| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,353,097 | A→G | intergenic (‑72/+24) | arcB ← / ← yhcC | sensory histidine kinase ArcB/radical SAM family oxidoreductase YhcC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,353,097 | 0 | A | G | 98.7% | 565.1 / ‑2.9 | 149 | intergenic (‑72/+24) | arcB/yhcC | sensory histidine kinase ArcB/radical SAM family oxidoreductase YhcC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/2); new base G (81/66); total (81/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.07e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.39e-01 | |||||||||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
CGCACCAGACCTAACTTCATCATCAGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGAAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGATTTTCGCACCACAGCG > NC_000913/3352961‑3353233 | cgcACCAGACCTAACTTCATCATCAGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAAt > 1:1892797/1‑140 (MQ=255) gcACCAGACCTAACTTCATCATCAGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATg > 1:1216946/1‑140 (MQ=255) aGACCTAACTTCATCATCAGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAGATTGTGTGAGGAATGCGGaa < 1:1396387/140‑1 (MQ=255) ttCATCATCAGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCa > 1:771431/1‑140 (MQ=255) ttCATCATCAGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCa < 2:527000/140‑1 (MQ=255) ttCATCATCAGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCC‑ATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCaa < 1:206474/140‑1 (MQ=255) tcatcatcaGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCaa < 2:2144064/140‑1 (MQ=255) catcatcaGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAAc > 1:271905/1‑140 (MQ=255) catcatcaGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAAc > 2:1198566/1‑140 (MQ=255) tcatcaGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGa > 2:2191547/1‑140 (MQ=255) caGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTa < 2:271905/140‑1 (MQ=255) ggTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACt < 2:1631715/140‑1 (MQ=255) ggTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACt > 2:1018286/1‑140 (MQ=255) gTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTc > 2:1761693/1‑140 (MQ=255) tCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTcc > 2:678288/1‑140 (MQ=255) tCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTcc > 1:1548507/1‑140 (MQ=255) cAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCg < 2:1298255/140‑1 (MQ=255) aaCATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGt < 1:487745/140‑1 (MQ=255) aataCTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAg < 1:678288/140‑1 (MQ=255) taCTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGt > 2:1227669/1‑140 (MQ=255) taCTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGt > 2:478145/1‑140 (MQ=255) tGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAg > 2:672619/1‑135 (MQ=255) tGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAg < 1:672619/135‑1 (MQ=255) tGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGAAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGc < 1:1603289/140‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAg > 2:1892671/1‑134 (MQ=255) gcgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAg < 1:1892671/134‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGcc < 1:913694/140‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGcc < 2:376339/140‑1 (MQ=255) cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACt > 1:1102934/1‑124 (MQ=255) cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACt < 2:1102934/124‑1 (MQ=255) cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 2:1202579/1‑140 (MQ=255) cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 2:2211637/1‑140 (MQ=255) cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 2:1755175/1‑140 (MQ=255) cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 2:1986089/1‑140 (MQ=255) cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 2:93321/1‑140 (MQ=255) cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 1:2024642/1‑140 (MQ=255) cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 1:2097698/1‑140 (MQ=255) cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 2:752631/1‑140 (MQ=255) cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 1:420698/1‑140 (MQ=255) cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 2:843541/1‑140 (MQ=255) cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 1:2343630/1‑140 (MQ=255) gcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAg < 1:343100/132‑1 (MQ=255) agcagACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGa < 1:752631/140‑1 (MQ=255) agcagACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGa < 1:471072/140‑1 (MQ=255) gcagACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGa < 2:625420/139‑1 (MQ=255) gcagACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGa > 1:625420/1‑139 (MQ=255) cagACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACg > 2:1306260/1‑140 (MQ=255) gACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAg > 1:960116/1‑125 (MQ=255) aCGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTcc < 1:981425/140‑1 (MQ=255) aCGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTcc < 1:554308/140‑1 (MQ=255) ttGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAgcgc < 1:327173/140‑1 (MQ=255) cTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGa > 2:1440249/1‑140 (MQ=255) ttCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGcc < 1:921634/137‑1 (MQ=255) ttCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGcc > 2:921634/1‑137 (MQ=255) ttCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGAt < 2:1468120/140‑1 (MQ=255) ttCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGAt < 1:2278620/140‑1 (MQ=255) ttCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGAt < 2:420698/140‑1 (MQ=255) ttCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGAt < 2:339350/140‑1 (MQ=255) ttAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCt > 2:2306082/1‑140 (MQ=255) tAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTg > 1:1767815/1‑140 (MQ=255) ggAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTAc > 2:1277305/1‑140 (MQ=255) gAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACg < 2:326895/140‑1 (MQ=255) aaTTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGc < 1:1986089/140‑1 (MQ=255) aaTTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGc < 2:1892797/140‑1 (MQ=255) aaTTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGc < 1:1306260/140‑1 (MQ=255) aTTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGcc < 1:886272/140‑1 (MQ=255) tCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGAt < 1:2149576/127‑1 (MQ=255) cTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATg < 1:1060922/139‑1 (MQ=255) cTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATg > 2:1060922/1‑139 (MQ=255) cTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGt > 1:1733401/1‑140 (MQ=255) cTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGt > 1:254730/1‑140 (MQ=255) aCGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGttcat < 2:254730/140‑1 (MQ=255) aCAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGttcattca < 1:1045451/140‑1 (MQ=255) aCAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGttcattca < 1:1761693/140‑1 (MQ=255) cAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAg > 2:1060659/1‑140 (MQ=255) aaCCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGa > 2:710823/1‑140 (MQ=255) ataataCCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATa > 2:832459/1‑131 (MQ=255) ataataCCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAg > 2:809723/1‑140 (MQ=255) taataCCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGc < 1:1071448/140‑1 (MQ=255) aCCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGa > 1:442890/1‑140 (MQ=255) aCCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGa > 1:394419/1‑140 (MQ=255) cccAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGAc < 1:1198566/140‑1 (MQ=255) cccAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGAc > 1:2146209/1‑140 (MQ=255) aaTTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATc > 2:648602/1‑128 (MQ=255) aaTTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCAt > 2:895773/1‑140 (MQ=255) ttCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTc > 1:1673218/1‑140 (MQ=255) ttCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTc > 2:378206/1‑140 (MQ=255) ttCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTc > 1:850274/1‑140 (MQ=255) gTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCAt > 1:589202/1‑140 (MQ=255) gTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCAt > 1:801971/1‑140 (MQ=255) cGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGAt < 1:2306082/140‑1 (MQ=255) cGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGAt < 2:801971/140‑1 (MQ=255) taAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGATTTTCg > 1:1333864/1‑140 (MQ=255) taAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGATTTTCg < 1:809723/140‑1 (MQ=255) aaaTTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGATTTTCGc > 1:1466454/1‑140 (MQ=255) aTTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGATTTTCGcac < 2:394419/140‑1 (MQ=255) ttGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGATTTTCGcacc < 2:963169/140‑1 (MQ=255) tgtgAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGATTTTCGCACcaca < 2:850274/140‑1 (MQ=255) tgtgAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGATTTTCGCACcaca > 2:1111826/1‑140 (MQ=255) tgAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGATTTTCGCACCACAGc > 2:1740104/1‑140 (MQ=255) | CGCACCAGACCTAACTTCATCATCAGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGAAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGATTTTCGCACCACAGCG > NC_000913/3352961‑3353233 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |