| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 442,961 | G→A | E471E (GAG→GAA) | thiI → | tRNA uridine 4‑sulfurtransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 442,961 | 0 | G | A | 97.7% | 295.9 / ‑2.1 | 88 | E471E (GAG→GAA) | thiI | tRNA uridine 4‑sulfurtransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base A (46/40); total (47/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 | |||||||||||
TCGAAGGGATTGATGTGGTTTCTCTGCCGTTCTATAAACTGAGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGAT > NC_000913/442825‑443096 | tCGAAGGGATTGATGTGGTTTCTCTGCCGTTCTATAAACTGAGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAg < 2:850313/140‑1 (MQ=255) gAAGGGATTGATGTGGTTTCTCTGCCGTTCTATAAACTGAGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAggg < 2:1370420/140‑1 (MQ=255) gAAGGGATTGATGTGGTTTCTCTGCCGTTCTATAAACTGAGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAggg < 1:1272134/140‑1 (MQ=255) aaGGGATTGATGTGGTTTCTCTGCCGTTCTATAAACTGAGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGc > 2:1141909/1‑140 (MQ=255) aGGGATTGATGTGGTTTCTCTGCCGTTCTATAAACTGAGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCt > 1:621871/1‑140 (MQ=255) aTTGATGTGGTTTCTCTGCCGTTCTATAAACTGAGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTaa > 2:761879/1‑140 (MQ=255) aTTGATGTGGTTTCTCTGCCGTTCTATAAACTGAGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTaa < 1:973236/140‑1 (MQ=255) tgtgGTTTCTCTGCCGTTCTATAAACTGAGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAAtg < 1:200316/140‑1 (MQ=255) tgtgGTTTCTCTGCCGTTCTATAAACTGAGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAAtg < 1:830084/140‑1 (MQ=255) gTTTCTCTGCCGTTCTATAAACTGAGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAggg < 1:27663/125‑1 (MQ=255) gTTTCTCTGCCGTTCTATAAACTGAGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAggg > 2:27663/1‑125 (MQ=255) gTTTCTCTGCCGTTCTATAAACTGAGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACa > 1:602081/1‑133 (MQ=255) gTTTCTCTGCCGTTCTATAAACTGAGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACa < 2:602081/133‑1 (MQ=255) gTTTCTCTGCCGTTCTATAAACTGAGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGaa > 2:1007347/1‑140 (MQ=255) gTTTCTCTGCCGTTCTATAAACTGAGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGaa > 1:237328/1‑140 (MQ=255) tttCTCTGCCGTTCTATAAACTGAGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAg > 1:658104/1‑140 (MQ=255) ctGCCGTTCTATAAACTGAGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGtata > 2:273620/1‑140 (MQ=255) gCCGTTCTATAAACTGAGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATc > 1:747917/1‑140 (MQ=255) tGAGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTtgtg > 1:720298/1‑140 (MQ=255) aGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGt > 2:173943/1‑140 (MQ=255) aGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGt > 1:842448/1‑140 (MQ=255) aGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGt > 2:557481/1‑140 (MQ=255) aGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGt > 1:734285/1‑140 (MQ=255) aGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGt > 2:793508/1‑140 (MQ=255) aGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGt > 1:1065659/1‑140 (MQ=255) aGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGt > 1:1256928/1‑140 (MQ=255) aGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGt > 1:36520/1‑140 (MQ=255) gCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGtt > 1:963717/1‑140 (MQ=255) gCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGtt > 1:890124/1‑140 (MQ=255) gCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGtt > 1:723794/1‑140 (MQ=255) cACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGttt > 2:1361696/1‑140 (MQ=255) aCCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGtttt > 2:998345/1‑140 (MQ=255) aaaTTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTAc > 2:523906/1‑140 (MQ=255) tGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGc < 2:851092/140‑1 (MQ=255) tGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGc < 2:1065659/140‑1 (MQ=255) tGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGc < 1:523906/140‑1 (MQ=255) gCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCAt < 2:747917/140‑1 (MQ=255) cGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATc < 2:963717/140‑1 (MQ=255) tctcGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTgg > 2:538005/1‑140 (MQ=255) ccAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCGTCTGGTCAGAt < 1:1135311/140‑1 (MQ=255) aGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGc < 2:860347/140‑1 (MQ=255) aaaaCCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGt < 1:793508/140‑1 (MQ=255) cTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGcc < 2:621871/140‑1 (MQ=255) tGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCg < 2:720298/140‑1 (MQ=255) ggCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGc > 2:928822/1‑140 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2:237328/140‑1 (MQ=255) tgctgTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATc < 2:85361/140‑1 (MQ=255) tgctgTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATc < 2:658104/140‑1 (MQ=255) ctgTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCg > 2:407118/1‑140 (MQ=255) tgtgGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGa < 1:928822/140‑1 (MQ=255) tgtgGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGa < 1:1106056/140‑1 (MQ=255) tggtgTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGaca < 1:1108850/140‑1 (MQ=255) tggtgTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGaca < 1:1361696/140‑1 (MQ=255) tgAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACactact < 2:779684/140‑1 (MQ=255) tgAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGAGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACactact > 2:952738/1‑140 (MQ=255) aGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGcc > 2:162211/1‑123 (MQ=255) aGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGcc < 1:162211/123‑1 (MQ=255) aGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCg > 2:530682/1‑140 (MQ=255) aGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCg > 1:1228193/1‑140 (MQ=255) aGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCg > 1:375055/1‑140 (MQ=255) aGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCg > 1:1265410/1‑140 (MQ=255) gcgcGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGt < 2:36520/140‑1 (MQ=255) cgcgGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGta < 1:1356192/140‑1 (MQ=255) gcgGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGaca > 1:828500/1‑130 (MQ=255) gcgGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGaca < 2:828500/130‑1 (MQ=255) cgGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGtaat < 1:538095/140‑1 (MQ=255) cgGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGtaat < 1:1141909/140‑1 (MQ=255) cgGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGtaat < 2:890124/140‑1 (MQ=255) cgGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGtaat < 1:1007347/140‑1 (MQ=255) ggggTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGtaata > 2:94509/1‑140 (MQ=255) ggggTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGtaata > 1:1360744/1‑140 (MQ=255) cGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATccc > 1:86975/1‑140 (MQ=255) cGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATccc > 1:424742/1‑140 (MQ=255) gTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCt < 2:11748/140‑1 (MQ=255) cTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTgc < 1:530682/140‑1 (MQ=255) tGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTgcc < 2:424742/140‑1 (MQ=255) tGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTgcc > 1:320076/1‑140 (MQ=255) aGGCGCTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTgccgcc < 1:998345/140‑1 (MQ=255) gcgcTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCAt > 1:559372/1‑140 (MQ=255) cgcTCTATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATc < 2:1256928/140‑1 (MQ=255) tctATCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCAcc < 2:386137/140‑1 (MQ=255) aTCTGCGCGAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGt > 1:362657/1‑140 (MQ=255) gcgAACAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGAt < 1:1188482/140‑1 (MQ=255) | TCGAAGGGATTGATGTGGTTTCTCTGCCGTTCTATAAACTGAGCACCAAATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGAT > NC_000913/442825‑443096 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |