New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1014929 = | 56 (1.040) | 3 (0.060) | 3/260 | 5.0 | 5.3% | coding (34/564 nt) | pqiC | intermembrane transport lipoprotein PqiC |
? | NC_000913 | 1015018 = | 54 (1.060) | coding (123/564 nt) | pqiC | intermembrane transport lipoprotein PqiC | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GAAGAGGGCGAAACAATGAAAAAGTGGCTAGTGACGATTGCAGCACTGTGGCTGGCCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGTATGTGATTGCCAACAACAACTTGTGGGCCAGCCCGTTGGATCAACAG > NC_000913/1014881‑1015153 | gAAGAGGGCGAAACAATGAAAAAGTGGCTAGTGACGATTGCAGCACTGTGGCTGGCCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAggg > 2:22475/1‑140 (MQ=255) gAAGAGGGCGAAACAATGAAAAAGTGGCTAGTGACGATTGCAGCACTGTGGCTGGCCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAggg > 2:829636/1‑140 (MQ=255) ggCGAAACAATGAAAAAGTGGCTAGTGACGATTGCAGCACTGTGGCTGGCCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCg > 1:761575/1‑140 (MQ=255) gCGAAACAATGAAAAAGTGGCTAGTGACGATTGCAGCACTGTGGCTGGCCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGt < 1:154509/140‑1 (MQ=255) gCGAAACAATGAAAAAGTGGCTAGTGACGATTGCAGCACTGTGGCTGGCCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGt < 1:497441/140‑1 (MQ=255) gCGAAACAATGAAAAAGTGGCTAGTGACGATTGCAGCACTGTGGCTGGCCGGATGAAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGt < 1:310604/140‑1 (MQ=255) aCAATGAAAAAGTGGCTAGTGACGATTGCAGCGCTGTGGCTGGCCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGtt < 2:350406/140‑1 (MQ=255) aCAATGAAAAAGTGGCTAGTGACGATTGCAGCACTGTGGCTGGCCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGtt < 1:134420/140‑1 (MQ=255) gAAAAAGTGGCTAGTGACGATTGCAGCACTGTGGCTGGCCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATggg < 2:761575/140‑1 (MQ=255) aaaGTGGCTAGTGACGATTGCAGCACTGTGGCTGGCCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTag < 2:160736/140‑1 (MQ=255) aaGTGGCTAGTGACGATTGCAGCACTGTGGCTGGCCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCTGGGCAATCGTCTGTTATGGGTaga < 2:306681/140‑1 (MQ=255) tGGCTAGTGACGATTGCAGCACTGTGGCTGGCCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCa > 2:232421/1‑140 (MQ=255) cTAGTGACGATTGCAGCACTGTGGCTGGCCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt < 1:657852/140‑1 (MQ=255) cTAGTGACGATTGCAGCACTGTGGCTGGCCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt < 1:89585/140‑1 (MQ=255) tAGTGACGATTGCAGCACTGTGGCTGGCCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACC‑GTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCa < 1:98190/140‑1 (MQ=255) gTGACGATTGCAGCACTGTGGCTGGCCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCAc < 2:126310/140‑1 (MQ=255) gTGACGATTGCAGCACTGTGGCTGGCCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAACAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCAc > 1:779401/1‑140 (MQ=255) ttGCAGCACTGTGGCTGGCCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCt < 1:258217/140‑1 (MQ=255) tctggctggcCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTg < 2:321781/138‑1 (MQ=255) tggctggcCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGc > 2:768853/1‑140 (MQ=255) ggcCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGa < 1:22475/140‑1 (MQ=255) ggcCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGa > 1:175415/1‑140 (MQ=255) cGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATg > 1:849255/1‑140 (MQ=255) ggATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATgg < 2:692604/140‑1 (MQ=255) gATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGgt > 1:666647/1‑140 (MQ=255) ccGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTAt < 2:285870/140‑1 (MQ=255) cGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATc > 2:835241/1‑140 (MQ=255) ggCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGgtg > 1:291874/1‑130 (MQ=255) ggCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGgtg < 2:291874/130‑1 (MQ=255) gCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCaa > 2:367351/1‑140 (MQ=255) gAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAAc < 1:835241/140‑1 (MQ=255) aaTTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCa < 1:136095/140‑1 (MQ=255) aataaAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGa < 2:547834/140‑1 (MQ=255) taaAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGAtg < 1:829636/140‑1 (MQ=255) aaaaCTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGAtgtg < 1:768853/140‑1 (MQ=255) cTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCa > 1:721633/1‑128 (MQ=255) cTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCa < 2:721633/128‑1 (MQ=255) cTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGt < 2:779401/140‑1 (MQ=255) aCCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGTAtgtg > 1:55528/1‑140 (MQ=255) ccAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCa > 1:746480/1‑122 (MQ=255) ccAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCa < 2:746480/122‑1 (MQ=255) aGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGTATGTGAtt < 1:756084/140‑1 (MQ=255) tACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGTATGTGATTGcc < 1:698808/140‑1 (MQ=255) aCCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGTATGTGATTGCca < 2:666647/140‑1 (MQ=255) ggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGTATGTGATTGCcaacaaca < 2:175415/140‑1 (MQ=255) tgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGTATGTGATTGCCaacaacaac > 2:793192/1‑140 (MQ=255) tgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGTATGTGATTGCCaacaacaac > 2:805048/1‑140 (MQ=255) tgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAAGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGTATGTGATTGCCaacaacaac > 2:549532/1‑140 (MQ=255) agagCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGTATGTGATTGCCAACAACAACTtg < 1:349737/140‑1 (MQ=255) aaaGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGTATGTGATTGCCAACAACAACTTGTGGGCCAGCCCg > 1:265821/1‑140 (MQ=255) aGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGTATGTGATTGCCAACAACAACTTGTGGGCCAGCCCGtt > 1:891504/1‑140 (MQ=255) aGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGTATGTGATTGCCAACAACAACTTGTGGGCCAGCCCGtt > 2:109168/1‑140 (MQ=255) aCCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGCGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGCGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGTATGTGATTGCCAACAACAACTTGTGGGCCAGCCCGTTggg > 2:46667/1‑139 (MQ=255) aCCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGTATGTGATTGCCAACAACAACTTGTGGGCCAGCCCGTTGGa > 2:839297/1‑140 (MQ=255) cGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGTATGTGATTGCCAACAACAACTTGTGGGCCAGCCCGTTGGATc < 1:387855/140‑1 (MQ=255) gccagccaGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGTATGTGATTGCCAACAACAACTTGTGGGCCAGCCCGTTGGATCa > 1:586490/1‑140 (MQ=255) cagccagGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGTATGTGATTGCCAACAACAACTTGTGGGCCAGCCCGTTGGATCAAc < 1:793192/140‑1 (MQ=255) cagccagGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGTATGTGATTGCCAACAACAACTTGTGGGCCAGCCCGTTGGATCAAc > 1:43009/1‑140 (MQ=255) gccagGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGTATGTGATTGCCAACAACAACTTGTGGGCCAGCCCGTTGGATCAACAg > 1:219036/1‑140 (MQ=255) | GAAGAGGGCGAAACAATGAAAAAGTGGCTAGTGACGATTGCAGCACTGTGGCTGGCCGGATGCAGCTCCGGCGAAATTAATAAAAACTATTACCAGTTACCTGTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGTCACTGTTCCTGACTATCTGGCGGGGAATGGTGTGGTTTATCAAACCAGTGATGTGAAGTATGTGATTGCCAACAACAACTTGTGGGCCAGCCCGTTGGATCAACAG > NC_000913/1014881‑1015153 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |