| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,412,516 | C→A | L44I (CTA→ATA) | yjfM → | DUF1190 domain‑containing protein YjfM |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,412,516 | 0 | C | A | 99.4% | 588.2 / ‑4.1 | 169 | L44I (CTA→ATA) | yjfM | DUF1190 domain‑containing protein YjfM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (80/88); total (81/88) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
GACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGCTAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATTGATGACGGTAATAATGCCGACATTTGCGCGC > NC_000913/4412380‑4412651 | tcctGGCCAGTAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGATCGATTAGTCGCATTGTTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGc > 2:2304269/4‑140 (MQ=255) tCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGc > 2:329684/1‑140 (MQ=255) tCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGc > 2:320097/1‑140 (MQ=255) tCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGc > 2:569549/1‑140 (MQ=255) 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1:393806/1‑137 (MQ=255) tACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATTGATGACgg > 2:853270/1‑140 (MQ=255) aCGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGa < 2:125905/124‑1 (MQ=255) cGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGTCGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATTGATGACGGta < 2:1127640/140‑1 (MQ=255) caAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATTGATGACGGtaataa > 1:1391005/1‑140 (MQ=255) cGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATTGATGACGGTAATAATGCCGACATTTgc > 1:242295/1‑140 (MQ=255) tGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATTGATGACGGTAATAATGCCGACATTTgcgcg > 1:911238/1‑140 (MQ=255) tGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATTGATGACGGTAATAATGCCGACATTTgcgcg < 2:1303425/140‑1 (MQ=255) ggCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATTGATGACGGTAATAATGCCGACATTTgcgcgc < 1:1562101/140‑1 (MQ=255) ggCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTCTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATTGATGACGGTAATAATGCCGACATTTgcgcgc < 2:71509/140‑1 (MQ=255) | GACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGCTAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATTGATGACGGTAATAATGCCGACATTTGCGCGC > NC_000913/4412380‑4412651 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |