Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 4,039,467 G→A noncoding (1949/2905 nt) rrlA → 23S ribosomal RNA

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0009134,039,4670GA76.0% 35.3 / 64.0 104noncoding (1949/2905 nt)rrlA23S ribosomal RNA
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (8/17);  new base A (48/31);  total (56/48)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.03e-02
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 109 total aligned reads displayed.

GACGTATACGGTGTGACGCCTGCCCGGTGCCGGAAGGTTAATTGATGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCTGCACGAATGGCGTAATGATGGCCAGGCTGTCTCCACCCGAGACTCAGT  >  NC_000913/4039331‑4039530
                                                                                                                                        |                                                               
gaagTATACGGGCTGACGCCTGCCTGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGTGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGt                                                              <  1:1364813/137‑1 (MQ=2)
gaagTATACGGGCTGACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGt                                                              <  2:2190997/137‑1 (MQ=2)
gaagTATACGGGCTGACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGt                                                              <  1:986803/137‑1 (MQ=2)
gaagTATACGGGCTGACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGt                                                              <  1:523932/137‑1 (MQ=2)
gACGTATACGGTGTGACGCCTGCCCGGTGCCGGAAGGTTAATTGATGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGt                                                              <  2:1757173/140‑1 (MQ=40)
gACGTATACGGTGTGACGCCTGCCCGGTGCCGGAAGGTTAATTGATGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGt                                                              <  1:2045265/140‑1 (MQ=40)
 aagTATACGGGCTGACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGTGGTAACCCGAAGCTGTTAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTa                                                             >  1:1217990/3‑140 (MQ=2)
 aagTATACGGGCTGACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGt                                                              >  2:762878/3‑139 (MQ=2)
 aagTATACGGGCTGACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGt                                                              >  1:1113304/3‑139 (MQ=2)
 aagTATACGGGCTGACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGt                                                              <  2:1113304/137‑1 (MQ=2)
 aagTATACGGGCTGACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGt                                                              <  1:762878/137‑1 (MQ=2)
 aagTATACGGGCTGACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTa                                                             >  2:89270/3‑140 (MQ=2)
 aagTATACGGGCTGACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTa                                                             >  2:1450625/3‑140 (MQ=2)
 aagTATACGGGCTGACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTa                                                             >  1:865777/3‑140 (MQ=2)
  agTATACGGGCTGACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGt                                                              >  1:1028496/2‑138 (MQ=2)
  agTATACGGGCTGACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGt                                                              <  2:1028496/137‑1 (MQ=2)
    tataCGGGCTGACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTaaat                                                          >  2:1282376/1‑138 (MQ=2)
     ataCGGTGTGACGCCTGCCCGGTGCCGGAAGGTTAATTGATGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGtt                                                         >  2:1723098/1‑140 (MQ=40)
     ataCGGTGTGACGCCTGCCCGGTGCCGGAAGGTTAATTGATGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGtt                                                         >  2:1925484/1‑140 (MQ=40)
       acgggctgACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTct                                                       >  2:1048485/7‑139 (MQ=2)
        cgggctgACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCACAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTctg                                                      >  1:492784/6‑138 (MQ=2)
        cGGTGTGACGCCTGCCCGGTGCCGGAAGGTTAATTGATGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCg                                                      <  2:1799575/140‑1 (MQ=40)
         gggctgACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGa                                                     <  2:644731/136‑1 (MQ=2)
           gctgACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGAcc                                                   >  2:128990/3‑140 (MQ=2)
           gctgACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGAcc                                                   <  1:337601/138‑1 (MQ=2)
           gctgACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGAcc                                                   <  1:89270/138‑1 (MQ=2)
            ctgACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTctga                                                     <  2:1123798/136‑4 (MQ=2)
            ctgACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGa                                                     >  1:1123798/2‑137 (MQ=2)
            ctgACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGAccc                                                  >  2:1495522/2‑139 (MQ=2)
            ctgACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGAccc                                                  >  2:754249/2‑139 (MQ=2)
             tgACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGAcccg                                                 <  1:1947803/140‑3 (MQ=2)
             tgACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGAcccg                                                 <  2:1801021/140‑3 (MQ=2)
             tgACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGAcccg                                                 <  2:1091069/140‑3 (MQ=2)
              gACGCCTGCCCGGTGTTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGc                                                >  2:128160/1‑140 (MQ=2)
              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTTAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGc                                                >  2:1087763/1‑140 (MQ=2)
              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCagg                                                               <  1:1324726/125‑1 (MQ=2)
              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCagg                                                               >  2:1324726/1‑125 (MQ=2)
              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGAcc                                                   >  1:1006883/1‑137 (MQ=2)
              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGc                                                >  1:123924/1‑140 (MQ=2)
              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGc                                                >  2:211882/1‑140 (MQ=2)
              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGc                                                >  2:48769/1‑140 (MQ=2)
              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGc                                                >  1:1548572/1‑140 (MQ=2)
              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGc                                                >  2:1208510/1‑140 (MQ=2)
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              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGc                                                >  2:727257/1‑140 (MQ=2)
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              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGc                                                >  2:737343/1‑140 (MQ=2)
              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGc                                                >  2:1274062/1‑140 (MQ=2)
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              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGc                                                >  2:1043810/1‑140 (MQ=2)
              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGc                                                >  1:1335936/1‑140 (MQ=2)
              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGc                                                >  2:1003164/1‑140 (MQ=2)
              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGc                                                >  1:1940612/1‑140 (MQ=2)
              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGc                                                >  2:1067762/1‑140 (MQ=2)
              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGc                                                >  1:358576/1‑140 (MQ=2)
              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGc                                                >  1:894635/1‑140 (MQ=2)
              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGc                                                >  1:1483088/1‑140 (MQ=2)
              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGc                                                >  1:810663/1‑140 (MQ=2)
              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCAGc                                                >  2:1438683/1‑140 (MQ=2)
              gACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACACGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGc                                                >  1:365763/1‑140 (MQ=2)
               aCGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGCa                                               >  1:218764/1‑140 (MQ=2)
               aCGCCTGCCCGGTGCCGGAAGTCTAATTGATGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCCCTTGATCGAAGCCCCGGTAAGCGGCGGCCGTAACTATAACGATCCTTAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGTATAGTTCCGatccgct                                               >  2:2310370/1‑134 (MQ=14)
               aCGCCTGCCCGGTGCCGGAAGGTTAATTGATGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCTGCa                                               >  1:1793538/1‑140 (MQ=40)
                ctccTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGCAc                                              >  1:938435/3‑140 (MQ=2)
                cGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTGAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGCAc                                              >  1:1476284/1‑140 (MQ=2)
                cGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGCAc                                              <  1:1246400/140‑1 (MQ=2)
                cGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGCAc                                              >  2:1118924/1‑140 (MQ=2)
                cGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGCAc                                              >  2:1506967/1‑140 (MQ=2)
                cGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGCAc                                              >  2:2240882/1‑140 (MQ=2)
                 gCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGCACg                                             <  1:1495522/140‑1 (MQ=2)
                  cttGCCGGGTGCCTGAAGGTTAATTGATGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGGAGCGTAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCTGCACGa                                            <  2:2110298/138‑1 (MQ=14)
                  ccTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGCACGa                                            <  2:1630136/140‑1 (MQ=2)
                  ccTGCCCGGTGCCGGAAGGTTAATTGATGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAATCGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCTGCACGa                                            <  2:1584780/140‑1 (MQ=255)
                   cTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGTGGTAACCCGAAGCTGTTAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGCACGaa                                           <  2:1217990/140‑1 (MQ=2)
                   cTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGCACGaa                                           >  1:862917/1‑140 (MQ=2)
                   cTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGCACGaa                                           <  1:184440/140‑1 (MQ=2)
                   cTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGCACGaa                                           <  1:1092688/140‑1 (MQ=2)
                   cTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGCACGaa                                           <  2:810663/140‑1 (MQ=2)
                   cTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTATGACCCGCACGaa                                           <  2:824440/140‑1 (MQ=2)
                   cTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTACTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGCACGaa                                           <  1:1352337/140‑1 (MQ=2)
                   cTGCCCGGTGCCGGAAGGTTAATTGATGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCTGCACGaa                                           <  2:2267229/140‑1 (MQ=40)
                    tGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCCGCACGAAt                                          <  2:1742508/140‑1 (MQ=2)
                    tGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGGGGAGCGGTTAGGGGTAACCCGAAGCTGTGAACCGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCAGGTAAATTCTGACCAGCACGAAt                                          <  1:1438683/140‑1 (MQ=2)
                    tGCCCGGTGCCGGAAGGTTAATTGATGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCTGCACGAAt                                          <  2:2318596/140‑1 (MQ=40)
                        cGGTGCCGGAAGGTTAATTGATGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCTGCACGAATGGCg                                      <  1:1845371/140‑1 (MQ=40)
                        cGGTGCCGGAAGGTTAATTGATGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCTGCACGAATGGCg                                      <  1:1925484/140‑1 (MQ=40)
                           tGCCGGAAGGTTAATTGATGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCTGCACGAATGGCGTaa                                   >  1:1757589/1‑140 (MQ=40)
                           tGCCGGAAGGTTAATTGATGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCTGCACGAATGGCGTaa                                   >  2:2144260/1‑140 (MQ=40)
                            gCCGGAAGGTTAATTGATGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAGGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCTGCACGAATGGCGTAat                                  <  2:2270141/140‑1 (MQ=255)
                             cgggAAGGTTAATTGATGGGGTTAGCGGCAAGGGGAAGATCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTGGCGAAATTCCTTGTGGGGTAAGTTCCGACCTGCGCGAATGGCGTAatg                                 <  2:2277876/138‑1 (MQ=11)
                                 aaGGTTAATTGATGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCTGCACGAATGGCGTAATGATgg                             <  1:2129266/140‑1 (MQ=40)
                                      tAATTGATGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCTGCACGAATGGCGTAATGATGGCCAgg                        <  1:1892846/140‑1 (MQ=40)
                                            aTGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCTGCACGAATGGCGTAATGATGGCCAGGCTGtct                  <  1:1947330/140‑1 (MQ=40)
                                            aTGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCTGCACGAATGGCGTAATGATGGCCAGGCTGtct                  <  2:1793538/140‑1 (MQ=40)
                                            aTGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCTGCACGAATGGCGTAATGATGGCCAGGCTGtct                  <  2:1608026/140‑1 (MQ=40)
                                                      ccGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCTGCACGAATGGCGTAATGATGGCCAGGCTGTCTCCCCCCgaga        <  2:1819538/140‑1 (MQ=25)
                                                        gCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCTGCACGAATGGCGTAATGATGGCCAGGCTGTCTCCACCCGAGACt      >  1:1736038/1‑140 (MQ=33)
                                                           aGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCTGCACGAATGGCGTAATGATGGCCAGGCTGTCTCCACCCGAGACTCAg   >  2:2087191/1‑140 (MQ=31)
                                                            ggCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAGACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCTGCACGAATGGCGTAATGATGGCCAGGCTGTCTCCACCCGAGACTCAGt  <  1:2118960/140‑1 (MQ=11)
                                                                                                                                        |                                                               
GACGTATACGGTGTGACGCCTGCCCGGTGCCGGAAGGTTAATTGATGGGGTTAGCCGCAAGGCGAAGCTCTTGATCGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCTGCACGAATGGCGTAATGATGGCCAGGCTGTCTCCACCCGAGACTCAGT  >  NC_000913/4039331‑4039530

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑