| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 3,671,365 | Δ13 bp | coding (518‑530/603 nt) | yhjB ← | putative DNA‑binding transcriptional regulator YhjB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3671364 | 1 (0.010) | 93 (0.620) | 50/276 | 1.5 | 98.9% | coding (531/603 nt) | yhjB | putative DNA‑binding transcriptional regulator YhjB |
| ? | NC_000913 | 3671378 = | 1 (0.010) | coding (517/603 nt) | yhjB | putative DNA‑binding transcriptional regulator YhjB | |||||
TAATATTTTTACAGCCAGCCGCTAACTTCCTGCTGGCTGTAAAATTATCCTCTTCAGGAGGAGATATTTAACATCATTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCT > NC_000913/3671239‑3671517 | gtacggcgaaccataatatttttacagccagccgctaacttcctgctggctgtaaaattatcctcttcaggaggagatatttaacatcattgccgcctgggtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggattccc < 1:690861‑M2/1‑1 (MQ=255)gtacggcgaaccataatatttttacagccagccgctaacttcctgctggctgtaaaattatcctcttcaggaggagatatttaacatcattgccgcctgggtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggattccc < 2:791970‑M2/1‑1 (MQ=255)gtacggcgaaccataatatttttacagccagccgctaacttcctgctggctgtaaaattatcctcttcaggaggagatatttaacatcattgccgcctgggtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggattccc < 2:2124112‑M2/1‑1 (MQ=255)gtacggcgaaccataatatttttacagccagccgctaacttcctgctggctgtaaaattatcctcttcaggaggagatatttaacatcattgccgcctgggtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggattccc < 2:237544‑M2/1‑1 (MQ=255) 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1:1647827‑M2/134‑140 (MQ=255) aaccataatatttttacagccagccgctaacttcctgctggctgtaaaattatcctcttcaggaggagatatttaacatcattgccgcctgggtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggattccCCGTTCCgg < 2:2167504‑M2/9‑1 (MQ=255) aaccataatatttttacagccagccgctaacttcctgctggctgtaaaattatcctcttcaggaggagatatttaacatcattgccgcctgggtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggattccCCGTTCCgg < 1:1698499‑M2/9‑1 (MQ=255) aaccataatatttttacagccagccgctaacttcctgctggctgtaaaattatcctcttcaggaggagatatttaacatcattgccgcctgggtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggattccCCGTTCCgg < 2:2058035‑M2/9‑1 (MQ=255) aaccataatatttttacagccagccgctaacttcctgctggctgtaaaattatcctcttcaggaggagatatttaacatcattgccgcctgggtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggattccCCGTTCCgg < 1:1025819‑M2/9‑1 (MQ=255) aaccataatatttttacagccagccgctaacttcctgctggctgtaaaattatcctcttcaggaggagatatttaacatcattgccgcctgggtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggactccCCGTTCCgg < 2:1750643‑M2/9‑1 (MQ=255) 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1:10065‑M2/37‑1 (MQ=255) aacttcctgctggctgtaaaattatcctcttcaggaggagatatttaacatcattgccgcctgggtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggattccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGAtctc < 1:687353‑M2/37‑1 (MQ=255) acttcctgctggctgtaaaattatcctcttcaggaggagatatttaacatcattgccgcctgggtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggattccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTcc < 1:1765563‑M2/38‑1 (MQ=255) ttcctgctggctgtaaaattatcctcttcaggaggagatatttaacatcattgccgcctgggtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggattccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCtt > 1:2250975‑M2/101‑140 (MQ=255) tcctgctggctgtaaaattatcctcttcaggaggagatatttaacatcattgccgcctgggtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggattccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTa < 1:684864‑M2/41‑1 (MQ=255) cctgctggctgtaaaattatcctcttcaggaggagatatttaacatcattgccgcctgggtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggattccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGAt > 2:1916214‑M2/99‑132 (MQ=255) 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2:1942394‑M2/54‑140 (MQ=255) tcattgccgcctgggtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggattccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTggcggg > 1:648326‑M2/54‑140 (MQ=255) cattgccgcctgggtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggattccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTggcgggc > 1:713028‑M2/53‑140 (MQ=255) cattgccgcctgggtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggattccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTggcgggc > 2:2262461‑M2/53‑140 (MQ=255) cattgccgcctgggtgcgatttttcacttacagacggcgatacagggattccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTggcgggc > 2:1157574‑M2/53‑140 (MQ=255) attgccgcctgggtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggattccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTggcgggcg > 1:1991410‑M2/52‑140 (MQ=255) ttgccgcctgggtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggattccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGgcgc > 2:1512756‑M2/51‑140 (MQ=255) ttgccgcctgggtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggattccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGgcgc > 1:303635‑M2/51‑140 (MQ=255) ggtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggattccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGAttt > 2:673902‑M2/41‑140 (MQ=255) gtgcgatttttcacttccagacggcgatacagggattccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTg > 1:682665‑M2/40‑140 (MQ=255) cgatttttcacttccagacggcgatacagggattccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTgaga > 1:343569‑M2/37‑140 (MQ=255) cgatttttcacttccagacggcgatacagggattccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTgaga > 1:299273‑M2/37‑140 (MQ=255) cgatacagggattccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGc > 1:1002758‑M2/16‑140 (MQ=255) attccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGcc > 1:2022075‑M2/6‑140 (MQ=255) attccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGcc > 1:2018860‑M2/6‑140 (MQ=255) ttccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCa > 2:2464380‑M2/5‑140 (MQ=255) ccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGt > 1:1889607‑M2/3‑140 (MQ=255) ccCCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGt > 1:1642176‑M2/3‑140 (MQ=255) ccGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGtct > 1:1676398/1‑140 (MQ=255) | TAATATTTTTACAGCCAGCCGCTAACTTCCTGCTGGCTGTAAAATTATCCTCTTCAGGAGGAGATATTTAACATCATTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCT > NC_000913/3671239‑3671517 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |