| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,111,747 | 0 | G | T | 22.2% | 186.4 / 22.7 | 63 | N156K (AAC→AAA) | yiiQ | DUF1454 domain‑containing protein YiiQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (45/4); new base T (0/14); total (45/18) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.18e-11 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGA > NC_000913/4111618‑4111883 | tttATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCccg > 1:1980700/1‑140 (MQ=255)tttATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCccg > 1:1396149/1‑140 (MQ=255) aCCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTtagta > 1:945701/1‑140 (MQ=255) aCCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTtagta > 2:2080917/1‑140 (MQ=255) cAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGAc > 1:1208471/1‑140 (MQ=255) aaGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACt > 2:627147/1‑140 (MQ=255) aaTTCAGATACCCCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCACCCCTTTTTCGCC‑GTTGCCCGCAACAAAATAACGCAGTGCCCCTTCTGTCTGGGTGT‑AATACCTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAg < 2:1828629/139‑1 (MQ=255) ttCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGtt > 1:1859463/1‑140 (MQ=255) cgcCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGc > 1:135454/1‑140 (MQ=255) cgcCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGc > 1:1638040/1‑140 (MQ=255) cgcCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCATTAGTAGCGACCGCAGTTTTTTCTGGc > 1:1366839/1‑140 (MQ=255) gcCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCt > 2:1193280/1‑140 (MQ=255) aGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTtg > 2:1424626/1‑140 (MQ=255) gCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTtgt > 1:1282919/1‑140 (MQ=255) cTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTCTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTtgtg > 1:1860325/1‑140 (MQ=255) tAATCGGTACAACAGCGAAGGTCCCCCCCTTTGGCCG‑GTTGGCCGAGACAAAAAAGGGCGGGGCTCATCTTGTCTTTGTGT‑AATATTGTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGtt < 2:966964/140‑1 (MQ=255) aTCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGtttt > 1:194997/1‑140 (MQ=255) gttaaaaCAGCGAAGCCCACCCCTTTTTCGCT‑TTTGCCCGAGACAAAATAAGGCAGTGCCCCTTCTGTCTGGGTTT‑AATACGTTTTTTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGt < 2:194997/135‑1 (MQ=255) ggTTCAACAGCGAGGGTC‑CCCCCTTTTCCCCGGTTGTCCGCAAAAACATACCGCGGTCCCCTTTCT‑TCTGGGTTTAAATACCGTTTTTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGt < 2:1980700/140‑1 (MQ=255) taaaaCGGCGAAGGCCCCCCCTTTTCCGCC‑GTTGTCCGCGAAAACATACCGCAGTCCCCCTTCTGTCTGGGTTT‑AATATCTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCa < 2:1859463/137‑1 (MQ=255) tCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCAt > 1:536963/1‑140 (MQ=255) tCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCAt > 1:2055940/1‑140 (MQ=255) cAACAGCAAAGGTCCCCCCTTTTTCGCC‑GTTGTCCGCAACAACATACCGCAGTCCCCCTTCTGTCTGGGTGT‑AATAACTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCAtt < 2:849722/140‑1 (MQ=255) cGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATggg > 2:564310/1‑140 (MQ=255) cGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATggg > 2:577028/1‑140 (MQ=255) cGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATggg > 1:1062902/1‑140 (MQ=255) gagggTCACCCTTTTTTCGCC‑GTTGTCC‑CGACAACATACCGCAGTCCCCTTTCTGTCTGGGTGT‑AATATTTTTTTTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGt < 2:2025677/137‑1 (MQ=255) agggccAGCCCTTTTCCGCC‑GTTGTCCGCAACACAAAAGCGGAGTCCCCCTTTTGTTGTGGTAA‑AATATTGTTTTTTTTCCCCCGCCATTAGTAGCGACCGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGt < 2:1366839/135‑1 (MQ=255) aaGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGt > 2:1695582/1‑140 (MQ=255) aaGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGt > 1:1281265/1‑140 (MQ=255) aaGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGt > 1:1502975/1‑140 (MQ=255) aaGGCCACCCCTTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCCCCTTCTGTCTGGGTGT‑AATAATTTTTTTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGt < 2:1682497/140‑1 (MQ=255) ggTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGa < 1:1784937/140‑1 (MQ=255) aGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAgtgt > 1:1037950/1‑140 (MQ=255) ccccTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGc > 1:1683904/1‑140 (MQ=255) ttttCGCC‑GTTGTCCGCGAAAAAATACCGCGGTCCCCTTTCTGTCTGGGTGT‑AATATTTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGAt < 2:2055940/140‑1 (MQ=255) tttCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCGGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATc > 1:1769966/1‑140 (MQ=255) tttCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATc > 2:1492131/1‑140 (MQ=255) tttCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATc > 1:1693984/1‑140 (MQ=255) tttCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATc > 1:613527/1‑140 (MQ=255) cgttccccGCCACAACATAACGCAGTGCCCCTTCTTTCTGGGTGA‑AATAACTTTTGTTTTCCTCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCt < 2:1693984/134‑1 (MQ=255) gTTGTCCGCAACAACATAACGCAGTCCACCTTCTGTCTGGGTGT‑AATAACTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTg < 2:804220/140‑1 (MQ=255) gTTGCCCGCGACAATATATCGATGTCCCCCTTCTGTCTGGGTGA‑TATTGCTTTTGTTTCTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTg < 2:1860325/140‑1 (MQ=255) ccGCAACAACATAACGCGGTCCCCCTTCTGTCTGGGTGA‑AATATCGTTTGTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATg < 2:1282919/140‑1 (MQ=255) cgcgACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGt > 2:763460/1‑140 (MQ=255) aaacaAACCGCGGTCCCCCTTTTGTCTGGGTTT‑AATAACTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTcc < 2:945701/139‑1 (MQ=255) caTAGCGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGa > 1:913490/1‑140 (MQ=255) cGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgcttt > 2:376227/1‑140 (MQ=255) cAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcg > 1:179790/1‑140 (MQ=255) aGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgc > 1:2061931/1‑140 (MQ=255) tGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgctt > 1:1074700/1‑140 (MQ=255) tGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgctt > 2:409356/1‑140 (MQ=255) tGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgctt > 1:1470378/1‑140 (MQ=255) tGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgctt > 2:2066437/1‑140 (MQ=255) cTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTcgcg > 1:289773/1‑140 (MQ=255) tCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGc > 2:1974597/1‑140 (MQ=255) ttctgGGTTT‑AATATCTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCttt < 2:289773/139‑1 (MQ=255) gTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCttt > 2:514639/1‑140 (MQ=255) ggTGT‑AATAACTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGct < 2:173481/140‑1 (MQ=255) ggTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGct > 1:880019/1‑140 (MQ=255) ggTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGct > 2:309188/1‑140 (MQ=255) gtgt‑AATAAGTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGctc < 2:1396149/140‑1 (MQ=255) gtgt‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGctc > 1:158413/1‑140 (MQ=255) gtgt‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGctc > 1:1623596/1‑140 (MQ=255) tgt‑AATAACGTTTTTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGctct < 1:763460/140‑1 (MQ=255) taaagaaCTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTg < 1:1193280/135‑1 (MQ=255) aatatCGTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGc < 2:1208471/140‑1 (MQ=255) aaCGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGcccc < 2:1769966/140‑1 (MQ=255) cGTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTg < 1:309188/140‑1 (MQ=255) tttgtttTTCCCCGCCGTTAGTGGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa > 2:772808/1‑140 (MQ=255) tttgtttTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCGGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa > 1:888063/1‑140 (MQ=255) tttgtttTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCttt < 1:147234/123‑1 (MQ=255) tttgtttTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCttt > 2:147234/1‑123 (MQ=255) tttgtttTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa > 2:1193289/1‑140 (MQ=255) tttgtttTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa > 1:1276320/1‑140 (MQ=255) tttgtttTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa > 1:1769186/1‑140 (MQ=255) tttgtttTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa > 2:2048040/1‑140 (MQ=255) tttgtttTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa > 2:779440/1‑140 (MQ=255) tttgtttTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa > 2:1272119/1‑140 (MQ=255) tttgtttTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa > 2:1277791/1‑140 (MQ=255) tttgtttTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa > 1:1958718/1‑140 (MQ=255) | TTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTTCGCC‑GTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGT‑AATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGA > NC_000913/4111618‑4111883 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |