Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,926,366 | 0 | A | C | 21.3% | 145.7 / 13.3 | 61 | G30G (GGT→GGG) | mioC | flavoprotein MioC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/12); new base C (0/13); total (36/25) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.92e-07 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
CTGTTCCTGCAATGCTTCATAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACGCTGTGAACGCGTTG > NC_000913/3926228‑3926505 | cTGTTCCTGCAATGCTTCATAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAAc > 1:665536/1‑140 (MQ=255) ccTGCAATGCTTCATATAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGcc > 1:761521/1‑140 (MQ=255) ccTGCAATGCTTCATAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGcc < 1:835626/140‑1 (MQ=255) cTGCAATGCTTCATAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCct > 2:134512/1‑140 (MQ=255) gCTTCATAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAg > 1:72719/1‑140 (MQ=255) gCTTCATAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAg > 2:385580/1‑140 (MQ=255) gCTTCATAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCCTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAg > 2:149432/1‑140 (MQ=255) cATAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCttt > 2:89669/1‑140 (MQ=255) aTAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGGGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCGGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCTTTTCGGTGGAAAAACCCGCCTCTTCCAGCtttt < 2:911224/140‑1 (MQ=255) ggagaaaggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGCCCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAg < 2:494017/140‑1 (MQ=255) ggagaaaggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAg > 1:1155010/1‑140 (MQ=255) gagaaaggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAgg > 2:1098377/1‑140 (MQ=255) aaaaggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGgtg < 2:1084391/139‑1 (MQ=255) aaaggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGgtgt > 1:1016226/1‑140 (MQ=255) aatgTTGTCCGGAATATCTCCGGCCCCGTGGGTGGAGCTGATACCCAGCCAGACCCGTGAGCCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCTTTTGGGGGGTAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGtt < 2:1155010/137‑1 (MQ=255) aaggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATACCCAGCCAGACCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGtt < 2:352519/140‑1 (MQ=255) aaggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGtt < 1:134512/140‑1 (MQ=255) aaggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGtt < 1:677222/140‑1 (MQ=255) gTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTa > 2:652328/1‑140 (MQ=255) gTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTa > 2:766393/1‑140 (MQ=255) gTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTa > 2:788680/1‑140 (MQ=255) gTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTa > 2:798188/1‑140 (MQ=255) gTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGAGTTCTGCTa > 1:439090/1‑140 (MQ=255) tCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGACCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGCCCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTAc < 2:205292/140‑1 (MQ=255) tctcGGGCACGGGGGGTGGAGCTGAAACCCAGCCAGATCCCGGAGGCAGGTAAATCTTCAAACAGC‑GGCCCGTGCAGCTTTCGGGTGGAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGc < 2:133132/140‑1 (MQ=255) ctcCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCa > 1:674999/1‑140 (MQ=255) ctcCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCa > 2:536586/1‑140 (MQ=255) aCCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGa > 2:353003/1‑140 (MQ=255) gggAGCTGAAACCCAGCCACACCCTGGAGGAAGTTAAATCTTTAAACAGC‑GGCCGGTGGGGTTTTGGGGAGATAAATCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTCCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGtgctg < 2:630497/139‑1 (MQ=255) gagcgaaTACCCACCCAGTTCCGTGAGGCAGTTAAATCTTCAACCGGC‑GCCCGGTGCGGCTTTTGGGGGTTAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCCCCGCCGAGGGTGCTGcc < 2:439090/134‑1 (MQ=255) gAGCTAAAACCCAGCCAGATCCTGGAGGAAGGTAATTCTTCT‑ACAGCGGGCCCGGGCGGGGTTTGGGTGGAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGcc < 2:656282/140‑1 (MQ=255) gCTGAAACCCACCCAGACCCTTGAGGCAGGAAAATTTTCAAACGGC‑GGACCGTGCGGCGTTTGGGTGGAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGc < 2:260227/140‑1 (MQ=255) aaaaCCAGCCAGATCCCGGAGGAAGTTAAATCTTCTAACAGC‑GGCCCGTGCGGGTTTTGGGGGGTAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTTGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGAt < 2:127580/138‑1 (MQ=255) aTACCCAGCCAGACCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCAAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGAAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGAt < 2:1088365/140‑1 (MQ=255) aTAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGAt > 2:50465/1‑140 (MQ=255) aaaCCAGCCAGCCCCCGGAGGCAGTAAAATTTTCAAACAGC‑GGCCGGTGCGGCTTTTGGGGGGAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATa < 2:761521/139‑1 (MQ=255) aCCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAag < 1:353003/140‑1 (MQ=255) cagccagcTCCCGGAGGCAGGAAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTGGGTGGAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAagag < 2:225412/140‑1 (MQ=255) cagccagATTCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAagag > 1:965051/1‑140 (MQ=255) agccagATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGt > 1:420913/1‑140 (MQ=255) gccagATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTg > 1:225412/1‑140 (MQ=255) ctCCCGGAGGCAGGAAATTCTTCAAACGGC‑GGACGGTGCAGTGTTTGGGTGTAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATc < 2:674999/139‑1 (MQ=255) aTCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATc > 2:387520/1‑140 (MQ=255) aGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAAcc > 2:918292/1‑140 (MQ=255) ggTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCg > 1:117277/1‑140 (MQ=255) ggTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCg > 1:238455/1‑140 (MQ=255) gTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGc > 1:273977/1‑140 (MQ=255) aaaattcttcaAACAGC‑GGCCCGTGCGGCTTTTCGGTGGAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGc < 2:420913/135‑1 (MQ=255) aattcttcaAACGGG‑GGCCGGTGCGGCTTTTGGGTGAAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCa < 2:665536/137‑1 (MQ=255) aaaTCTTCTAACAGG‑GGCCCGGGCAGCGTTTGGGTGGTAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCa < 1:513775/140‑1 (MQ=255) aaaTCTTCAAACGGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCa < 1:865272/140‑1 (MQ=255) atttttctAACCGC‑GGCCCGGGGAGCTTTTGGGTGTAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCAc < 2:411089/136‑1 (MQ=255) aTCTCCAAACAGG‑GGACCGGGCAGCGTTGCGGGGGTAAAGCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGAAAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCAcc < 1:62271/140‑1 (MQ=255) aaCAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCAGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTttatta > 2:58467/1‑140 (MQ=255) acgggggACGGTGCGGCTTTTGGGTGGAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTCCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTaa < 2:72719/135‑1 (MQ=255) ggC‑GGACCGTGCGGCGTTTCGGTGGTAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAaga < 1:975647/139‑1 (MQ=255) gC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAagag > 2:151566/1‑140 (MQ=255) gC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAagag > 1:211035/1‑140 (MQ=255) aggggcccGTGCGGTTTTTGGGTGGAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAaga < 2:496660/134‑1 (MQ=255) c‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGt > 2:879988/1‑140 (MQ=255) c‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGt > 2:432820/1‑140 (MQ=255) ggACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTg > 1:451849/1‑140 (MQ=255) gACGGTGCGGCTTTTCGGTGGTAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTgg < 1:149432/140‑1 (MQ=255) gACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTgg > 1:276437/1‑140 (MQ=255) gCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTAtt > 1:698048/1‑140 (MQ=255) aGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGt < 1:918292/140‑1 (MQ=255) gCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTa < 1:536586/140‑1 (MQ=255) gTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACg > 1:351038/1‑140 (MQ=255) gggtgtaaaacCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACGCtgt < 2:1016226/133‑1 (MQ=255) ggtAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACGCTGTGAAc < 1:50465/140‑1 (MQ=255) gtAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACGCTGTGAAcg > 2:635038/1‑140 (MQ=255) aaaaCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACGCTGTGAAcgcg > 1:30748/1‑140 (MQ=255) aaaaCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACGCTGTGAAcgcg < 1:1098377/140‑1 (MQ=255) aaaCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACGCTGTGAATGCGt < 1:766393/140‑1 (MQ=255) aCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACGCTGTGAACGCGTTg < 1:798188/140‑1 (MQ=255) | CTGTTCCTGCAATGCTTCATAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGC‑GGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACGCTGTGAACGCGTTG > NC_000913/3926228‑3926505 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |