| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,558,263 | IS5 (+) +4 bp | intergenic (‑184/‑2) | rtcB ← / → rtcR | RNA‑splicing ligase/DNA‑binding transcriptional activator RtcR |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2288919 = | NA (NA) | 88 (0.940) | 52/278 | 0.4 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3558263 = | 0 (0.000) | intergenic (‑184/‑5) | rtcB/rtcR | RNA‑splicing ligase/DNA‑binding transcriptional activator RtcR | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 72 (0.780) | 50/276 | 0.5 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3558266 | 0 (0.000) | intergenic (‑187/‑2) | rtcB/rtcR | RNA‑splicing ligase/DNA‑binding transcriptional activator RtcR | |||||
GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289974‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCAC < NC_000913/3558266‑3558128 GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC > 1:992297/1‑140GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC < 2:1529947/140‑1GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC > 2:246886/1‑140GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC < 1:1416789/140‑1GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC < 1:357834/140‑1GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC > 2:412158/1‑140 AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 2:782563/140‑1 AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 1:1392811/140‑1 AAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 2:1390068/140‑1 AATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 2:705024/140‑1 CTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAT < 2:157733/140‑1 CTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATAT < 1:671448/140‑1 TTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCC < 2:1383802/140‑1 CTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTA < 2:513319/140‑1 CTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTA < 1:267679/140‑1 GGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATA < 2:15124/140‑1 CTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAA < 1:1212841/140‑1 TGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAG > 1:612112/1‑140 GACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGA < 2:1294812/140‑1 GACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGA < 1:942368/140‑1 GACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGA < 2:370583/140‑1 GACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGA < 2:87871/140‑1 GGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGA < 1:1041009/140‑1 GGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGA < 2:1000622/140‑1 GCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTA < 2:1382981/140‑1 CTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTAT < 2:111887/140‑1 TTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTA > 1:138166/1‑140 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTG > 1:753818/1‑140 GCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTT > 2:820590/1‑140 GGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGG < 2:990258/140‑1 CTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTA < 1:1033128/140‑1 CATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACG < 1:319060/140‑1 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGG > 1:699805/1‑140 GAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTA < 2:753818/140‑1 CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAG > 2:1429945/1‑140 CTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGAT > 2:807838/1‑140 GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATAT > 1:1178461/1‑140 TTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATA > 2:950369/1‑140 TATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATC < 1:182751/140‑1 TATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATC < 2:126076/140‑1 TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTT > 1:1425422/1‑140 TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTT > 2:365198/1‑140 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTA < 1:950369/140‑1 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTA > 2:566490/1‑140 CAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAA > 1:2117/1‑140 AAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGA > 2:217872/1‑140 ATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTA < 1:43311/140‑1 ATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTA > 1:64592/1‑140 ATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTA > 1:1135065/1‑140 ATCAGGGCCTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAG > 1:751303/1‑140 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAG < 2:612112/140‑1 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAG > 2:975531/1‑140 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAG > 1:940889/1‑140 AGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTG > 1:1230553/1‑140 GGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATCAAATACGATATTTCATTATCGATAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGC > 2:229735/1‑140 GGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCCTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGC < 2:940889/140‑1 GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAATTTAAGCT > 2:1033319/1‑137 GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCT > 2:370022/1‑140 GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCT < 1:1033319/137‑1 GACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGTCTTTGCGGGAAATCTCCGGCTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTT > 1:1126612/1‑140 CTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTAT > 2:1483402/1‑140 CTTGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATAT‑ATTTTTTTTAAAAAAATGAATTAAAAAATTAAGCTGGTTATT > 1:907419/1‑140 TGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTT > 2:517311/1‑140 TGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTT > 2:623224/1‑140 TGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTT > 1:107830/1‑140 TGTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTT > 2:1463350/1‑140 GTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTA > 2:1044661/1‑140 GTTCGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTA > 1:305725/1‑140 CGCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATT < 1:820590/140‑1 cccCCTTCCTTAAATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATAT‑ATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTT < 2:907419/137‑1 GCACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTT > 2:1410691/1‑140 CACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTT > 2:1194860/1‑140 CACCTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTT > 1:1457680/1‑140 CTTCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTG > 2:1052948/1‑140 TCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGC > 1:176651/1‑140 TCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGC > 2:521512/1‑140 TCCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGC > 1:1024500/1‑140 CCTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCA > 2:299600/1‑140 CTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGCCGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCAC < 2:1562928/140‑1 CTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCAC < 2:699805/140‑1 GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289974‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTTAGATATCCTTATAAAAGACGATATTTCATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAAAGATATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCAC < NC_000913/3558266‑3558128 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |