New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1619328 = | 68 (0.980) | 46 (0.670) | 32/272 | 1.0 | 42.2% | coding (209/435 nt) | marR | DNA‑binding transcriptional repressor MarR |
? | NC_000913 | = 1619446 | 59 (0.860) | coding (327/435 nt) | marR | DNA‑binding transcriptional repressor MarR |
GGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1619468‑1619328 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGCTCCCAGGTCGACCGACAA < NC_000913/1619446‑1619309 GGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGT > 2:942818/1‑140 CCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGT < 1:942818/140‑1 CATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCG < 1:490938/140‑1 ATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTACACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGC > 2:25058/1‑140 TTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGC < 1:746803/137‑1 TTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGC > 2:746803/1‑137 TTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCCGGTTCGGCAAACTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCC > 2:214257/1‑140 ATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGG < 1:214257/140‑1 ATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGG > 1:754077/1‑138 ATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGG < 2:754077/138‑1 TGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGCCCCGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAG > 2:150070/1‑140 GCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGT < 1:1141422/140‑1 GCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGT < 1:25058/140‑1 TTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGT < 1:150070/140‑1 CGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCG > 1:852838/1‑140 GTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGCTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCT > 1:449124/1‑140 TCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTT < 2:852838/140‑1 GGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTTCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCC > 2:743029/1‑140 gTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAG < 1:772332/139‑1 TCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACC > 2:772332/1‑140 ttaCAGCCTTTACAGGCCAGGGGATCCAGCATTCGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGG < 1:1108018/137‑1 CAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGA < 1:743029/140‑1 AGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGG > 1:415819/1‑136 AGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTGCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGG < 2:415819/136‑1 ACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCAT > 2:190145/1‑140 CAGGCCAGGCGATCCAGCATTCGGGGCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATA < 2:591519/140‑1 ACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGG > 2:641481/1‑140 CCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGG > 1:630997/1‑140 CCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGG > 1:488130/1‑140 CCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCAT < 1:142852/135‑1 CCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCAT > 2:142852/1‑135 CCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGGTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCACACGGG > 1:988211/1‑140 CCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCCGTGGTAAGTTTTACCAGGAGGCCGCGCTTGTCATACGGGCTCGGCAACCTTTCCACCAAGACTTTAGAGACCAGGCGATCCAGCATACGGG > 2:29966/1‑140 GCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGTTTGTCATTCGGGTACGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAG < 2:488130/140‑1 GCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAG > 1:803497/1‑140 GCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAG > 2:1142440/1‑140 GCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAG > 2:757582/1‑140 GCGATCCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAG > 1:175227/1‑140 CCAGCATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGCTC > 1:353833/1‑140 CATACGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGCTCCCAG > 2:598986/1‑140 CGGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGCTCCCAGGTCG < 1:190145/140‑1 GGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGCTCCCAGGTCGA > 2:728216/1‑140 GGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGCTCCCAGGTCGA > 2:1035079/1‑140 GGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAG < 2:606164/126‑1 GGGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAG > 1:606164/1‑126 GGTCAGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGCTCCCAGGTCGAC > 1:105846/1‑140 AGTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGCTCCCAGGTCGACCGAC > 2:749036/1‑140 TGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGCTCCCAGGTCGACCGACAA > 2:474487/1‑140 GGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1619468‑1619328 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGCTCCCAGGTCGACCGACAA < NC_000913/1619446‑1619309 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |