New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 4374499 = | NA (NA) | noncoding (1/34 nt) | other | REP329a | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
AAGGTTAATTATTGGTGTTAGCTATATAAAAAGTAACAACAGCAATGCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTG > NC_000913/4374364‑4374634 | aagGTTAATTATTGGTGTTAGCTATATAAAAAGTAACAACAGCAATGCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGa < 1:1169476/140‑1 (MQ=255) gTTAATTATTGGTGTTAGCTATATAAAAAGTAACAACAGCAATGCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGc > 1:549927/1‑140 (MQ=255) ttattGGTGTTAGCTATATAAAAAGTAACAACAGCAATGCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGt > 1:570991/1‑140 (MQ=255) ggTGTTAGCTATATAAAAAGTAACAACAGCAATGCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACg > 1:936295/1‑140 (MQ=255) 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(MQ=255) aaTGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAAtttt < 2:461249/140‑1 (MQ=255) aaTGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAAtttt > 2:1110852/1‑140 (MQ=255) aCAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATg < 2:1074638/140‑1 (MQ=255) ggTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGAATCAGGCAATTTTAATGttt > 1:1352548/1‑140 (MQ=255) gTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTa > 1:1731937/1‑140 (MQ=255) tGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGtt > 2:1747134/1‑140 (MQ=255) tGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGtt < 2:2003927/140‑1 (MQ=255) tGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGtt > 2:356289/1‑140 (MQ=255) tGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGtt < 2:1352548/140‑1 (MQ=255) gTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGGCTACAGTTCATTGCAAATCTATGCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTaa < 2:854382/140‑1 (MQ=255) gTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTaa < 2:90466/140‑1 (MQ=255) tttGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAAt < 1:1473636/140‑1 (MQ=255) gttgCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAg < 2:748128/140‑1 (MQ=255) ctTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTActg < 1:1110852/140‑1 (MQ=255) | AAGGTTAATTATTGGTGTTAGCTATATAAAAAGTAACAACAGCAATGCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTG > NC_000913/4374364‑4374634 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |