Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 753,026 | T→C | intergenic (‑231/+159) | ybgD ← / ← gltA | putative fimbrial protein YbgD/citrate synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 753,026 | 0 | T | C | 100.0% | 46.1 / NA | 14 | intergenic (‑231/+159) | ybgD/gltA | putative fimbrial protein YbgD/citrate synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (9/5); total (9/5) |
TTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAAT > NC_000913/752890‑753161 | atAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGAATAATGAATTTGTTGTATGATGAGTAAACTATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGCAtt > 2:153559/2‑140 (MQ=255) gTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGCATTggg > 1:270636/1‑140 (MQ=255) tGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGCATTGGGTTGCTGATAAt > 1:263409/1‑140 (MQ=255) tGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGCATTGGGTTGCTGATAAt > 2:243996/1‑140 (MQ=255) aaCTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGCATTGGGTTGCTGATAATTTGAg < 1:243996/140‑1 (MQ=255) aaCTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGCATTGGGTTGCTGATAATTTGAg < 1:296193/140‑1 (MQ=255) aaCTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGCATTGGGTTGCTGATAATTTGAg < 2:313831/140‑1 (MQ=255) ttGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGCATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTAtt < 1:96268/140‑1 (MQ=255) aTGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGCATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTaa > 1:177509/1‑140 (MQ=255) tgtATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGCATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCtatat > 1:32835/1‑140 (MQ=255) tATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGCATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAg < 2:267507/140‑1 (MQ=255) aCGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGCATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAAtttttt > 1:16582/1‑140 (MQ=255) cATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGCATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTgtgt > 2:103035/1‑140 (MQ=255) gCGACTACCATAAATTTTTTAATTAAAAGCTTTGGGTTGCTGATAATTTGAGTTTTTTTTTTTTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACATTTTTTTGTTTTTAGGAATAAAAAAATCAccc < 2:165804/140‑1 (MQ=255) tGAAGTTTTTAATTGAAAGCATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGa > 1:204661/1‑140 (MQ=255) aaaGCATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTATATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTTAAat > 2:234616/1‑140 (MQ=255) | TTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAAT > NC_000913/752890‑753161 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |