| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 4,062,283 | IS5 (–) +4 bp | coding (37‑40/1266 nt) | yihN → | putative transporter YihN |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 105 (1.240) | 61/276 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4062283 = | 0 (0.000) | coding (37/1266 nt) | yihN | putative transporter YihN | |||||
| * | ? | NC_000913 | 3652036 = | NA (NA) | 107 (1.270) | 53/276 | 0.3 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4062286 | 0 (0.000) | coding (40/1266 nt) | yihN | putative transporter YihN | |||||
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
AAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGTTTTATATCCCGATGCAGGAATATTTCCATTTGACCAATGGTCAAATTGGTAATGCTATGTCGGTAAACTCATTTGTCACCACAGTGGGCTT > NC_000913/4062147‑4062425 | atctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTaa < 1:1045881‑M2/4‑1 (MQ=255) tctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAac > 1:383554‑M2/136‑140 (MQ=255) ttttAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAgga < 1:1143922‑M2/140‑4 (MQ=255) ttttAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAgga < 1:605449‑M2/140‑4 (MQ=255) tcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAacac < 2:1396021‑M2/7‑1 (MQ=255) cttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTaa < 2:149886‑M2/4‑1 (MQ=255) cttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTaa < 1:460511‑M2/4‑1 (MQ=255) cttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTaa > 1:149886‑M2/133‑136 (MQ=255) cttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTaa > 2:460511‑M2/133‑136 (MQ=255) ttAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaag < 1:854508‑M2/140‑6 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gcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAACACTGTGTGGCGGTACAAtt < 1:1161517‑M2/24‑1 (MQ=255) gcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAACACtgtg < 1:275071‑M2/11‑1 (MQ=255) aaCCATTCCATATGAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattc < 1:73371‑M2/140‑28 (MQ=255) cATTCCATATGAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttc < 2:1327733‑M2/140‑31 (MQ=255) ttCCATATGAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctc < 2:865358‑M2/140‑33 (MQ=255) gaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCg < 1:722159‑M2/36‑1 (MQ=255) tCCATATGAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcg < 1:1275290‑M2/140‑34 (MQ=255) attcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTc > 1:872537‑M2/103‑140 (MQ=255) tatGAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctg < 1:218474‑M2/140‑38 (MQ=255) atGAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctga > 1:141127‑M2/1‑102 (MQ=255) actgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTg > 2:1374323‑M2/99‑140 (MQ=255) gAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgact > 2:218474‑M2/1‑100 (MQ=255) aaTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactc > 2:726723‑M2/1‑99 (MQ=255) aTGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactca < 1:437238‑M2/140‑43 (MQ=255) ggTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagt > 2:1413144‑M2/1‑96 (MQ=255) gTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtc < 2:258942‑M2/140‑46 (MQ=255) gTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactc > 2:1013647‑M2/1‑95 (MQ=255) gTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactc > 2:762001‑M2/1‑95 (MQ=255) gTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactc < 1:762001‑M2/136‑42 (MQ=255) gTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcgg < 1:773081‑M2/129‑35 (MQ=255) gaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCg < 1:196078‑M2/51‑1 (MQ=255) gTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcattt < 2:734491‑M2/140‑50 (MQ=255) tATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttc < 1:16130‑M2/140‑51 (MQ=255) ggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGttt > 2:1418247‑M2/87‑140 (MQ=255) tCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcat > 2:910153‑M2/1‑88 (MQ=255) tgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGTTTTATATcc < 1:922326‑M2/61‑1 (MQ=255) tgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGTTTTATATCCCGa < 2:91872‑M2/64‑1 (MQ=255) ccTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcat < 2:771442‑M2/140‑61 (MQ=255) 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1:970841‑M2/1‑39 (MQ=255) tGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagc > 2:329705‑M2/1‑39 (MQ=255) gCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaa < 1:659367‑M2/124‑87 (MQ=255) gCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaa > 2:659367‑M2/1‑38 (MQ=255) cTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcct > 2:85307‑M2/1‑37 (MQ=255) gatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGTTTTATATCCCGATGCAGGAATATTTCCATTTGACCAATGGTCAAATTgg > 1:244016‑M2/33‑133 (MQ=255) atctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGTTTTATATCCCGATGCAGGAATATTTCCATTTGACCAATGGTCAAATTGGTAATGCTa < 2:472125‑M2/109‑1 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2:430675‑M2/25‑140 (MQ=255) cttgttcgcaccttccTTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGTTTTATATCCCGATGCAGGAATATTTCCATTTGACCAATGGTCAAATTGGTAATGCTATGTCGGTaaa > 2:235630‑M2/17‑135 (MQ=255) cgcaccttccTTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGTTTTATATCCCGATGCAGGAATATTTCCATTTGACCAATGGTCAAATTGGTAATGCTATGTCGGTAAACTCATTTGTca < 2:414746‑M2/130‑1 (MQ=255) ttAGTCTATTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccattta > 2:606601‑M2/1‑12 (MQ=255) ccttccTTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGTTTTATATCCCGATGCAGGAATATTTCCATTTGACCAATGGTCAAATTGGTAATGCTATGTCGGTAAACTCATTTGTcaccac < 2:592769‑M2/134‑1 (MQ=255) tccTTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGTTTTATATCCCGATGCAGGAATATTTCCATTTGACCAATGGTCAAATTGGTAATGCTATGTCGGTAAACTCATTTGTca > 1:1212215‑M2/4‑133 (MQ=255) tccTTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGTTTTATATCCCGATGCAGGAATATTTCCATTTGACCAATGGTCAAATTGGTAATGCTATGTCGGTAAACTCATTTGTCACCACAGt < 2:416259‑M2/137‑1 (MQ=255) tccTTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGTTTTATATCCCGATGCAGGAATATTTCCATTTGACCAATGGTCAAATTGGTAATGCTATGTCGGTAAACTCATTTGTCACCACAGt > 1:416259‑M2/4‑140 (MQ=255) aTTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgtt > 1:541398‑M2/1‑5 (MQ=255) aTTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgtt < 2:1122550‑M2/140‑136 (MQ=255) aTTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggc < 1:1381174‑M2/137‑133 (MQ=255) ttAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgtta < 2:789283‑M2/140‑137 (MQ=255) ttAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgattgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgtta < 2:192974‑M2/140‑137 (MQ=255) tAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGTTTTATATCCCGATGCAGGAATATTTCCATTTGACCAATGGTCAAATTGGTAATGCTATGTCGGTAAACTCATTTGTCACCACAGTGGGc > 2:482020/1‑140 (MQ=255) aaggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatc > 2:1074181‑M2/1‑2 (MQ=255) aggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatcc < 1:710408‑M2/140‑140 (MQ=255) aggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatcc > 2:1231905‑M2/1‑1 (MQ=255) | AAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGTTTTATATCCCGATGCAGGAATATTTCCATTTGACCAATGGTCAAATTGGTAATGCTATGTCGGTAAACTCATTTGTCACCACAGTGGGCTT > NC_000913/4062147‑4062425 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |