Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,926,366 | 0 | A | C | 23.3% | 169.6 / 10.1 | 73 | G30G (GGT→GGG) | mioC | flavoprotein MioC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (42/14); new base C (0/17); total (42/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.50e-08 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
TCTGTTCCTGCAATGCTTCATAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACGCTGTGAA > NC_000913/3926227‑3926498 | tCTGTTCCTGCAATGCTTCATAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTaaaa > 2:380249/1‑140 (MQ=255) ttCCTGCAATGCTTCATAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCg < 1:1092046/140‑1 (MQ=255) ccTGCAATGCTTCATAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAC‑CCCGcc < 2:433037/140‑1 (MQ=255) aTGCTTCATAGAAAGGAGAAAGGTTGCCCGAAATATCTCCGGCACCGGGGGTGGGGCTGATAACCAGCCAGACCCCTGAGGCAGGAAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGGGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTcc < 2:885278/140‑1 (MQ=255) tGCTTCATAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCa < 2:564256/140‑1 (MQ=255) cTTCATAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGc > 1:409809/1‑140 (MQ=255) aTAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAC‑CCCGCCTCTTCCAGCtttt < 2:557110/140‑1 (MQ=255) agaaaggagaaagtTTTCCCGGATTACCCCGGGCGGGGTGGGTGGAGCGGTAAACCAGCGAGATCCCGGAGGCAGTTAAATCTT‑TAAAAGGGGCACGGGGACGCTTTTCGGTGTAAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCa < 2:486494/140‑1 (MQ=255) aaggagaaaggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAAAAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGcc < 1:819493/140‑1 (MQ=255) aggagaaaggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCa > 2:81558/1‑140 (MQ=255) aaaggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGgtgt > 1:1057098/1‑140 (MQ=255) aaggTTGCCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGtt < 2:75524/140‑1 (MQ=255) aggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAC‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTc < 2:994959/140‑1 (MQ=255) ggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCt < 2:1057098/140‑1 (MQ=255) gTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTa > 2:602842/1‑140 (MQ=255) gTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTa > 2:1182655/1‑140 (MQ=255) tCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTAc > 2:728289/1‑140 (MQ=255) cccGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATACCCAGCAAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑CCCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTAc < 1:1040161/139‑1 (MQ=255) aaTATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATAtt > 1:593315/1‑140 (MQ=255) atatCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAg > 1:668853/1‑122 (MQ=255) atatCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAg < 2:668853/122‑1 (MQ=255) tatCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCg > 2:767771/1‑140 (MQ=255) tatCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCg > 2:767010/1‑140 (MQ=255) ctcCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCa > 1:225422/1‑140 (MQ=255) cccGGCCCGGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑CCCGGGCGGCGTTTCGGTGGAAAAC‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCAc < 2:409809/139‑1 (MQ=255) ccGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCAcc > 2:831216/1‑140 (MQ=255) cGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCAccg > 1:676342/1‑140 (MQ=255) gCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCAccgcc > 1:419927/1‑140 (MQ=255) aCCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAC‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGa < 1:130592/140‑1 (MQ=255) tgggtggAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAgggg > 2:329097/1‑139 (MQ=255) tgggtggAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAgggg > 1:1214448/1‑139 (MQ=255) tgggtggAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGt > 1:979545/1‑140 (MQ=255) tgggtggAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGt > 2:701366/1‑140 (MQ=255) ggtggAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGtgc > 1:872272/1‑140 (MQ=255) ggtggAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGtgc > 1:393457/1‑140 (MQ=255) gAGCTGAAAACCAGCCAGACCCCTGGGGCAGGTAAATCTTCAAACAGCGG‑CCGGGGCAGCTTTTGGGTGGAAAAC‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGcc < 2:88067/140‑1 (MQ=255) ggCTGATACCCAGCCAGACCCCTGGGGAGGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑CCGGTGCGGCGTTTCGGTGGAAAAC‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCg < 2:177327/139‑1 (MQ=255) gCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGc > 1:26152/1‑140 (MQ=255) aTACCCAGCCAGACCCCTGAGGCAGGAAAATCTTCTAACAGCGG‑CCGGGGCAGCTTTTCGGTGGAAAAC‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGAt < 2:953817/140‑1 (MQ=255) aTAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGAt > 1:771793/1‑140 (MQ=255) aTAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGAAAATCTTCAAACAGCGG‑CCCGTGAAGGTTTTCGGGGGAAAAC‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGAt < 2:706605/140‑1 (MQ=255) aacccagccagACCCTTGAGGCAGGAAAATTTTCTACCAGCGG‑CCGGTGCGGCTTTTGGGTGGAAAAC‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATa < 2:225422/137‑1 (MQ=255) aacccagccaaATCCCGGGGGCAGTTAATTTTTCTAACGGCGG‑CCCGTGAAGCTTTCCGGGGGAAAAC‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATa < 2:979545/137‑1 (MQ=255) acccacccagTCCCGTGAGGCAGTAAATTTTTAAAACAGCGG‑ACGGTGCGGCGTTTGGGTGAAAAAC‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATaa < 2:419927/138‑1 (MQ=255) gccagATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTg > 1:953817/1‑140 (MQ=255) gaccccGGAGGCGGGTAAATTTTCTAACAGGGG‑CCGGGGCGGCTTTTGGGTGGAAAAC‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGatat < 2:872272/137‑1 (MQ=255) aTCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATc > 2:479212/1‑140 (MQ=255) aTCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATc > 1:377304/1‑140 (MQ=255) cAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAAc > 1:1188856/1‑140 (MQ=255) cAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAAc > 1:316252/1‑140 (MQ=255) ggTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCg > 2:314425/1‑140 (MQ=255) ggTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCg > 1:125630/1‑140 (MQ=255) gaaattcttcaACCAGCGG‑CCGGTGAAGGTTTTCGGTGATAAAG‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTTTTCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGc < 2:875873/135‑1 (MQ=255) gTAAATCTTCTAACAGCGG‑CCCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAC‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGc < 1:730269/140‑1 (MQ=255) gTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGc > 1:353152/1‑140 (MQ=255) gTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGc > 1:360697/1‑140 (MQ=255) gTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGc > 2:724721/1‑140 (MQ=255) attctcttAACGGCGA‑CCCGTGCGGC‑TTTCGGGTGTAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCACCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCAc < 2:417153/133‑1 (MQ=255) tctAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGCGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTtta > 1:875873/1‑140 (MQ=255) tAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGc > 2:1175285/1‑130 (MQ=255) tAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGc < 1:1175285/130‑1 (MQ=255) tAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTttatt > 2:1179317/1‑140 (MQ=255) aGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAaga > 2:509371/1‑140 (MQ=255) gg‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTg > 2:719064/1‑140 (MQ=255) gg‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTg > 1:520725/1‑140 (MQ=255) gg‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGAAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTg < 1:831216/140‑1 (MQ=255) ccggTGCAGCTTTTCGGTGGTAAAC‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGGGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGc < 1:565180/137‑1 (MQ=255) cccGTGCAGCTTTTGGGTGTTAAAC‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGc < 1:440329/139‑1 (MQ=255) gTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTa > 1:16895/1‑140 (MQ=255) gCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTa < 1:701366/140‑1 (MQ=255) gCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTa > 1:1128899/1‑140 (MQ=255) tttttGGGTGTAAAAC‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTAc < 2:771793/138‑1 (MQ=255) cGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTAc > 1:210992/1‑140 (MQ=255) cGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACGCtgt > 2:473803/1‑140 (MQ=255) gtggtAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACGCTGTGa < 1:1179317/140‑1 (MQ=255) gtggtAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACGCTGTGa < 1:509371/140‑1 (MQ=255) gtggaAAAC‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACGCTGTGa < 2:26152/140‑1 (MQ=255) tggtAAAC‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACGCTGTGaa < 1:767010/140‑1 (MQ=255) | TCTGTTCCTGCAATGCTTCATAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCTGATAACCAGCCAGATCCCTGAGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGG‑ACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAA‑CCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACGCTGTGAA > NC_000913/3926227‑3926498 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |