| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 4,030,318 | C→A | K218N (AAG→AAT) | fadB ← | dodecenoyl‑CoA delta‑isomerase, enoyl‑CoA hydratase, 3‑hydroxybutyryl‑CoA epimerase, 3‑hydroxyacyl‑CoA dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,030,318 | 0 | C | A | 100.0% | 289.4 / NA | 82 | K218N (AAG→AAT) | fadB | dodecenoyl‑CoA delta‑isomerase, enoyl‑CoA hydratase, 3‑hydroxybutyryl‑CoA epimerase, 3‑hydroxyacyl‑CoA dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (54/28); total (54/28) | |||||||||||
GGGCCGCAGCTTCAATGGTTTTTACTGCGGTGATGGGGGCCGGATAATGTTTCCCCGCTGTTTGTGCGACCATCCCTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGCTTCGGCTGACGTTTTGCTTTCCAGTCGAGGTCGCCGTTAATGGCCTGGCGTAAAACCGCCTTTGCGCCTTCAACCAGTTTTTCTGCTTTGACTACGCCATCCACCAGACCGATTTTCAGCGCCTGATCCGCGCC > NC_000913/4030185‑4030452 | gggCCGCAGCTTCAATGGTTTTTACTGCGGTGATGGGGGCCGGATAATGTTTCCCCGCTGTTTGTGCGACCATCCCTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGc < 1:2157916/140‑1 (MQ=255) gCCGCAGCTTCAATGGTTTTTACTGCGGTGATGGGGGCCGGATAATGTTTCCCCGCTGTTTGTGCGACCATCCCTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGCTg > 2:1007042/1‑140 (MQ=255) cGCAGCTTCAATGGTTTTTACTGCGGTGATGGGGGCCGGATAATGTTTCCCCGCTGTTTGTGCGACCATCCCTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGCTGAc > 1:455826/1‑140 (MQ=255) cGCAGCTTCAATGGTTTTTACTGCGGTGATGGGGGCCGGATAATGTTTCCCCGCTGTTTGTGCGACCATCCCTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGCTGAc > 1:1717230/1‑140 (MQ=255) cAGCTTCAATGGTTTTTACTGCGGTGATGGGGGCCGGATAATGTTTCCCCGCTGTTTGTGCGACCATCCCTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGCTGACGt > 1:899716/1‑140 (MQ=255) aGCTTCAATGGTTTTTACTGCGGTGATGGGGGCCGGATAATGTTTCCCCGCTGTTTGTGCGACCATCCCTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGCTGACGtt > 1:1858081/1‑140 (MQ=255) ttCAATGGTTTTTACTGCGGTGATGGGGGCCGGATAATGTTTCCCCGCTGTTTGTGCGACCATCCCTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGCTGACGTTTTg < 2:1858081/140‑1 (MQ=255) ttttACTGCGGTGATGGGGGCCGGATAATGTTTCCCCGCTGTTTGTGCGACCATCCCTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGCTGACGTTTTGCTTTCCAGt > 2:1188427/1‑140 (MQ=255) ttttACTGCGGTGATGGGGGCCGGATAATGTTTCCCCGCTGTTTGTGCGACCATCCCTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGCTGACGTTTTGCTTTCCAGt > 2:645450/1‑140 (MQ=255) tttACTGCGGTGATGGGGGCCGGATAATGTTTCCCCGCTGTTTGTGCGACCATCCCTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGCTGACGTTTTGCTTTCCAGTc > 1:2012646/1‑140 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ccGGATAATGTTTCCCCGCTGTTTGTGCGACCATCCCTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGCTGACGTTTTGCTTTCCAGTCGAGGTCGCCGTTAATGGcc < 1:2209387/140‑1 (MQ=255) cGGATAATGTTTCCCCGCTGTTTGTGCGACCATCCCTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGCTGACGTTTTGCTTTCCAGTCGAGGTCGCCGTTAATGGCCt > 1:1963121/1‑140 (MQ=255) cGGATAATGTTTCCCCGCTGTTTGTGCGACCATCCCTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGCTGACGTTTTGCTTTCCAGTCGAGGTCGCCGTTAATGACCt < 2:2222356/140‑1 (MQ=255) gATAATGTTTCCCCGCTGTTTGTGCGACCATCCCTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGCTGACGTTTTGCTTTCCAGTCGAGGTCGCCGTTAATGGCCTgg < 2:1963121/140‑1 (MQ=255) ttCCCCGCTGTTTGTGCGACCATCCCTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGCTGACGTTTTGCTTTCCAGTCGAGGTCGCCGTTAATGGcc > 1:1020900/1‑129 (MQ=255) ttCCCCGCTGTTTGTGCGACCATCCCTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGCTGACGTTTTGCTTTCCAGTCGAGGTCGCCGTTAATGGcc < 2:1020900/129‑1 (MQ=255) 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cATCCCTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGCTGACGTTTTGCTTTCCAGTCGAGGTCGCCGTTAATGGCCTGGCGTAAAACCGCCTTTGCGCCTTCAACCa > 2:766822/1‑140 (MQ=255) tCCCTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGCTGACGTTTTGCTTTCCAGTCGAGGTCGCCGTTAATGGCCTGGCGTAAAACCGCCTTTGCGCCTTCAACCAGt > 1:71662/1‑140 (MQ=255) tCCCTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGCTGACGTTTTGCTTTCCAGTCGAGGTCGCCGTTAATGGCCTGGCGTAAAACCGCCTTTGCGCCTTCAACCAGt > 1:2059225/1‑140 (MQ=255) ccTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGCTGACGTTTTGCTTTCCAGTCGAGGTCGCCGTTAATGGCCTGGCGTAAAACCGCCTTTGCGCCTTCa < 2:1046173/132‑1 (MQ=255) ccTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGCTGACGTTTTGCTTTCCAGTCGAGGTCGCCGTTAATGGCCTGGCGTAAAACCGCCTTTGCGCCTTCa > 1:1046173/1‑132 (MQ=255) cTTTAGCGATGGTGAAGCTCATGGTGGCTTCAATCTTGCTCAGTTTTAGTGGTTCCAGATTCGGCTGACGTTTTGCTTTCCAGTCGAGGTCGCCGTTAATGGCCTGGCGTAAAACCGCCTTTGCGCCTTCAACCAGtttt < 2:1804846/140‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |