Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 753,105 | 0 | A | T | 31.2% | 143.6 / 31.5 | 80 | intergenic (‑310/+80) | ybgD/gltA | putative fimbrial protein YbgD/citrate synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (45/10); new base T (1/24); total (46/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.67e-11 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
AGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACG > NC_000913/752970‑753241 | agaCGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAAtttt < 1:73253/140‑1 (MQ=255) agaCGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAAtttt > 1:1560604/1‑140 (MQ=255) gaCGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAAttttt > 1:1409612/1‑140 (MQ=255) aCGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAAtttttt > 1:358520/1‑140 (MQ=255) aCGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAAtttttt > 1:343653/1‑140 (MQ=255) cGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATGTAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTtg > 2:573131/1‑140 (MQ=255) cGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTtg > 1:631959/1‑140 (MQ=255) cGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGAATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACCATTTTTtg > 2:1410179/1‑140 (MQ=255) gTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTtgt > 2:668172/1‑140 (MQ=255) tCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTtgtg > 1:258627/1‑140 (MQ=255) gggTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCatat < 2:168977/140‑1 (MQ=255) ttATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCAtatata > 2:160760/1‑138 (MQ=255) ttATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATaaa > 2:314709/1‑140 (MQ=255) ttATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATaaa > 2:360599/1‑140 (MQ=255) gCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGTTTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAAcc > 1:469740/1‑140 (MQ=255) gCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAAcc > 1:7536/1‑140 (MQ=255) gCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAAcc > 1:454179/1‑140 (MQ=255) gCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTAGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAAcc > 1:1351668/1‑140 (MQ=255) cGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAAccc > 2:119588/1‑140 (MQ=255) cGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAAccc > 2:1490843/1‑140 (MQ=255) gACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTTTTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCCTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACATTTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCg > 1:1313963/1‑140 (MQ=255) gACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCg > 1:285913/1‑140 (MQ=255) gACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCg > 1:767216/1‑140 (MQ=255) gACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCg > 1:1103680/1‑140 (MQ=255) tttttAATTAAAAGTTTTGGGTTGCTAATATTTTGAGCTTTTTTTTTTTTTTTAAATATTTATATAGGTTTTTTAATGGATTTTTTTTTTAAATTTTTTTGTTTTTAGGCATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAAcggc < 2:1531412/140‑1 (MQ=255) taaaaGTTTTGGGTAGTTGATATTTTGAGTTTTTTTTTTTTTTTTAAATATTTATATAGGTTTTTTAATGGTTTTTTTTTTTAAATTTTTTTGTTTTTAGGAATAAAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTaaa < 2:1351668/138‑1 (MQ=255) taaaaGTATTGGTTTGTTAATAATTTGAGTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTCTATATAGGTCTGTTAATGTATTTTTTTTTTACATTTTTTTGTGTTTACGATTAAAAAAATCATCCCGCCATATGAACGGCGGGTTaaa < 2:1560604/138‑1 (MQ=255) taaaaGTATTGGTTTGCTGATAATTTGAGCTTTTTTTTTCTTTTTAAATATTTATATAGGTCTGTTAATGGTTTTTATTTTTACATTTTTTTGTGTTTAGGAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTaaa < 2:469740/138‑1 (MQ=255) tGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTTTTTTTTTTTTTTAAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGTTTTTTTTTTTACATTTTTTTGTTTTTAGGCATAAAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTaaa < 2:1046100/140‑1 (MQ=255) tGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTaaa > 1:785390/1‑140 (MQ=255) aaaaGTTTTGGTTTGCTGATAATTTGAGCTTTTTTATTTTTTTTAAATATTTATATAGGTCTTTTAATGTTTTTTATTTTTAAATTTTTTTGTTTTTAGGAAAAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTaaaa < 2:851264/139‑1 (MQ=255) tttttGGGTTGTTAATATTTGGGGTTTTTTTTTTTTTTTAAAATTTTTATATAGGTTTTTTAATGTTTTTTTTTTTTACATTTTTTTGTTTTTAGGAAAAAAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATAtt < 2:785390/137‑1 (MQ=255) tttttGGGTTGCTAATATTTTGAGCTTTTTTTTTTTTTTAAAATATCTATATAGTTTTTTTAATGGTTTTTTTTTTTAAATTTTTTTGTTTTTAGGAATAAAAAAACCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATAtt < 2:84978/137‑1 (MQ=255) ttGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACtt > 2:433594/1‑140 (MQ=255) cTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGc < 1:160760/140‑1 (MQ=255) cTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGc > 1:1153303/1‑140 (MQ=255) cTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTATTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGGTGAAAAATTTACAACTTAga > 2:1487896/1‑139 (MQ=255) aTAATTTGAGTTTTTTTTTTTTTTTTAAATATTTATATAGGTTTGTTAATGTTTTTTATTTTTAAATTTTTTTGTTTTTAGGAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAAt < 2:1360145/140‑1 (MQ=255) aTAATTTGAGCTTTTTTTTTTTTTTTAAATATCTATATAGGTTTGTTAATGTTTTTTATTTTTACATTTTTTTGTTTTTAGGCATAAAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAAt < 2:454179/140‑1 (MQ=255) aTAATTTGAGCTTTTTTATTTTTTTTAAATATCTATATAGGTCTTTTAATGGTTTTTTTTTTTACATTTTTTTGTGTTTAGGAATAAAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAAt < 2:1191510/140‑1 (MQ=255) aaTTTGAGTTGTTTTTTTTTTTTTAAATATTTATATAGGTTTTTTAATGGTTTTTATTTTTACAATTTTTTGTTTTTAGGAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCa < 2:285913/140‑1 (MQ=255) aaTTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCa > 1:7230/1‑140 (MQ=255) aTTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCaa > 1:1191510/1‑140 (MQ=255) ggtcttttCTTTTTTTTTTAAATTTTTATAAAGTTATTTAAATGGATTTTTTTTTTAAATTTTTTTGTGTTGAGTAATAAAAAAAAAAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCAt < 2:7536/134‑1 (MQ=255) ggtttttCTTTTTTTTTTAAATATCTAAATAGGTTTGTTAATGATTTTTTTTTTTAAATTTTTTTGTTTTTAGGAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCAtt < 2:358520/135‑1 (MQ=255) gCTTTTTTATTTTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTAAATTTTTTTGTTTTTAGGCATAAAAAAACCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTa < 2:254170/140‑1 (MQ=255) gTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACg > 1:1003813/1‑140 (MQ=255) ttCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGat > 2:416326/1‑140 (MQ=255) ttttttAAATATTTATATAGTTTTTTTAATGTATTTTTTTTTTACATTTTTTTGTTTTTAGGCATAAAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGTGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGatat < 2:426552/139‑1 (MQ=255) tttttAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATc < 2:1103680/140‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGttttt > 1:608315/1‑140 (MQ=255) tttttAATGGTTTTTTTTTTTAAATTTTTTTGTTTTTAGGAATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTc < 2:218395/137‑1 (MQ=255) ttGTTATTGGATTTTTTTTTTACATTTTTTTGTGTTTAGCCAAAAAAAATGCAGCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTc < 1:1487896/139‑1 (MQ=255) ttGTTAATGTTTTTTATTTTTAAATTTTTTTGTTTTTAGAAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTc < 2:1003813/139‑1 (MQ=255) tGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCa > 1:1221337/1‑140 (MQ=255) tGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCa > 2:1342964/1‑140 (MQ=255) tGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCa > 1:1033288/1‑140 (MQ=255) tttAATGTATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTGGGAATAAAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 1:360599/139‑1 (MQ=255) tttAATGGTTTTTTTTTTTAAATTTTTTTGTTTTTAGGAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 2:1033288/139‑1 (MQ=255) tttAATGGTTTTTTTTTTTAAAATTTTTTGTGTTTAGGCATAAAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 2:1289729/139‑1 (MQ=255) tttAATGGTTTTTATTTTTAAAATTTTTTGTGTTTAGGCATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 1:1053488/139‑1 (MQ=255) tttAATGGATTTTATTTTTACATTTTTTTGTTTTTAGGCATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 2:951212/139‑1 (MQ=255) ttaaaTGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTTTTTAGGCATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 1:573131/137‑1 (MQ=255) tatAATGAATTTTATTTTTAAAATTTTTTGTTTTAAGAAAAAAAAAAACCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 2:1382453/138‑1 (MQ=255) gTTAATGGTTTTTTTTTTTACATTTTTTTGTTTTTAGGAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 2:608315/140‑1 (MQ=255) gTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 1:314709/140‑1 (MQ=255) ttAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTTCAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCata > 2:489891/1‑140 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1:118645/134‑1 (MQ=255) aaTGGTTTTTTTTTTTACATTTTTTTGTTTTTAGGCATAAAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATc < 2:158370/140‑1 (MQ=255) aaTGGTTTTTTTTTTTACATTTTTTTGTGTTTAGGCATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATc < 2:1391412/140‑1 (MQ=255) aaTGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATc < 1:660896/140‑1 (MQ=255) tttttttttttACATTTTTTTGTTTTTAGACATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGta < 1:1093722/139‑1 (MQ=255) ttattttTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATAc > 1:1472247/1‑140 (MQ=255) aCAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGAcg > 1:1156864/1‑140 (MQ=255) | AGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACG > NC_000913/752970‑753241 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |