Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,821,055 | IS5 (–) +4 bp | coding (157‑160/1359 nt) | chbC ← | N,N'‑diacetylchitobiose‑specific PTS enzyme IIC component |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1821055 = | 0 (0.000) | 164 (1.110) | 88/274 | 0.1 | 100% | coding (160/1359 nt) | chbC | N,N'‑diacetylchitobiose‑specific PTS enzyme IIC component |
? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
* | ? | NC_000913 | = 1821058 | 0 (0.000) | 151 (1.010) | 68/276 | 0.6 | 100% | coding (157/1359 nt) | chbC | N,N'‑diacetylchitobiose‑specific PTS enzyme IIC component |
? | NC_000913 | 2101749 = | NA (NA) | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
Only 100 of 308 total aligned reads displayed.
GGTGCCATTAAAGACATTATTCCTAATGTTCCGTTATATACGTTGCCGCCAATACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCATTAACGTGTGGCTGCTTTCCTATTTTAACTGCAAAAGGGAGGAGTACCTTTTCAAGCGAT > NC_000913/1820919‑1821197 | atctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAg < 1:720017‑M1/4‑1 (MQ=255) gCCATTAAAGACATTATTCCTAATGTTCCGTTATATACGTTGCCGCCAATACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGgga < 2:1504393‑M1/140‑4 (MQ=255) ggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACgttgt < 2:1325203‑M1/15‑1 (MQ=255) aGACATTATTCCTAATGTTCCGTTATATACGTTGCCGCCAATACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcga < 1:354595‑M1/140‑12 (MQ=255) ctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGttaa > 2:756262‑M1/123‑140 (MQ=255) acggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGttaatta < 1:522111‑M1/21‑1 (MQ=255) gcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACa < 1:1723710‑M1/26‑1 (MQ=255) cTAATGTTCCGTTATATACGTTGCCGCCAATACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcgggga > 2:1914030‑M1/1‑118 (MQ=255) cTAATGTTCCGTTATATACGTTGCCGCCAATACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcgggga > 2:121365‑M1/1‑118 (MQ=255) actgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACa > 2:127199‑M1/111‑140 (MQ=255) ctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGc > 1:1491885‑M1/107‑140 (MQ=255) tatataCGTTGCCGCCAATACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcgg < 2:1724895‑M1/140‑35 (MQ=255) attcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGccccc < 2:1583483‑M1/38‑1 (MQ=255) ttcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCg < 1:1462685‑M1/39‑1 (MQ=255) atataCGTTGCCGCCAATACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggc < 1:2070116‑M1/140‑36 (MQ=255) tcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGc > 2:1678767‑M1/101‑140 (MQ=255) taCGTTGCCGCCAATACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctga > 1:1295507‑M1/1‑102 (MQ=255) actgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCaa < 1:1676421‑M1/42‑1 (MQ=255) actgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCaa < 2:921484‑M1/42‑1 (MQ=255) tGCCGCCAATACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcag > 1:505319‑M1/1‑97 (MQ=255) tGCCGCCAATACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcag > 2:961514‑M1/1‑97 (MQ=255) tGCCGCCAATACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcag > 1:2517951‑M1/1‑97 (MQ=255) tGCCGCCAATACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcag > 1:2493915‑M1/1‑97 (MQ=255) ggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTa < 1:1853404‑M1/48‑1 (MQ=255) gccgccAATACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagt > 1:4728‑M1/1‑96 (MQ=255) gccgccAATACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagt < 2:1138600‑M1/140‑45 (MQ=255) gccgccAATACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagt < 2:2493915‑M1/140‑45 (MQ=255) cgccAATACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtca > 1:1646298‑M1/1‑94 (MQ=255) cgccAATACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgact > 1:1245468‑M1/1‑94 (MQ=255) gccAATACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcat < 2:310479‑M1/140‑48 (MQ=255) ccAATACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatt > 1:617631‑M1/1‑92 (MQ=255) aTACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttca < 2:1059437‑M1/140‑52 (MQ=255) taagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCAtt > 2:822531‑M1/85‑140 (MQ=255) tACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcat < 2:511647‑M1/140‑53 (MQ=255) tttCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGA‑GCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttctt < 1:1753283‑M1/140‑58 (MQ=255) gactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATa < 1:2268599‑M1/65‑1 (MQ=255) aCCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgt > 1:1007674‑M1/1‑78 (MQ=255) tcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAg > 2:2216117‑M1/73‑140 (MQ=255) tAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgag < 1:1574203‑M1/140‑68 (MQ=255) aGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagcc < 1:1109996‑M1/140‑70 (MQ=255) ccctgttctatggctccagatgactaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGa < 1:1806649‑M1/78‑1 (MQ=255) ctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGAtt < 2:2052126‑M1/80‑1 (MQ=255) ctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGACATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGAtt > 1:579705‑M1/61‑140 (MQ=255) cAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttt < 1:405709‑M1/140‑77 (MQ=255) cAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttt < 2:564903‑M1/140‑77 (MQ=255) aaTGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgatttttt < 1:1443582‑M1/140‑78 (MQ=255) ttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCa < 2:322051‑M1/83‑1 (MQ=255) tctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCAt > 1:389423‑M1/57‑140 (MQ=255) gTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcc > 2:597569‑M1/1‑59 (MQ=255) gTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttct > 2:638773‑M1/1‑59 (MQ=255) tGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccg > 2:268642‑M1/1‑57 (MQ=255) tggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCATTAAc < 2:2045666‑M1/88‑1 (MQ=255) ccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCAtt > 1:313938‑M1/48‑132 (MQ=255) ccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCATTAACGtgtg < 1:1273051‑M1/93‑1 (MQ=255) ccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCATTAACGtgtg < 2:878902‑M1/93‑1 (MQ=255) ccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCATTAACGtgtg < 2:1449519‑M1/93‑1 (MQ=255) cGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgcc < 2:1007674‑M1/140‑92 (MQ=255) atgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCATTAACGTGTGgctg > 2:1827693‑M1/44‑140 (MQ=255) cGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaa < 1:1914030‑M1/140‑97 (MQ=255) gAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaat < 1:961514‑M1/140‑98 (MQ=255) aTACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatca < 1:1599170‑M1/140‑100 (MQ=255) acatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCATTAACGTGTGGCTGCTTTCCt < 1:1037585‑M1/104‑1 (MQ=255) aCCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagc < 2:2267242‑M1/140‑102 (MQ=255) tAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagccta > 2:2376373‑M1/1‑36 (MQ=255) aGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatt > 2:153352‑M1/1‑34 (MQ=255) atatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCATTAACGTGTGGCTGCTTTCCTATTTTAACTg < 1:1409598‑M1/114‑1 (MQ=255) tAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagac < 2:1646638‑M1/140‑112 (MQ=255) tAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcag > 2:1596839‑M1/1‑29 (MQ=255) aaaaaaaCGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagacc > 1:116075‑M1/1‑28 (MQ=255) gggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCATTAACGTGTGGCTGCTTTCCTATTTTAACTGCAAAAg < 1:264324‑M1/120‑1 (MQ=255) gggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCATTAACGTGTGGCTGCTTTCCTATTTTAACTGCAAAAg < 2:2159380‑M1/120‑1 (MQ=255) ggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCATTAACGTGTGGCTGCTTTCCTATTTTAACTGCAAAAgg < 2:791260‑M1/121‑1 (MQ=255) ggacttgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCATTAACGTGTGGCTGCTTTCCTATTTTAACTGCAAAAgg < 1:2105594‑M1/121‑1 (MQ=255) cGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttctt > 1:219192‑M1/1‑21 (MQ=255) cGACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctat > 2:677489‑M1/1‑21 (MQ=255) gACCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttc < 2:1246510‑M1/140‑121 (MQ=255) aCCCCTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcg > 1:2263453‑M1/1‑19 (MQ=255) tgttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCATTAACGTGTGGCTGCTTTCCTATTTTAACTGCAAAAGggagga < 1:270799‑M1/126‑1 (MQ=255) ccccTCCCCAAAGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcacgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgc < 2:112739‑M1/140‑123 (MQ=255) gttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCATTAACGTGTGGCTGCTTTCCTATTTTAACTGCAAAAGGgaggag < 2:2332707‑M1/127‑1 (MQ=255) gttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCATTAACGTGTGGCTGCTTTCCTATTTTAACTGCAAAAGGgaggag < 1:343594‑M1/127‑1 (MQ=255) gttcgcaccttccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCC‑GCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATCTTTGATTGCATTAACGTGTGGCTGCTTTCCTATTTTAACTGCAAAAGGGAGGAGt > 1:672061‑M1/14‑140 (MQ=255) tccTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCATTAACGTGTGGCTGCTTTCCTATTTTAACTGCAAAAGGGAGGAGTACCTTTTCa > 1:1135490‑M1/4‑140 (MQ=255) aGCTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcg > 2:723591‑M1/1‑7 (MQ=255) cTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcaggctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgtt < 2:398397‑M1/140‑136 (MQ=255) cTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCATTAACGTGTGGCTGCTTTCCTATTTTAACTGCAAAAGGGAGGAGTACCTTTTCAAg > 2:2105594‑M1/2‑140 (MQ=255) cTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCATTAACGTGTGGCTGCTTTCCTATTTTAACTGCAAAAGGGAGGAGTACCTTTTCAAg > 1:679699‑M1/2‑140 (MQ=255) tAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttat > 1:1987283‑M1/1‑3 (MQ=255) tAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttat < 2:1306834‑M1/140‑138 (MQ=255) tAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttat > 2:447740‑M1/1‑3 (MQ=255) tAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttat < 2:1986032‑M1/140‑138 (MQ=255) aGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatc > 1:2353037‑M1/1‑2 (MQ=255) aGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatc > 1:2378393‑M1/1‑2 (MQ=255) aGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatc > 2:2419173‑M1/1‑2 (MQ=255) aGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatc > 1:760731‑M1/1‑2 (MQ=255) aGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatc > 1:1372489‑M1/1‑2 (MQ=255) aGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCATTAACGTGTGGCTGCTTTCCTATTTTAACTGCAAAAGGGAGGAGTACCTTTTCAAGCGa < 1:487473/140‑1 (MQ=255) aGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCATTAACGTGTGGCTGCTTTCCTATTTTAACTGCAAAAGGGAGGAGTACCTTTTCAAGCGa < 1:860114/140‑1 (MQ=255) gggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatcc < 1:736872‑M1/140‑140 (MQ=255) gggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatcc < 2:1410222‑M1/140‑140 (MQ=255) | GGTGCCATTAAAGACATTATTCCTAATGTTCCGTTATATACGTTGCCGCCAATACCTTTCAGACCATTAAGTGTTTCAATGGTTGAGGCGTCGAGGCGAATACCTAAGGAATAAAAAAACGACCCCTCCCCAAAGCTTAGAAAAACGTTGTTAATTAATACAAACATGGCCCCCGCAAGGGTTAACGGCATTAAGCGAATAAAGCCATTTTTGATTGCATTAACGTGTGGCTGCTTTCCTATTTTAACTGCAAAAGGGAGGAGTACCTTTTCAAGCGAT > NC_000913/1820919‑1821197 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |