| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,531,057 | T→C | pseudogene (472/1054 nt) | yncI → | putative transposase YncI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,531,057 | 0 | T | C | 98.4% | 232.8 / NA | 61 | pseudogene (472/1054 nt) | yncI | putative transposase YncI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (33/27); minor base A (0/1); total (33/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCATAAGAGGCTCCTTTGATAAGGGAAAAAGAAAAGGAGCAATCCATATGGTGAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGTTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAGCAGATTATCTTCTGGCAGTAAAAGGCAATCAGGGGAAATTAC > NC_000913/1530920‑1531192 | ccATAAGAGGCTCCTTTGATAAGGGAAAAAGAAAAGGAGCAATCCATATGGTGAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTg > 1:394447/1‑140 (MQ=255) cATAAGAGGCTCCTTTGATAAGGGAAAAAGAAAAGGAGCAATCCATATGGTGAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGc < 2:756705/140‑1 (MQ=255) aTAAGAGGCTCCTTTGATAAGGGAAAAAGAAAAGGAGCAATCCATATGGTGAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAgctgct < 1:1257241/140‑1 (MQ=255) tAAGAGGCTCCTTTGATAAGGGAAAAAGAAAAGGAGCAATCCATATGGTGAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAgctgct < 2:371732/139‑1 (MQ=255) tAAGAGGCTCCTTTGATAAGGGAAAAAGAAAAGGAGCAATCCATATGGTGAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAgctgct > 1:371732/1‑139 (MQ=255) gCTCCTTTGATAAGGGAAAAAGAAAAGGAGCAATCCATATGGTGAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGc < 1:1121521/132‑1 (MQ=255) gCTCCTTTGATAAGGGAAAAAGAAAAGGAGCAATCCATATGGTGAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGc > 2:1121521/1‑132 (MQ=255) tCCTTTGATAAGGGAAAAAGAAAAGGAGCAATCCATATGGTGAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTATAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACt > 2:661821/1‑140 (MQ=255) cTTTGATAAGGGAAAAAGAAAAGGAGCAATCCATATGGTGAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGt > 2:1198832/1‑140 (MQ=255) aaaaaGAAAAGGAGCAATCCATATGGTGAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCATGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAAGGAGATTACAGCCATTCCAGAGCGGCTTAACCTACTGTATTTAAAGaaaa > 2:1056544/1‑140 (MQ=255) aaagaaaagGAGCAATCCATATGGTGAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAAt < 2:1426724/140‑1 (MQ=255) aaagGAGCAATCCATATGGTGAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGAt < 2:1495404/140‑1 (MQ=255) agGAGCAATCCATATGGTGAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATaa > 2:194380/1‑140 (MQ=255) aaTCCATATGGTGAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTg < 1:1169986/140‑1 (MQ=255) cATATGGTGAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGc < 1:1198832/140‑1 (MQ=255) ggTGAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATgg > 2:1226236/1‑140 (MQ=255) gTGAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATggg < 1:1560399/140‑1 (MQ=255) gAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCAtt > 1:1467258/1‑127 (MQ=255) gAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCAtt < 2:1467258/127‑1 (MQ=255) gAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCt > 2:909433/1‑140 (MQ=255) gAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCt < 1:670534/140‑1 (MQ=255) aGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATggg > 2:334243/1‑137 (MQ=255) aGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATggg < 1:334243/137‑1 (MQ=255) aGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCt > 2:57455/1‑139 (MQ=255) aGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCt < 1:57455/139‑1 (MQ=255) aGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTg > 2:144590/1‑140 (MQ=255) aGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTg > 2:962404/1‑140 (MQ=255) aGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTg > 2:98577/1‑140 (MQ=255) tGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTc > 1:1346800/1‑140 (MQ=255) cgaacgaaAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGat > 1:186912/1‑140 (MQ=255) gaacgaaAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTATAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGata < 1:661821/140‑1 (MQ=255) aacgaaAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGatat > 1:1179704/1‑140 (MQ=255) cgaaAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCg > 1:52423/1‑140 (MQ=255) tGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGa < 1:194380/140‑1 (MQ=255) gtACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGATTCGAAGATCaa > 2:319979/1‑140 (MQ=255) cTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGa > 1:859696/1‑140 (MQ=255) gggCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATaa > 1:1549562/1‑140 (MQ=255) gggCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATaa > 2:1313194/1‑140 (MQ=255) ggTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGa > 2:237792/1‑132 (MQ=255) ggTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGa < 1:237792/132‑1 (MQ=255) ggTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAg > 1:1374011/1‑140 (MQ=255) ggTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAg < 2:1346800/140‑1 (MQ=255) ggTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAg > 1:9079/1‑140 (MQ=255) ggTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAg > 2:1071695/1‑140 (MQ=255) ggTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAg > 2:206159/1‑140 (MQ=255) ggTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAg > 2:261241/1‑140 (MQ=255) gTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAGc < 1:1226236/140‑1 (MQ=255) gAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAGCAg < 1:1533513/140‑1 (MQ=255) aaGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAGCAGATTAtctt > 2:1215645/1‑140 (MQ=255) aaGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAGCAGATTAtctt > 2:505469/1‑140 (MQ=255) ccAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAGCAGATTATCTTCTg < 2:1396631/140‑1 (MQ=255) cAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGATGCTTAACCTGCTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAGCAGATTATCTTCTgg < 1:1056544/140‑1 (MQ=255) aGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAGCAGATTATCTTCTGGCAGt < 1:206159/140‑1 (MQ=255) aTGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAGCAGATTATCTTCTGGCAGTaaaa > 2:1145624/1‑140 (MQ=255) aTGAGATTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAGCAGATTATCTTCTGGCAGTaaaa > 2:1301804/1‑140 (MQ=255) gagaTTACAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAGCAGATTATCTTCTGGCAGTAAAAgg > 1:191496/1‑140 (MQ=255) aCAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAGCAGATTATCTTCTGGCAGTAAAAGGCAATCa < 1:962404/140‑1 (MQ=255) aCAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAGCAGATTATCTTCTGGCAGTAAAAGGCAATCa < 2:392146/140‑1 (MQ=255) aCAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAGCAGATTATCTTCTGGCAGTAAAAGGCAATCa > 1:1574350/1‑140 (MQ=255) aCAGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAGCAGATTATCTTCTGGCAGTAAAAGGCAATCa < 1:1301804/140‑1 (MQ=255) aGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAGCAGATTATCTTCTGGCAGTAAAAGGCAATCAgg < 2:43845/140‑1 (MQ=255) aGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAGCAGATTATCTTCTGGCAGTAAAAGGCAATCAgg < 1:1145624/140‑1 (MQ=255) aGCCATTCCAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAGCAGATTATCTTCTGGCAGTAAAAGGCAATCAgg < 1:840479/140‑1 (MQ=255) ccAGAGCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAGCAGATTATCTTCTGGCAGTAAAAGGCAATCAGGGGAAAtt < 2:1179704/140‑1 (MQ=255) agagCTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAGCAGATTATCTTCTGGCAGTAAAAGGCAATCAGGGGAAATTAc < 2:1574350/140‑1 (MQ=255) | CCATAAGAGGCTCCTTTGATAAGGGAAAAAGAAAAGGAGCAATCCATATGGTGAGTGCATTCTCGAACGAAAATGGTGTTGTACTGGGGCAGGTGAAAACGGAAGCCAAAAGTAATGAGATTACAGCCATTCCAGAGTTGCTTAACCTACTGTATTTAAAGAAAAATTTGATAACCATTGATGCTATGGGCTGTCAGAAAGATATCGCTTCGAAGATCAAAGATAAAAAAGCAGATTATCTTCTGGCAGTAAAAGGCAATCAGGGGAAATTAC > NC_000913/1530920‑1531192 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |