Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,619,291 | G→T | V58F (GTT→TTT) | marR → | DNA‑binding transcriptional repressor MarR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,619,291 | 0 | G | T | 98.9% | 324.9 / NA | 94 | V58F (GTT→TTT) | marR | DNA‑binding transcriptional repressor MarR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (43/50); minor base C (1/0); total (44/50) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.68e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TTCCATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGTAAAACTTACCACCGG > NC_000913/1619154‑1619427 | ttCCATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGttt > 2:1474726/1‑140 (MQ=255) ccATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGa < 1:71656/140‑1 (MQ=255) ccATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGa < 1:396137/140‑1 (MQ=255) ttGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACt > 1:500319/1‑140 (MQ=255) gggTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGa < 1:871327/140‑1 (MQ=255) ggTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGaa < 2:865471/140‑1 (MQ=255) gTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGaaa < 1:1058377/140‑1 (MQ=255) gTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGaaa < 1:220497/140‑1 (MQ=255) gTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGaaa > 1:1281059/1‑140 (MQ=255) tCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGaaaa < 2:1809865/140‑1 (MQ=255) tCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGaaaa > 1:255095/1‑140 (MQ=255) tCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGaaaa > 2:68761/1‑140 (MQ=255) tCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGaaaa > 1:122540/1‑140 (MQ=255) cGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGaaaaa < 2:1032502/140‑1 (MQ=255) cTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACCGAAAAAgg > 1:1354241/1‑140 (MQ=255) aTCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTAtt < 2:255095/140‑1 (MQ=255) tCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTg > 1:1629058/1‑140 (MQ=255) atGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTgtcggt > 2:876846/1‑140 (MQ=255) atGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTgtcggt < 2:707731/140‑1 (MQ=255) atGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTgtcggt > 2:48215/1‑140 (MQ=255) atGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTgtcggt > 2:1654820/1‑140 (MQ=255) aaTCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCt < 2:1629058/140‑1 (MQ=255) aTCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTg > 1:958518/1‑140 (MQ=255) tCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTgg < 2:500319/140‑1 (MQ=255) tCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTgg < 2:135800/140‑1 (MQ=255) agaaagaTCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCa > 2:390034/1‑140 (MQ=255) agaaagaTCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCa > 1:1450257/1‑140 (MQ=255) agaaagaTCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCT‑GGAGCAc > 2:546725/1‑140 (MQ=255) gaTCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGCGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGAc > 1:1127822/1‑140 (MQ=255) tCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGAccc < 2:1687815/140‑1 (MQ=255) tCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGAccc < 2:274395/140‑1 (MQ=255) tCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGAccc < 1:1373103/140‑1 (MQ=255) acagatacTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGAccc < 2:1588472/133‑1 (MQ=255) gCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGt > 2:145137/1‑140 (MQ=255) gCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGt > 2:1109837/1‑140 (MQ=255) gCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGt > 2:1006663/1‑140 (MQ=255) cTGTTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTAt < 2:973978/140‑1 (MQ=255) tGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATg > 1:1064966/1‑140 (MQ=255) tAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTgg < 2:1794827/140‑1 (MQ=255) tAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTgg < 1:930081/140‑1 (MQ=255) aGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGc < 2:1450257/140‑1 (MQ=255) gTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGcc < 1:1730974/140‑1 (MQ=255) aTCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGTACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTg > 1:1536471/1‑140 (MQ=255) aTCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCTGTATGCTGGATCGCCTg > 2:1323457/1‑140 (MQ=255) aTCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTg < 2:1681863/140‑1 (MQ=255) aTCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTg > 1:1608162/1‑140 (MQ=255) aTCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTg > 1:395037/1‑140 (MQ=255) aTCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTg > 2:790513/1‑140 (MQ=255) tCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGGTCGCCTgg < 2:1243157/140‑1 (MQ=255) tCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTgg < 1:289505/140‑1 (MQ=255) cTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGt < 2:396993/140‑1 (MQ=255) gTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCt < 1:478435/140‑1 (MQ=255) tGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGc < 2:1245911/140‑1 (MQ=255) ggATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCt < 1:1765097/140‑1 (MQ=255) tACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTgg > 1:1027943/1‑140 (MQ=255) cgGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGGTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAgg > 2:1530035/1‑140 (MQ=255) cgGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGCGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAgg > 2:933131/1‑140 (MQ=255) cgGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAgg > 2:1048180/1‑140 (MQ=255) cgGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAgg > 1:1093824/1‑140 (MQ=255) cgGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAgg > 1:503110/1‑140 (MQ=255) cgGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAgg > 1:585395/1‑140 (MQ=255) cgGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGCGGAAAgg > 2:575411/1‑140 (MQ=255) aGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCg < 1:1522728/140‑1 (MQ=255) aGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCg < 2:1064966/140‑1 (MQ=255) aGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCg < 2:1038516/140‑1 (MQ=255) gTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGa < 1:48215/140‑1 (MQ=255) tttAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGaa < 1:481823/140‑1 (MQ=255) tAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAAcc < 1:1488092/140‑1 (MQ=255) tAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAAcc < 2:958518/140‑1 (MQ=255) tctgctctATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGAc > 2:849160/1‑140 (MQ=255) tctgctctATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGAc > 2:1806337/1‑140 (MQ=255) tctgctctATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGAc > 2:1698172/1‑140 (MQ=255) tctgctctATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGAc > 1:1565181/1‑140 (MQ=255) tctATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAgcg < 1:1530035/140‑1 (MQ=255) tATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGcgcg < 1:68761/140‑1 (MQ=255) tCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCgcggc > 1:274897/1‑140 (MQ=255) cGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGTACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGt < 2:1536471/140‑1 (MQ=255) cGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAGCCCGAATGACAAGCGCGGCGt < 1:933131/140‑1 (MQ=255) cGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGt < 1:1006663/140‑1 (MQ=255) cGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGt < 2:1565181/140‑1 (MQ=255) cGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGt < 1:1806337/140‑1 (MQ=255) cGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGt < 2:1227820/140‑1 (MQ=255) gCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTa < 1:10226/140‑1 (MQ=255) tGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACt > 2:1707411/1‑140 (MQ=255) tGCGCGGCGTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACt > 1:876009/1‑140 (MQ=255) gcggcgTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGcgcg > 1:1214222/1‑130 (MQ=255) gcggcgTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGcgcg < 2:1214222/130‑1 (MQ=255) gcggcgTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGt < 2:337841/134‑1 (MQ=255) gcggcgTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGt > 1:337841/1‑134 (MQ=255) gcggcgTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt > 1:506809/1‑140 (MQ=255) gcggcgTGTATTACTCCGCTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGATGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt > 1:1299962/1‑140 (MQ=255) cggcgTGTATTACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGTa < 2:1281059/140‑1 (MQ=255) tACTCCGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGTAAAACTTacca > 1:1534297/1‑140 (MQ=255) ccGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGTAAAACTTACCACcgg < 2:122540/140‑1 (MQ=255) ccGTTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGTAAAACTTACCACcgg < 1:30463/140‑1 (MQ=255) | TTCCATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGTAAAACTTACCACCGG > NC_000913/1619154‑1619427 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |