| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 369,465 | C→A | F285L (TTC→TTA) | mhpA → | putative 3‑(3‑hydroxyphenyl)propanoate/3‑hydroxycinnamate hydroxylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 369,465 | 0 | C | A | 99.0% | 361.7 / ‑3.2 | 103 | F285L (TTC→TTA) | mhpA | putative 3‑(3‑hydroxyphenyl)propanoate/3‑hydroxycinnamate hydroxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base A (47/55); total (47/56) | |||||||||||
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Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GGGAGAAACCGAAGAGCAGCTGCGTGAGCCGCAAAATATGCGCAAGCTGTTAAGCAAAGTGCTGCCTAATCCGGACAATGTTGAATTGATTCGCCAGCGTGTCTACACCCACAACGCGCGACTGGCGCAACGTTTCCGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACATCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGCGTTGGTTATCCAGGGG > NC_000913/369330‑369594 | gggAGAAACCGAAGAGCAGCTGCGTGAGCCGCAAAATATGCGCAAGCTGTTAAGCAAAGTGCTGCCTAATCCGGACAATGTTGAATTGATTCGCCAGCGTGTCTACACCCACAACGCGCGACTGGCGCAACGTTTACGTa > 2:119813/1‑140 (MQ=255) ggAGAAACCGAAGAGCAGCTGCGTGAGCCGCAAAATATGCGCAAGCTGTTAAGCAAAGTGCTGCCTAATCCGGACAATGTTGAATTGATTCGCCAGCGTGTCTACACCCACAACGCGCGACTGGCGCAACGTTTACGTAt < 1:2110398/140‑1 (MQ=255) gaAACCGAAGAGCAGCTGCGTGAGCCGCAAAATATGCGCAAGCTGTTAAGCAAAGTGCTGCCTAATCCGGACAATGTTGAATTGATTCGCCAGCGTGTCTACACCCACAACGCGCGACTGGCGCAACGTTTACGTATTGa < 2:1159731/140‑1 (MQ=255) aaaCCGAAGAGCAGCTGCGTGAGCCGCAAAATATGCGCAAGCTGTTAAGCAAAGTGCTGCCTAATCCGGACAATGTTGAATTGATTCGCCAGCGTGTCTACACCCACAACGCGCGACTGGCGCAACGTTTACGTATTGAt < 1:1972788/140‑1 (MQ=255) 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1:1497566/1‑135 (MQ=255) cGTGTCTACACCCACAACGCGCGACTGGCGCAACGTTTACGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACATCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGCATGCGCGACGCCTTTAACCTCGc > 1:1006083/1‑140 (MQ=255) cacaACGCGCGACTGGCGCAACGTTTACGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACATCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGc < 2:2170268/140‑1 (MQ=255) cacaACGCGCGACTGGCGCAACGTTTACGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACATCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGc < 1:54435/140‑1 (MQ=255) cacaACGCGCGACTGGCGCAACGTTTACGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACACCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGc < 1:1597357/140‑1 (MQ=255) acaACGCGCGACTGGCGCAACGTTTACGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACATCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGCg > 1:1381611/1‑140 (MQ=255) acaACGCGCGACTGGCGCAACGTTTACGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACATCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGCg > 1:1612274/1‑140 (MQ=255) caACGCGCGACTGGCGCAACGTTTACGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACATCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGCGt > 1:2222297/1‑140 (MQ=255) caACGCGCGACTGGCGCAACGTTTACGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACATCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGCGt > 1:554518/1‑140 (MQ=255) caACGCGCGACTGGCGCAACGTTTACGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACATCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGCGt > 1:471486/1‑140 (MQ=255) caACGCGCGACTGGCGCAACGTTTACGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACATCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAAATGGCGt > 1:231500/1‑140 (MQ=255) aaCGCGCGACTGGCGCAACGTTTACGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACATCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGCGtt > 2:1644228/1‑140 (MQ=255) aaCGCGCGACTGGCGCAACGTTTACGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACATCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGCGtt > 1:900603/1‑140 (MQ=255) cgcgcgACTGGCGCAACGTTTACGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACATCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGCGTTgg < 2:2222297/140‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGCAACGTTTACGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACATCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGCGTTGGtt > 1:599860/1‑140 (MQ=255) cgcgACTGGCGCAACGTTTACGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACATCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCCATAACAGTGGGATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAAATTGCGTTgggt > 2:1348869/1‑138 (MQ=255) cgACTGGCGCAACGTTTACGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACATCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGCGTTGGTTAt > 1:1460709/1‑140 (MQ=255) cgACTGGCGCAACGTTTACGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACATCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGCGTTGGTTAt < 2:554518/140‑1 (MQ=255) tGGCGCAACGTTTACGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACATCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGCGTTGGTTATCCAg < 2:471486/140‑1 (MQ=255) cgcAACGTTTACGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACATCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGCGTTGGTTATCCAgggg > 2:517038/1‑140 (MQ=255) cgcAACGTTTACGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACATCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGCGTTGGTTATCCAgggg < 2:1789000/140‑1 (MQ=255) | GGGAGAAACCGAAGAGCAGCTGCGTGAGCCGCAAAATATGCGCAAGCTGTTAAGCAAAGTGCTGCCTAATCCGGACAATGTTGAATTGATTCGCCAGCGTGTCTACACCCACAACGCGCGACTGGCGCAACGTTTCCGTATTGATCGCGTACTGCTGGCGGGCGATGCCGCGCACATCATGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGCGTTGGTTATCCAGGGG > NC_000913/369330‑369594 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |