Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_000913	3,426,985	A→T	noncoding (49/76 nt)	alaU ←	tRNA‑Ala

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_000913	3,426,985	0	A	T	100.0%	54.9 / NA	17	noncoding (49/76 nt)	alaU	tRNA‑Ala
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base T (7/10);  total (7/10)

GATGGTGGAGCTATGCGGGATCGAACCGCAGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCATAACATGTAGTTAAAACCTCTTCAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTT  >  NC_000913/3426956‑3427115                              |                                                                                                                                   acaaatggagccaAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAAtgggatcaacactcatgtgttgataatggtgggccttagtggactcgaaccac                           <  1:192543‑M1/130‑54 (MQ=255) acaaatggagccaAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAAtgggatcaacactcatgtgttgataatggtgggccttagtggactcgaaccac                           >  2:192543‑M1/6‑82 (MQ=255)    aatggagCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAAtgggatcaacactcatgtgttgataatggtgggccttagtggactcgaaccaccgacctca                   <  1:11709‑M1/138‑62 (MQ=255)      ttgagCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAAtgggatcaacactcatgtgttgataatggtgggccttagtggactcgaaccaccgacctcacc                 <  2:1116214‑M1/138‑64 (MQ=255)      tggAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAAtgggatcaacactcatgtgttgataatggtgggccttagtggactcgaaccaccgacctcacc                 <  1:1104791‑M1/140‑64 (MQ=255)      tggAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAAtgggatcaacactcatgtgttgataatggtgggccttagtggactcgaaccaccgacctcacc                 <  2:771158‑M1/140‑64 (MQ=255)      tggAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAAtgggatcaacactcatgtgttgataatggtgggccttagtggactcgaaccaccgacctcacc                 <  2:556350‑M1/140‑64 (MQ=255)         agccaagcgggatCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAAtgggatcaacactcatgtgttgataatggtgggccttagtggactcgaaccaccgacctcaccctt              >  2:378835‑M1/7‑74 (MQ=255)          gccaagcgggaTCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAAtgggatcaacactcatgtgttgataatggtgggccttagtggactcgaaccaccgacctcaccctta             >  1:1058953‑M1/6‑73 (MQ=255)             aagcgGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAAtgggatcaacactcatgtgttgataatggtgggccttagtggactcgaaccaccgacctcacccttatca          <  1:361768‑M1/138‑71 (MQ=255)               gCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAAtgggatcaacactcatgtgttgataatggtgggccttagtggactcgaaccaccgacctcacccttatcagg        >  2:189072‑M1/1‑68 (MQ=255)                cGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAAtgggatcaacactcatgtgttgataatggtgggccttagtggactcgaaccaccgacctcacc                 <  1:987845‑M1/130‑64 (MQ=255)                cGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAAtgggatcaacactcatgtgttgataatggtgggccttagtggactcgaaccaccgacctcacc                 >  2:987845‑M1/1‑67 (MQ=255)                  ggATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAAtgggatcaacactcatgtgttgataatggtgggccttagtggactcgaaccaccgacctcacccttatcaggggt     >  2:878192‑M1/1‑65 (MQ=255)                   gATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAAtgggatcaacactcatgtgttgataatggtgggccttagtggactcgaaccaccgacctcacccttatcaggggtg    >  1:839212‑M1/1‑64 (MQ=255)                     tCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAAtgggatcaacactcatgtgttgataatggtgggccttagtggactcgaaccaccgacctcacccttatcaggggtgcg  <  2:19149‑M1/140‑79 (MQ=255)                     tCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAAtgggatcaacactcatgtgttgataatggtgggccttagtggactcgaaccaccgacctcacccttatcaggggtgcg  <  2:839212‑M1/140‑79 (MQ=255)                              |                                                                                                                                   GATGGTGGAGCTATGCGGGATCGAACCGCAGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCATAACATGTAGTTAAAACCTCTTCAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTT  >  NC_000913/3426956‑3427115

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑