAAAATAAAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACGGGCAGTGAATAAGTGGAAAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGa < 2:1041130/140‑1 (MQ=255) aGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GATTTTTTCCAGACAAATAAAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCAAAATTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGaa < 2:468659/140‑1 (MQ=255) gTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCCGACAAATACAAAAAATGGAGGTGGCATGATGAGGGAAAGTAATAAACAAAAGGCAGGGAATAAATTGACAGAGATTGTTGCTAACTTTTTCGCCATTGTTTCTACCCGAAAGcc > 2:1039947/1‑140 (MQ=255) gTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCCGACAAAAAAAAAAAATGGGGTTGGCATGATGAGGGGAAGGAATAAAAAAAAAGCAGTGAAAAAATTGACAAAGATTGTCGCTTACTTTAACGCCCTGATTTTTACCCCAAAGcc > 2:542038/1‑140 (MQ=255) gTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGcc < 1:542038/140‑1 (MQ=255) ttttGTGGG‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCtga < 1:1708285/139‑1 (MQ=255) ttGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCtgatg < 1:1039947/140‑1 (MQ=255) ttGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCtgatg < 1:1682839/140‑1 (MQ=255) tgGC‑GGT‑GAATTTTTTCAGACAAAAACAAAAAATGGAGGTGCCATGATGAGCGAAAAGAATAAACAAAAGGCAGGGAAAAAATTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTTCCGCCCTGATTTTTACCCGAATGCCTGATGACg > 2:260891/1‑140 (MQ=255) ggC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgt < 1:260891/140‑1 (MQ=255) gC‑GGT‑GAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAAAAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgtg < 2:563980/140‑1 (MQ=255) gT‑GAATTTTTTCAGACAAATACAAAAAATGGAGTTGGCATGATGAGCGAAAAAAATAAACAAAAAGCAGTGAATAAATTGACAGAGAATGTCGCTAACTTTTCCGCCCTGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgtgggg > 2:1236882/1‑138 (MQ=255) gAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:1137492/140‑1 (MQ=255) | GCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGA > NC_000913/3206296‑3206566 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |